Con l'aiuto dei Freelancer, Kiera deve impedire all'Alec tornato indietro nel tempo di alterare la storia nel suo tentativo di salvare Emily.

Con due Alec in un'unica linea temporale, l'unica rimasta Kiera si trova di fronte a un grosso problema, dato che la linea temporale cambia di continuo.

Nel tentativo di alterare drasticamente il futuro e impedire alle multinazionali di ottenere il controllo, Liber8 inizia a rapinare alcune banche usando dirigenti aziendali telecomandati.

Kiera e Carlos indagano sulla morte di tre ragazzi uccisi nel corso di una protesta studentesca a sostegno di Liber8. Nel frattempo Alec trova un alleato particolare.

Nel Futuro Travis è catturato dal CPS e sembra sia stato tradito dalla madre dei suoi figli e la sua giovane figlia. I Liber8 fanno irruzione in una stazione televisiva prendendo in ostaggio diverse persone, tra cui l'ispettore Dillon. Nel frattempo l'accordo tra Kelloc e Alec va in pezzi.

Kiera rimane con una scelta difficile, quando i Freelance la informano che deve fare una scelta riguardo alla situazione di Alec. Ma quando Liber8 effettua un'incursione su un impianto chimico della Evergreen, Kiera scopre che Liber8 potrebbe aver intenzione di usare la sostanza chimica per creare un'arma biologica simile a quella che l'ha infettata nel 2066.

Viene mostrato uno scorcio del passato di Kiera (nel 2076) e di come lei sia stata costretta a cooperare con un prigioniero. Nel frattempo Alec indaga sull'omicidio dell'altra Kiera.

Keira e Carlos indagano sull'attentato agli uffici della Fermitas, dove 12 persone sono rimaste asfissiate dal gas nervino. Intanto Julian rivela alcuni scottanti segreti industriali.

Kiera indaga su alcuni ragazzi che utilizzano tecnologie all'avanguardia per commettere reati. Intanto un uomo del 2077 si risveglia dal coma ricordando solo il nome della Protettrice.

Il rapporto tra Kiera e John Doe crea molte tensioni nella relazione fra la Protettrice e i Freelancer. Nel frattempo Alec finalizza la sua nuova invenzione destinata a cambiare il mondo.

Le vite di Kiera e John Doe sono messe in pericolo da un attacco diretto di Liber8. Intanto Alec si rende conto che la sua nuova invenzione è la causa dello strano comportamento di Jason.

Kiera è costretta ad allearsi coi Liber8 per fermare Alec, ormai a un passo dall'avviare la sua nuova e pericolosa tecnologia. Intanto Kellog è pronto a fare la sua mossa a sorpresa.