Das Marburg-Virus hat offenbar seinen Lauf genommen. Einige Monate nach dem Tod seiner Frau und einem Nervenzusammenbruch kehrt Frank zum FBI zurück und untersucht mit einem neuen Partner einen Flugzeugabsturz.

Frank und Emma untersuchen eine Familie von identischen Frauen, die offenbar umgebracht werden.

Frank und Emma untersuchen eine Gruppe von Überlebenskünstlern, die sich wegen des Jahr-2000-Problems Sorgen machen.

Emma wird von den Erinnerungen an den Tod ihrer Schwester heimgesucht, während sie und Frank einen Amokläufer jagen.

Frank und Emma untersuchen die Morde am Set eines Films, der auf einem von Franks früheren Fällen basiert.

Frank und Emma untersuchen ein Massengrab, das möglicherweise mit der Millennium-Gruppe in Verbindung steht.

Das Verschwinden eines Kindes veranlasst eine Stadt, einen kürzlich entlassenen Sexualstraftäter zu beschuldigen. Frank und Emma kommen um die Wahrheit herauszufinden.

Emma versucht ihrer drogenabhängigen Schwester zu helfen und erfährt, dass die Süchtigen in der Gegend seltsame Mutationen aufweisen, welche mit verdorbenem Heroin zusammenhängen.

An Weihnachten machen Frank und Jordan einen Urlaub in Vermont. Unerwartet werden sie mit einem vermeintlich toten Mafia-Killer konfrontiert, der mit einer Reihe mysteriöser Frauen in den Wäldern zu leben scheint.

Frank und Emma untersuchen eine Reihe von scheinbaren Ertrinkungsfällen, die sich auf dem Festland ereignet haben.

Peters Tochter wird von einem Golfkriegsveteranen entführt, der die Millennium-Gruppe dazu zwingen will, ihre Verbrechen zuzugeben. Frank und Emma versuchen zu helfen aber Peter scheint entschlossen, die Geheimnisse der Gruppe nicht zu verraten.

Frank erhält eine mysteriöse Kassette mit weißem Rauschen und einen Besuch aus dem Jenseits.

Lucy Butler kehrt zurück, um Frank zu quälen. Diesmal ist sie das Kindermädchen eines mächtigen Politikers aus Wisconsin.

Frank und Emma untersuchen den Selbstmord eines ehemaligen FBI-Agenten und entdecken Verbindungen zwischen dem FBI, der Millennium-Gruppe und dem Kernforschungszentrum Los Alamos.

Eine fundamentalistische jüdische Sekte entführt eine schwangere Frau in der Hoffnung, ein reines Kind für die Priesterschaft aufzuziehen und die Ankunft des Messias zu erzwingen.

Als eine neue Familie in die Stadt zieht, hat Jordan das unangenehme Gefühl, dass der Teufel in der Nähe ist.

Frank und Emma versuchen ein Mädchen ausfindig zu machen, das aus einer psychiatrischen Anstalt ausgebrochen ist, während dessen wird Emmas Vater krank.

Emma und Frank untersuchen die geheimnisvollen biologischen Forschungen eines ehemaligen Mitglieds der Millennium-Gruppe, das an einer rätselhaften Krankheit stirbt.

Frank erhält eine Reihe von Polaroidfotos, die das Gesicht eines Ertrinkungsopfers zeigen. Das Gesicht ist sein eigenes.

Frank und Emma untersuchen einen Mord in einer Kleinstadt, in der Emma einen Teil ihrer Jugend verbracht hat.

Während Emma der Millennium-Gruppe näher kommt untersucht Frank eine Reihe von Morden, die sich auf einen Serienmörderfall aus seiner Vergangenheit beziehen.

Während Emma sich der Millennium-Gruppe anschließt wird Frank für den Tod eines Mannes verantwortlich gemacht.