תום סויר לא אוהב את בית הספר ובורח ליער כדי לתפוס חזיר בר עם חברו האק. ניסיונותיהם למכור את החזיר בנמל מסתיימים במהומה על סירת הקיטור.

תום נחרד כשדודה פולי אומרת לו שהוא חייב לבלות את היום בצביעת הגדר. תום משכנע את חבריו להצטרף לעבודה ועד מהרה יש לו את כל העזרה הנחוצה לו.

תום הולך לנמל לפגוש את בת-דודתו מרי, ורואה את בקי טאצ'ר בפעם הראשונה. משפחתה עוברת לגור בסנט פטרסבורג ותום מתאהב.

תום מנסה לעורר את תשומת לבה של בקי בבית הספר של יום ראשון, אך היא מתעלמת ממנו. באותו לילה סם הזקן מראה לו קסם מיוחד להגשים משאלות.

תום מגיע לבית הספר באיחור ומגלה שבקי נמצאת בכיתתו. לבסוף הוא מצליח להתיידד איתה ומבטיח לבקר - ושוכח הבטחה נוספת שהבטיח להאק.

תום עובד עם האק ואומר לבקי שהוא עסוק בסיוע לדודתו החולה. בקי מגלה את שקרו אך כעסה מוחלף בהפתעה כשהיא רואה את בית העץ החדש של האק.

תום לא מסתדר עם בן כיתתו החדש אלפרד, ומאתגר אותו לקרב. בדרך הביתה, הסירה שלהם שוקעת ותום מציל את אלפרד, שלא יכול לשחות - וזוכה לשבחים.

ספינת קיטור גדולה מגיעה לסנט פטרסבורג. תום והאק מתגנבים אל הסיפון לטיול. למחרת תום מתגאה בהרפתקה שלהם, ומרתק את חבריו לכיתה.

הדודה פולי חולה ועולה בראשה רעיון. היא קוראת לתום ומעמידה פני גוססת. היא מספרת לו שהיא לא תוכל ללכת לגן-עדן אלא אם כן יבטיח להיות ילד טוב.

תושבי הכפר אינם אוהבים את מאף השיכור ואת ג'ו האינדיאני. תום והאק מצילים את מאף והוא, בתמורה, מספר להם על אוצר שנקבר ליד סנט פטרסבורג.

מר דובינס לא סומך על תום, אך סיד מציל אותו מעונש. מאוחר יותר, תום והאק מחליטים לערוך את חיפוש האוצר שלהם בלילה, כדי להימנע מג'ו האינדיאני.

תום נותן לבקי נשיקת אירוסין. אך מעידת לשון חושפת שהוא היה מאורס פעם לאיימי. בקי זועמת, ותום מתייאש כל כך שהוא מסיים את ציד האוצרות שלו.

אחרי שבקי מתעלמת מתום במשך חמישה ימים, הוא מחליט לברוח מהבית כדי להיות שודד ים. בלילה הוא מפליג לאי ג'קסון על רפסודה, יחד עם האק ובן.

תום, האק ובן נהנים מההרפתקה שלהם על האי בזמן שכולם דואגים לשלומם לאחר שסופת גשם שוטפת את הרפסודה שלהם ונמצאת כשהיא שבורה לרסיסים.

תושבי הכפר מאמינים שהנערים טבעו בנהר. למרות שהם משחקים כל היום, בן מתגעגע לביתו. תום חוזר בחשאי לכפר ורואה את דודתו פולי מתפללת לשלומו.

בן והאק מתגעגעים לכפר ולכן תום מציע להם לחזור ממש ביום ההלוויה שלהם. שום ילדים בכפר, כך קובע תום, מעולם לא הפכו למוקד של תשומת לב כה רבה.

תום הוא גיבור וכולם רוצים לשמוע את סיפורו. צ'רלי מצייר על ספר הלימוד של תום ותום נענש. בקי ראתה מה קרה ומרגישה אשמה שלא אמרה את האמת.

בקי קורעת בטעות דף מספר מדע הרפואה יקר הערך של מר דובינס. וכשתום לוקח על עצמו את האשמה, בקי מחליטה להשלים איתו.

תחרות קפיצות צפרדעים פופולריים בבית הספר ותום מאמן את הצפרדע שלו. צ'רלי לא רוצה לוותר על תואר האלוף וממלא את הצפרדע של תום בחלוקי נחל.

תום מגלה כי מר דוביננס חובש פאה. ביום האחרון ללימודים, כשהמורה מצליף בכל התלמידים, אפילו בבנות, מכיוון שישנו במהלך השיעור, תום חושב על נקמה.

סיד נדבק בחזרת בדיוק כשחופשת הקיץ מתחילה ותום לא רוצה לחלות ממנו. בדיוק אז שני גברים מגיעים לעיר עם "מי החיים" המבטחים לרפא כל מחלה.

תום מחלק פרסומות בתמורה לתרופה שנמכרת בהצלחה, אך מתגלה כשקר גמור. תום לא נדבק בחזרת, אבל הוא מבקר בשירותים לעיתים תכופות.

תום הולך לדוג עם האק ובקי. הם תופסים אחד גדול, אבל רק אחרי שבקי קופצת להושיט יד.

דודה של בקי מחליטה לאמץ את האק. תום גורם לו להתרחץ ומלביש אותו יפה. האק לא אוהב שום דבר שנקשר, כולל עניבה, ודוחה את ההצעה.

אלפרד משתפר בשחייה כדי לאתגר את תום למרוץ בו הוא מנצח. תום מאתגר את אלפרד לתחרות כדי לראות מי יכול להישאר הכי הרבה מתחת למים.

ילדי הכפר משועממים; שום דבר מרגש לא קורה שם. ואז מגיעה להקת תיאטרון ומכריזה על הצגה לילדים. ביניהם שחקנית צעירה ליסט, והאק מתאהב.

תום מבטיח לקחת את האק להצגה ועובד אצל דודתו בשביל הכסף. כשגלגל נופל מהעגלה, תום כמעט מובס - אבל מצליח לרוץ הביתה בדיוק בזמן ההצגה.

האק קופץ לבמה כדי להציל את ליזט. תום מעורר את הילדים לעזור להאק וליזט, וההצגה הופכת לפיאסקו. ליזט דווקא אוהבת את האק, ומבטיחה לבקר.

האק מכין ארוחה טעימה לביקורה הבא של ליזט. פתאום שניים מהחיילים עורקים והקבוצה חייבת לעזוב. ליזט אומרת לתום שהיא תחזור לראות את האק.

תום מגלה גופה מתה במעלה הנהר - נראה שזה אביו של האק! לאחר ההלוויה, אביו של האק נראה חי; בא לקחת את בנו. האק לא רוצה ללכת ומתחבא.

ביום השנה למות אמו של האק, הוא רוצה להדליק נר לזכרה. למרות שהוא יודע שדודה פולי לא מרשה זאת, תום מבטיח להביא להאק את הפמוט הכסוף שלה.

כאשר תום והאק מוצאים גוש זהב קטן בנהר, החדשות מתפשטות במהירות וכל תושבי הכפר ממהרים לנהר לחפש זהב. אפילו הדודה פולי מנסה להצטרף.

מרי מתחילה לעבוד אצל ד"ר מיטשל, מתאמן לאחות. בלון יורד בכפר, והאנשים נבהלים וחושבים שזה מפלצת. תום, שיודע מה זה, מושיט יד לארתור הטייס.

ארתור פוגש את מרי אצל ד"ר במשרדו של מיטשל, והיא מזמינה אותו לארוחת ערב. תום מוקסם מסיפורי הטיסה בכדור פורח ונחוש לרכוב.

ארתור מחליט להטיס את הכדור הפורח בעזרת הילדים לפני שהצבא יבוא לקחת אותו. אבל השריף חושד בו ומתערב. הילדים מאוכזבים, אך תום לא מוותר.

תום מנסה לטוס בכדור הפורח עם האק. ארתור קופץ עליו בדיוק כשהכדור ממריא, והם נהנים מהנוף מהשמיים. עד מהרה הצבא מגיע וארתור עוזב את הכפר.

בדרכם לבית רדוף אמצע הלילה, תום והאק עדים לרצח. ג'ו האינדיאני הורג את ד"ר רובינסון ומטיל את האשמה על מאף. תום והאק נשבעים לשמור על הסוד.

מאף נעצר על הרצח, בדיוק כפי שתכנן ג'ו האינדיאני. תום והאק מזדהים עם מאף ושלחים אוכל וסיגריות, אך שומרים על שתיקתם. תום מוטרד מסיוטים.

תום והאק סובלים מנקיפות מצפון ומחליטים לומר את האמת. ג'ו האינדיאני מגיע למשפט בביטחון, אך עדותו של תום מסכלת את תוכניתו. ג'ו מסתלק ומאף מוכרז כלא אשם.

השריף מזמין בלש מסנט לואיס למצוא את ג'ו האינדיאני, אך ללא הצלחה, אולם הוא בטוח שג'ו ינסה לנקום. הבלש עוקב אחרי תום בתקווה למצוא את ג'ו.

הדודה פולי מבקשת מתום לבקר את הדודה סאלי. תום שמח ללכת מכיוון שגם בקי נוסעת והטיול ירחיק אותו מג'ו האינדיאני. להפתעתו, האק מתגנב לספינה.

תום והאק מגיעים לחווה של הדודה סאלי בבטחה ומעבירים את הניירות. תום מציג את האק כאחיו סיד. תוך כדי רכיבה הם מרגלים אחר סוס לבן.

תום והאק מבלים בחווה. כשידי החווה מחליטים לתפוס את הסוס הלבן בשם ברק, הבנים הולכים יחד. הסוס נלכד לבסוף, אך תום מרגיש שהם פגעו בגאווה של ברק.

בני מגלה שהאק אינו אחיו של תום, אך מציע לשמור את סודם בתמורה לעזרה. החוואים מנסים לאלף את ברק, אך האינדיאנים אומרים שעליהם לשחרר את הסוס.

תום מתגנב לבית הרדוף עם האק. שם הם מגלים שג'ו האינדיאני חזר לכפר. במקרה, ג'ו וחברו מוצאים קופסת מטבעות זהב. תום מודיע לשריף, אך לא מאמינים לו.

כל הילדים יוצאים לפיקניק למעט סיד, שמצטנן, והאק. תום ובקי הולכים לאיבוד במערה. בעודו מנסה למצוא את הדרך החוצה, תום רואה את ג'ו האינדיאני נכנס.

משלחת חיפוש מתגבשת כדי למצוא את תום ובקי. ג'ו האינדיאני ניגש לתום ומפחיד אותו, אך לא מזיק. נרדף על ידי השריף, ג'ו נופל לתוך ערוץ ופוגש את סופו.

השופט מחלק את הזהב בין תום להאק. גברת דאגלס נבחרת כאפוטרופוס של האק והוא מתחיל חיים חדשים תחת משמעת קפדנית כששנת לימודים מתחילה.