Cad Bane infiltreert de Jedi-tempel en probeert een oude Jedi-Holocron te stelen. Aan Ahsoka, Anakin en Obi-Wan de taak om de premiejager te stoppen voordat hij ontsnapt met het waardevolle Jedi-artefact.

Anakin en Ahsoka onderscheppen Cad Banes oorlogsschip in de hoop de gestolen Jedi Holocron terug te vinden. Maar de Jedi onderschatten de slinkse tactieken van de premiejager.

Cad Bane krijgt een nieuwe, destructieve missie: ontvoer Force-gevoelige kinderen uit het sterrenstelsel en breng ze naar Mustafar voor Sith-training.

Op verzoek van de Jedi-raad onderzoekt Padmé een Separatisten-samenzwering in de Senaat.

Anakin, Ahsoka en Ki-Adi-Mundi geven leiding aan een verkenningsteam om een droid-fabriek op Geonosis te vernietigen. Ze moeten hem stoppen voordat hij actief wordt.

Luminara en Anakin zijn lokaas om supertanks van de vijand af te leiden, terwijl Padawans Barriss Offee en Ahsoka een droid-fabriek proberen te vernietigen. Kunnen de Padawans deze uitdaging aan?

Als Luminara vermist is, sturen Obi-Wan en Ki-Adi-Mundi een peloton aan van clones. Als de zoektocht leidt naar een mysterieuze schuilplaats, worden de Jedi geconfronteerd met ondode krijgers.

Als Geonosiaanse breinwormen de controle overnemen van hun bevoorradingsschip, gaan Ahsoka en Barriss de strijd aan om te voorkomen dat het voertuig een dodelijke plaag loslaat op het sterrenstelsel.

Meester Eeth Koth wordt gegijzeld en gemarteld door generaal Grievous. Anakin, Obi-Wan en Adi Gallia bedenken een reddingsplan, maar al snel beseffen ze dat de generaal zelf ook een plan heeft.

Terwijl hij op zoek gaat naar generaal Grievous op een afgelegen planeet, komt Rex een clone-deserteur tegen.

Als een zakkenroller Ahsoka’s lichtsabel heeft gestolen, schakelt ze de hulp in van een oude Jedi om haar wapen op te sporen en haar eer te herstellen.

Obi-Wan onderzoekt geruchten van een samenzwering rondom de hertogin Satine van Mandalore en ontdekt de waarheid over de mysterieuze ‘Mandalore-samenzwering’.

Duchess Satine travels from Mandalore to Coruscant on a diplomatic mission, with Obi-Wan Kenobi, Anakin Skywalker and a team of troopers to defend her. As her luxurious starship, Coronet, makes its way through hyperspace, the Jedi must stop several assassination attempts, and Anakin discovers that Obi-Wan and the Duchess have a history together.

On Coruscant, word reaches Duchess Satine that Death Watch is mobilizing, sparking a pre-emptive Republic invasion. On the run from Republic authorities, Satine and Obi-Wan set off to discover the group's true motives.

When Senator Onaconda Farr dies under suspicious circumstances and the local Inspector appears incompetent, Padmé; sets out to find the person who poisoned her mentor. Following a trail of clues, Padmé and Bail Organa delve into a dangerous world of backstabbing, lies, and secrets controlled by the powerful Senators Mee Deechi and Halle Burtoni. Padmé's search forces her to risk her career and ideals but the true identity of the assassin is even more destructive than she could imagine.

A Separatist blockade surrounds Christophsis. Anakin's fleet is tasked with deploying relief supplies to the surface but they are massively out-gunned and out-maneuvered by the skillful Admiral Trench. Obi-Wan arrives and unveils the Republic's new weapon: a stealth ship. The stealth ship is the last hope at besting the cunning Separatist fleet commander and aiding the battered people of Christophsis.

Anakin, Obi-Wan, and Ahsoka crash on Felucia and seek aid from the local spice farmers only to learn that the farmers are the ones who are in real need. Beset by Hondo Ohnaka and his band of pirates who plan to steal their crop, the farmers have contracted four deadly bounty hunters to protect their wares. In an unlikely partnership, the Jedi must work with the farmers' hired guns to beat back Hondo and his brigands.

Desperate to turn the tide of a fierce battle on Malastare and win a strategic alliance with the Dugs, Chancellor Palpatine orders the Jedi to drop the Republic's newest super-weapon, an untested electro proton bomb. Unfortunately, the bomb's blast awakens an ancient and fearsome Zillo Beast, a monster of legendary size and ferocity. Now the Jedi must contain this deadly creature despite the interference of the bloodthirsty Dugs, who have their own agenda.

Per Palpatine's order, Republic forces transport a fearsome Zillo Beast back to Coruscant for scientific study. Eager to extract the beast's secrets for military gain, Palpatine orders his lead scientist to examine, and subsequently, kill the monster. Filled with pain and anger, the Zillo Beast escapes from the lab and begins devastating the city. Soon, Anakin, Padmé, and Palpatine find themselves pursued by the beast while the Jedi fight to contain it.

Boba Fett and his band of bounty hunters lead Anakin and Mace into a deadly trap on Vanqor. It's up to R2-D2 to journey back to Coruscant and warn the Jedi of their brethrens' peril. Battling beast and bounty hunter along the way, the trusty droid finally communicates his warning to Ahsoka and Plo Koon, who rush to Vanqor to save Mace and Anakin from a fiery death.

Following a nefarious attempt to murder Anakin Skywalker and Mace Windu on Vanqor, Boba Fett and Aurra Sing go into hiding. Jedi Master Plo Koon and Ahsoka Tano set out to capture the bounty hunters. While combing through the lower depths of the Coruscant underworld, Plo and Ahsoka finally learn that Fett and his group are hiding out on Florrum. In a dramatic showdown, Fett is abandoned by Aurra Sing, leaving young Boba angry and bitter in Republic custody.