לאחר פיצוץ הג'יפ, יום הולדתו ה-16 של ג'ון גורם לו להתעמת עם העובדה שהוא נועד להיות לבד. בינתיים, לאחר הטבח של קרומרטי, הסוכן אליסון צריך להתמודד מול הבולשת וגם עם אמונתו.

שרה וקמרון חוקרות תחנת כוח גרעינית; ג'ון מתלהב לא מתלהב מהחיים באקדמיה אך פורח חברתית בעזרת חבר חדש; קתרין ויבר משיגה עוד פיסת פאזל לפרויקט המחמד שלה.

דרק ושרה חייבים להערים על קרומרטי לאחר שחטף את אשתו של צ'רלי, ועליהם לשקול את ההשלכות הצלתה. בינתיים, ג'ון מוצא את עצמו כשהוא נאלץ לבחור בין קמרון לריילי.

תקלה בתוכנה גורמת לקמרון לשכוח מי היא. היא מתגלגלת לבית מעבר בו קמרון פוגשת עובדת סוציאלית שמגלה כמה מהזיכרונות הרחוקים של קמרון. בינתיים, קתרין וויבר נפגשת עם הסוכן אליסון כדי לדון בעתידו בחברת זיירה קורפ.

ג'ון ודרק מסתננים לאקדמיה צבאית כדי להגן על חבר אינטגרלי בהתנגדות העתידית. בינתיים, המשימה הראשונה שוויבר קיבל מאליסון מקבלת תפנית מעניינת כשהוא מגלה רוח רפאים מעברו הפרטי.

מדוע T-1001 יצטרך אי פעם לבקר אצל רופא? שרה, ג'ון וקמרון מקווים לגלות זאת כשהם עוקבים אחר שם נוסף ברשימה שלהם. בינתיים, אישה שדרק הכיר בעבר מפתיעה אותו כשהיא מופיעה בהווה.

הקונורים מוצאים עצמם בכוננות גבוהה ובחברה מוזרה לאחר שנשדד ביתם. "מחסל" מטיל אימה על אליסון ואילו אחד אחר מתקרב בצורה מסוכנת לג'ון קונור. דרק וג'סי ממשיכים להיפתח מחדש.

שרה מגלה שהחלומות המוזרים שעברו בזמן שהיא ישנה מתחילים אט אט להתגנב לחייה האמיתיים, אך אין לה מושג מה המשמעות של החלומות עבורה ועבור ג'ון. דרק וג'סי חוקרים חסיד מזימות של סקיינט.

העיסוק של שרה בשלוש הנקודות לוקח אותה למקום שלדעתה בו מוחזק הטורקי של אנדי גוד. בינתיים, התוכניות של ג'סי מסתבכות ו-וויבר עורכת היכרות חשובה.

קמרון מגלה כי "מחסל" נשלח בטעות לשנות ה-20 של לוס אנג'לס והיא מנסה לברר מה קרה לו. בינתיים, ג'ון נתקל בקבוצת פאנקיסטים בזמן שהוא לוקח את ריילי הביתה ממסיבה.

"מחסלים" רודפים אחר משפחה שבתם שטרם נולדה ממלאת תפקיד חשוב במלחמה נגד המכונות. שרה, קמרון ודרק יוצאים מגדרם כדי לנסות להגן עליהם.

שרה פונה לוועידת עב"מים כדי לקבל תשובות על "שלוש הנקודות". נחשפים פרטים נוספים על המשימה של ריילי, ואליסון מתחילה לעבוד עם אב הטיפוס של קתרין וויבר, ג'ון הנרי.

בעודה נלחמת כדי להישאר בחיים, שרה מונחית על ידי דמות אביו של ג'ון. במקביל, לניסיון של ויבר להגן על ג'ון הנרי יש השלכות קטלניות.

הקונורים מבקרים בעיר הקשורה למפעל ההרוס; ויבר שולחת אדם לעיר בחיפוש אחר ניצולים.

כשהיא רדופה ע"י סיוטים על האיש שהרגה במפעל, שרה בודקת מרפאת שינה. כשדברים חשודים מתחילים להתרחש, שרה חושדת שסקיינט עשויה להשתמש במתקן למיפוי מוח.

התקלות של קמרון מתעוררות מחדש - מה שמביא לתוצאות מצערות לכולם. ריילי חוששת שקמרון גילה את סודה.

לג'סי יש פלאשבק למשימה על סיפונה של הצוללת שלה, ג'ימי קרטר. ג'ון ושרה מתכננים לעזוב את ביתם.

משימת הצוללות של ג'סי בעתיד מקבלת תפנית קטלנית עם השלכות בלתי צפויות בהווה עבור ג'ון, שרה ודרק; קמרון הופכת לנטל ושרה חייבת להתמודד איתה; ג'ון מקבל החלטה של ​​חיים או מוות.

שרה, שחוששת מחייה, מסתירה את ג'ון בבית בטוח עם האדם היחיד שהיא מרגישה שהיא יכולה לסמוך עליו; קמרון ודרק נאבקים לעבוד יחד לאחר שהיא חושפת סוד גדול.

כשג'ון מנסה להציל את היעד האחרון של סקיניט הוא מוצא את עצמו מתביית על וויבר, אבל באיזה מחיר? תכניות המשחק משתנות, וגורמות לשרה ואליסון להתאחד. בינתיים וויבר מגלה את סודותיו של אליסון.

הגורל משתנה לנצח בפרק סיום העונה המתפרץ! הקונורס מגיעים פנים אל פנים עם וויבר בעימות שמטלטל את ג'ון עד היסוד ומשנה את מציאותו. שום דבר לא יהיה אותו דבר.