Rozhovory medzi ľuďmi Mon Calamari a spoluobyvateľmi podmorského sveta, Quarrenmi, sa skončia po tom, ako je zavraždený kráľ Mon Cala. Republika vysiela Padmé Amidalu a Anakina, aby zastavili občiansku vojnu, avšak Quarrenov už zastrešujú separatisti...

Anakin a zvyšok jeho tímu Jediov je prečíslený prekvapivým separatistickým útokom, vedeným Riffom Tamsonom, zatiaľ čo sa prin Lee-Char a Ahsoka musia vyhnúť zajatia. Yoda nevie poskytnúť iac Republikovej pomoci a preto sa obracia na Gunganskú Veľkú Armádu...

Republikové a Gunganské sily padli do zajatia Rffa Tamsona a jeho Karkarodonských jednotiek. Ostáva už len na Ahsoke a princovi Lee-Charovi, aby zjednotili ľud Mon Caly...

Jar Jar musí konať v mene Bossa Lyonie a odvrátiť povstanie jeho ľudí proti Naboo...

Misia na záchranu planéty Aleen a jej ľudí je spustená droidmi...

C-3PO a R2-D2 narážajú na nebezpečenstvo na každom kroku, keď navštívia dva nepriateľské svety a narazia na pirátov...

Klony sú na smrteľnej misii obsadiť Umbarské hlavné mesto pod dočasným velením Ponga Krella...

Generál Krell prikáže kapitánovi Rexovi a jeho klonom z 501. légie dobyť ťažko opevnenú Umbarskú leteckú základňu a neočakáva nič iné, ako víťazstvo...

Po tom, ako Republika dobije leteckú základňu, rozkáže generál Krell Rexovi a jeho mužom vyraziť na ťažko chránené hlavné mesto Umbary. Niektoré klony si uvedomia, že existuje aj lepší plán a rozhodnú sa rozkaz neuposlúchnuť...

Kapitán Rex je nútený postaviť sa svojmu agresívnemu veliteľovi Krellovi po tom, čo dvaja jeho muži čelia poprave za neuposlúchnutie rozkazov pri boji o Umbaru. Riskujúc obvinenie zo vzbury musí Rex urobiť temné rozhodnutie, zatiaľ čo sa ukáže prvá tvár nepriateľa...

Anakin, Obi-Wan a Ahsoka sa infiltrujú k otrokárom na Zygerrii, aby našli stratených kolonistov. Anakin bojuje so svojimi emóciami, zatiaľ čo ho prefíkaná Zygerrianská kráľovná núti vykonať pochybné úlohy, aby misiu splnil...

Anakin sa snaží presvedčiť Zygerrianskú kráľovnú, že aj ona je len otrokom v temnom separatistickom sprisahaní. Medzičasom je Obi-Wan v pasci v tábore otrokov a vôbec to s ním nevyzerá dobre...

Mierové rozhovory medzi Republikou a separatistami sú prerušené Luxom Bonterim, ktorý obvinil grófa Dookua z vraždy jeho matky. Zachránení zo separatistického väzenia Ahsokou ju Bonteri zasvätí do svojho riskantného plánu pomstiť svoju matku...

Obi-wan sfalšuje svoju vlastnú smrť a v utajení ide do Republikovej väznice, aby získal ifnormácie o sprisahaní na únos kancelára Palpatina od trestanca Morala Evala...

Po úniku z väzenia je Obi-wan, Cad Bane a Moralo Eval na úteku cez celú galaxiu pred Anakinom a Ahsokou. Obi-Wan musí nájsť cestu, ako o sprisahaní na únos informovať svojho priateľa Jedia...

Moralo Eval privedie Cada a Obi-Wana do paláca grófa Dooku na planéte Serenno. Spolu s ďalšími 10-timi lovcami ľudí je Obi-Wan a Cad umiestnený do Krabice, obrovskej kocky naplnenej smrtiacimi výzvami...

Najvyšší kancelár Palpatine odchádza na Naboo chránený rytiermi Jedi, zatiaľ čo Cad Bane, maskovaný Obi-Wan a ostatní lovci ľudí rozbiehajú svoj plán...

Gróf Dooku je rozhodnutý pomstiť sa Nočným Sestrám z Dathomiru po tom, čo ho zradili cez Savagea Opressa. General Grievous spúšťa plný útok droidov proti mágiou obdareným čarodejniciam a matka Talzin sa snaží presvedčiť Asajj Ventress, aby sa k Nočným Sestrám opäť pripojila...

Bezcieľna Asajj Ventress sa pripája k tímu lovcov ľudí pod vedením Boba Fetta. Na cudzom svete prijmú nebezpečnú, ale výnosnú misiu, ktorá otestuje ich schopnosti, a takisto silu Assajinho charakteru...

Savage Opress konečne nachádza svojho dlho strateného brata a ukazuje sa, že je to znovuzrodený Darth Maul, ktorý žije v stave šialenosti na planéte na Vonkajšom Okraji...

Nepriateľ môjho nepriateľa je môj priateľ. Naplnení čistou nenávisťou, Datrh Maul a jeho brat Savage Opress plánujú pomstu Jediovi, ktorý ho zabil - Obi-Wan Kenobimu. Ten však dostane nečakanú pomoc vo forme Asajj Ventress...