Sur Kamino, planète natale des clones, un groupe de cinq clones cadets (l'escouade Domino) doit parvenir à travailler en équipe et à comprendre leur futur de soldats s'ils veulent partir de l'usine de production de clones, ou dans le cas contraire, être détruits...

Après la destruction de la base de Rishi, la République a intercepté une transmission entre le général Grievous et Asajj Ventress, qui prévoient d'attaquer Kamino. C'est sur leur planète natale que vont devoir combattre les clones, sans se douter que la Jedi Noir et le leader Séparatiste sont plus organisés qu'ils ne le pensent...

Avec l'assaut Séparatiste sur Ryloth, le maître Jedi Ima-Gun Di et ses forces sont bloqués à la surface, à cours de munitions et de provisions. Tandis qu'ils continuent vaillamment de lutter, le destin des Twi'leks repose sur les épaules de Bail Organa et de Jar Jar Binks qui vont devoir convaincre le roi Katuunko de Toydaria, afin qu'ils puissent utiliser la planète pour acheminer des croiseurs anti-blocus vers Ryloth. Mais le sénateur de la Fédération du commerce ne l'entend pas de cette oreille...

Alors que la sénatrice Amidala est invitée pour découvrir la nouvelle Mandalore, la duchesse Satine se retrouve dans un monde plongé dans la corruption. Il lui faudra trouver toute l'aide possible pour déjouer le complot visant la population entière de Mandalore.

Envoyée sur Mandalore pour enseigner les méfaits de la corruption aux élèves de l'académie royale, Ahsoka va se retrouver avec une affaire de corruption dans les hautes sphères de la société Mandalorienne sur les bras. Et ce sont ses élèves qui l'ont découverte, mettant ainsi la duchesse en grand danger...

Pourchassée par des visions, Ahsoka doute de la mort du chasseur de prime Aurra Sing. Persuadée du danger que court la sénatrice Amidala, Ahsoka l'accompagne jusqu'à Alderande, où elle se retrouvera dans un nouveau face à face avec la chasseuse de prime au tir rapide... et prise dans le doute quant à l'avenir.

Alors que C-3PO et R2-D2 partaient faire d'importants achats sur Coruscant pour Padmé, voilà que Cad Bane projette un nouveau plan diabolique, pour aider un très important client. Les deux droïdes vont se retrouver en grand danger...

Les Hutts ayant libéré Ziro de sa prison sur Coruscant de peur qu'il ne révèlent des informations sur leurs affaires, tentent de récupérer ces fameuses informations que Ziro détient. Cependant les maîtres Jedi Obi-Wan Kenobi et Quinlan Vos se lancent à sa poursuite.

La sénatrice Padmé Amidala se rend sur le territoire Séparatiste pour rencontrer une de ces anciennes amies dans l'espoir de conclure un accord pour faire régner la paix sur la galaxie.

Après l'échec du traité de paix proposé par Mina Bonteri et la mort de cette dernière, la sénatrice Amidala ainsi que les sénateurs Organa et Faar vont devoir faire face à toutes les tentatives du comte Dooku pour les éliminer, et éviter une quelconque fuite au Sénat, qui pourrait compromettre la guerre.

Alors que la bataille spatiale fait rage dans le système Solus, le comte Dooku reçoit l'ordre d'éliminer Asajj Ventress, jugée trop puissante dans le côté obscur. Mais après l'échec de la tentative d'assassinat de Dooku, Asajj décide de se réfugier sur Dathomir, la planète des sorcières et sa planète natale, pour demander conseil auprès de Sœurs de la Nuit, et avoir sa revanche sur le comte Dooku.

Après son échec face au comte Dooku, Asajj Ventress part en quête d'un Frère de la Nuit, qui pourrait prétendre au titre de nouvel apprenti du comte. Comme son choix se porte sur le dénommé Savage Opress, Ventress fait appel à la magie des Sœurs de la Nuit pour le transformer en tueur sanguinaire et sans pitié... Mais à qui ce guerrier Sith porte sa véritable loyauté ?...

Après le massacre sur Devaron, Obi-Wan Kenobi et Anakin Skywalker se mettent en chasse du nouvel assassin du comte Dooku : Savage Opress...

Un code Jedi vieux de plus de 2000 ans envoie en mission Obi-Wan, Anakin et sa jeune padawan.

Anakin revient sur Mortis sauver sa padawan qui a été capturée par le Fils, celui-ci sombrant de plus en plus dans le côté obscur.

Le fils montre à Anakin son destin, celui-ci effrayé par ce qu'il voit s'allie au fils dans l'espoir de tuer le futur Empereur...

Capturé ! De retour de la bordure extérieure le vaisseau de maître Piell a été pris d'assaut sachant qu'il transporte des informations précieuses pour les deux camps : les coordonnées de la route Nexus ! Route qui permet à chacun d'aller dans les planètes mères Séparatistes et Républicaines. Une mission de sauvetage est donc organisée pour aller sauver le Jedi dans la prison Séparatiste la plus imprenable.

Avec les prisonniers libérés et le surveillant brutal essayant désespérément de les contrecarrer, Obi-Wan et Anakin recherchent un moyen de sortir de la citadelle et de revenir sur Coruscant. La prison, cependant, a beaucoup plus de pièges en réserve que ce qu'ils avaient imaginé, ils devront outrepasser leurs différences et travailler en équipe s'ils veulent s'échapper.

Échappés de la Citadelle et sans vaisseaux disponible les échappés appellent la République en renfort pour les extraire de cette planète. Mais une perte importante va se présenter pour le groupe...

Ahsoka et un groupe de jeunes padawans jedi enlevés se retrouvent pris au piège sur la lune des Trandoshan, proies d'une chasse élaboré et cruelle. Les padawans, désespérés, ont perdu tout espoir, malgré les meilleurs efforts de leur leader, Kalifa. Ahsoka les rallie pour se défendre et contre-attaquer contre les Trandoshan, un effort avec de mortelles conséquences...

Alors qu'Ahsoka et ses alliés padawans luttent pour échapper au chasseurs Trandoshan, leurs efforts reçoivent une stimulation inattendue lorsque arrive un nouveau captif, le Wookie Chewbacca...