L'histoire se passe il y a dix ans. C'est à cette époque que son apparus les Mushis : de mystérieux parasites qui choisissent un humain comme hôte pour dévorer leurs rêves en lui offrant, en contre partie, des pouvoirs surnaturels. Ces humains sont appelés Mushitsuki.

Cependant, afin de cacher leur existence à l'humanité, un bureau Spécial de Préservation de l'Environnement : la SEPB, a été créé par le gouvernement. Pour y parvenir, ils emploient ces Mushitsuki dans le but de capturer ceux qui seraient capables de confirmer les rumeurs au sujet des Mushis. Ainsi, si le mushitsuki tente de fuir, la capture se conclut par la destruction du Mushi qui l'habite... mais celui-ci perd tout ses souvenirs, ses rêves et ses émotions.

Daisuke, aussi connut sous le nom de Kakkou, est l'un des meilleurs de la SEPB. Il a souvent fait face lors de ses missions au groupe Mushibane. Ces derniers sont des Mushitsukis, résistants du Gouvernement. Ils tentent d'aider les hôtes que la SEPB convoite.

Mais un jour, Daisuke rencontre Shiika, une jolie jeune fille. Elle avait le même rêve que lui, mais il apprend qu'il y a de cela quatre année, il détruisit le Mushi qui l'habitait...