Rex, Cody y la Fuerza Clon 99, un escuadrón de élite poco ortodoxo, también conocido como el Lote Malo, buscan recuperar el algoritmo estratégico de la República del Almirante Trench. Pero una verdad inquietante espera…

Creyendo que el soldado desaparecido en acción llamado Echo todavía puede estar vivo, la misión de Rex dobla su importancia. Junto con el Bad Batch y Anakin Skywalker, el capitán clon emprende una peligrosa misión de rescate encubierta...

Con Echo rescatado, Rex, el Bad Batch, y Anakin Skywalker tratan de escapar de una base separatista.

La República planea un audaz golpe final contra Wat Tambor y el Almirante Trench, por lo que una vez más Rex, Echo, el Bad Batch y Anakin Skywalker se reúnen.

Ahsoka se hace amiga de una piloto, pero debe ocultar su pasado Jedi mientras intenta detener a un peligroso droide.

Trace toma una decisión precipitada después de enterarse de que lo que están transportando es para el Sindicato Pyke.

Después de ser encarcelados por los Pykes, Ahsoka Tano y las hermanas Martez logran escapar audazmente de su fortaleza. Juntos, huyen a través de la ciudad hacia su barco, desesperados por evadir a las fuerzas de Pyke en busca de "Deuda peligrosa".

Ahsoka negocia por la libertad de las hermanas y hace un sorprendente descubrimiento.

Anakin y Obi-Wan deben decidir si ayudar a Ahsoka a perseguir a Maul o rescatar a Palpatine.

Ahsoka lidera a los clones de la República para enfrentarse a las fuerzas de Maul en Mandalore, mientras que Maul siente el inminente caos y realiza una jugada calculada para garantizar su propia supervivencia.

Tras capturar a Maul en Mandalore, el viaje de Ahsoka hacia el Consejo Jedi se interrumpe cuando se declara la Orden 66, poniendo su mundo de cabeza.

Ahsoka y Rex deben usar su ingenio y habilidades para sobrevivir al turbulento final de las Guerras Clon.