Harm es finalmente rescatado y regresa a Washington donde tendrá que hacer frente a algunos problemas personales. Entretanto Mic se da cuenta de la preocupación de Mac por perder a Harm por lo que decide tomar una decisión que puede suponer su ruptura definitiva con Mac.

Mac decide hablar con el Almirante con el objetivo de alcanzar un destino temporal a bordo del USS, ya que es incapaz de afrontar la situación y las preguntas que han sobrevenido tras su frustrada boda. Por otra parte, Harm, acudir al funeral del padre de Renee, regresa a su vida laboral en el JAG. Una vez incorporado a su puesto de trabajo, Harm descubre que su amigo y antiguo compañero de habitación en la academia naval también ha sido destinado al JAG.

Mac debe afrontar un nuevo caso como miembro del JAG a bordo del USS Guadalcanal. Esta vez, los hechos apuntan a un homicidio por negligencia y Mac deberá procesar a un Mayor que ha sido acusado por el capitán del barco. Sin embargo, y para sorpresa de Mac, Harm llega al buque con el objetivo de defender al acusado y, a su vez, aprovechar para reconciliarse y aclarar los puntos d e su relación con Mac. Sin embargo, ambos quedan tan inmersos en el nuevo caso que apenas les queda tiempo para tratar cuestiones personales.

Por otro lado, la ahijada adolescente del Almirante Chegwidden se escapa de su casa, manteniendo a su padrino totalmente ocupado intentando encontrarla.

Los ciudadanos locales de Indonesia amenazan y hacen guardia ante el consulado de los EE.UU. ya que la custodia de un marine acusado de violación ha sido otorgada a su comandante por parte de la policía local. Por tanto, durante el tiempo que permanecen en el Consulado, todos corren un grave peligro. Sin embargo, tras el asesinato del comandante y el atentado con la explosión de un artefacto que deja ciego al siguiente mando encargado del caso, la situación se complica y será Jag quién deba afrontar llevar la custodia del Marine, tarea que le llevará incluso a realizar una evacuación de emergencia del consulado.

Harm se hace cargo de un nuevo caso. Esta vez alguien está cometiendo varios asesinatos dentro de un centro de seguridad naval y entre las víctimas mortales se encuentra un buen amigo suyo. Sin embargo, Harm verá obstaculizada su labor como investigador por el servicio de inteligencia. A su vez, Reene le comunicará una noticia que dejará a Harm totalmente sorprendido.

Mientras, Mac se centra en buscar a la pequeña que les ayudó a escapar del edificio del consulado en Indonesia.

Harm mientras defiende a un amigo tras ser este acusado de fraternizar con un oficial que se encuentra bajo su cadena de mando descubre que ha vendido secretos de las acciones militares. Harm ante esta situación tendrá que tomar una decisión entre hacer lo correcto y poner en peligro su carrera profesional dentro del JAG, o callarse. Mientras, se involucra en el caso de una Teniente joven que quiere recuperar la custodia de su hija pequeña.

El equipo de un soldado acusado y llevado a juicio por sobrepasarse en sus órdenes, son sorprendidos en un emboscada. Gran parte del equipo de JAG deberá tomar parte en este caso de investigación y acción judicial.

Todo el personal que trabaja para el JAG deciden competir en una misma carrera. A su vez, Harm y Mac deberán afrontar un nuevo caso. Esta vez se trata del juicio al que es sometido un hombre que suplantó la personalidad de un oficial de alto rango.

Dos pilotos chinos mueren después de que su avión de combate colisione con otro. La marina de EEUU queda acusada por parte del gobierno chino de este incidente. Los oficiales chinos creen que los aviones espías de los EEUU invadieron el espacio aéreo de China y causaron la muerte a los pilotos. Ante esta situación un avión norteamericano y su tripulación quedan secuestrados como rehenes por parte de agentes especiales chinos.

Un piloto que ha abierto fuego sin consentimiento de un superior contra la base militar china. Su objetivo era volar el avión de la marina de los EEUU para que los espías chino no pudiesen quedarse con la nave. Harm deberá defender a este piloto.

Una oficial es acusada de robo en los días festivos de Navidad, en los que no debía trabajar. Harm deberá hacerse cargo de este nuevo caso, y defender a la mujer.

Una mujer tras ser enviada a una nueva misión, en la que debía desmantelar el sistema de armas nucleares rusas, es asesinada. Harm deberá descubrir que ocurrió en el portaaviones donde apareció la oficial muerta.

Harm se encarga de un nuevo caso, esta vez debe defender a un Seal de la marina. El hombre está acusado de desobedecer las órdenes de su superior y poner la vida de todo su equipo en peligro, para rescatar el cuerpo de otro Seal.

Bud aprenderá otra lección sobre ser abogado cuando tiene que formar parte del jurado de un caso en el que Harm es el abogado defensor y Mac la fiscal

Una oficial del ejército estadounidense es llevada a juicio por no acatar las reglas de conducta orientales que la obligan a cubrirse.

Bud está en un juicio por abandono del deber cuando una investigación sugiere que él no ha realizado una defensa competente para con su cliente.

Harm defenderá a un hombre acusado de causar un peligroso incendio a bordo de un portaaviones. Mientras tanto el Almirante Chegwidden decide actuar cuando el ganador de una medalla al Honor es excluido de un acto nacional.

Cuando Harm y Mac son llamados a investigar una emboscada sucedida durante una operación de los Seal en Afghanistan, Harm acusará a un reportero de televisión, que acompañaba a los Seals durante su misión, de desobedecer órdenes causando el fallo de la operación.

Un superviviente de la explosión que tuvo lugar en 1944 en el Puerto de Chicago le pide al Secretario de Marina que limpie los cargos de su informe de servicio y los de sus compañeros.

Harm y Mac procesarán a un sospechoso de pertenecer a la organización terrorista de Al-Queda en un tribunal militar estadounidense.

Harm debe defender a un juez naval acusado de homicidio involuntario tras forzar a una mujer y su bebe a salir de la carretera por la que circulaban.

Harm y Mac viajan a Afghanistan para investigar un accidente con víctimas civiles y continuarán la búsqueda de los terroristas de al-Qaeda que planean un atentado contra la marina estadounidense.

Un oficial ruso unirá sus fuerzas con un terrorista de al-Qaeda para lanzar un ataque contra los Estados Unidos.