机器恐龙、森林派、和恐怖派在一场生死战中遗弃了他们的伙伴----变形金刚。那神秘的“至尊太君”到底是谁？又有什么东西能阻止拖泥派（Tornedron）清除银河系呢?

The evil Primacron plans to use an energy being named Tornadron to defeat the Transformers and help in his universal conquest. Meanwhile, the animal form Transformers leave during a battle between Autobots and Decepticons upon getting a strange signal. The signal was apparently sent by Primacron's own assistant, who believes this group of ""Primitives"" can defeat Primacron.

Au cours d'une bataille, tous les Transformers "primitifs" sont appelés par une même voix et se rassemblent sur une planète, menés par Sky Linx et Trypticon. Une créature énergétique a lâchée dans l’espace, et elle absorbe l'énergie vitale de tous les Transformers les uns après les autres. Son créateur, Primacron, est aussi l’inventeur d'Unicron, et son assistant croit que seuls les instincts de tous ces Transformers primitifs réunis peuvent vaincre l'intelligence de Primacron. Tous sont battus, sauf Grimlock, enseveli, qui arrête finalement la créature énergétique en renversant son processus de création... et en démolissant le laboratoire de Primacron.