Cad Bane se pokouší ukrást z Chrámu Jediů prastarý jediský holokron.

Anakin a Ahsoka vniknou na válečnou loď Cada Banea ve snaze získat zpět ukradený holokron. Nájemný lovec je však mnohem zákeřnější než Jediové tuší.

Cad Bane má nový, zkázonosný úkol: unášet ze všech koutů galaxie děti citlivé k Síle a dopravit je na Mustafar, kde mají prodělat sithský výcvik.

Na žádost Rady Jediů vyšetřuje Padmé Amidala separatistické spiknutí v Senátu.

Anakin, Ahsoka a Ki-Adi-Mundi vedou výsadek na Geonosis s cílem zničit továrnu na droidy. Vyřadit jsi musí dříve, než bude uvedena do provozu.

Luminara a Anakin se snaží odlákat nepřátelské supertanky, zatímco se padawanky Barriss Offee a Ahsoka snaží zničit separatistickou továrnu na droidy. Zvládnou padawanky takovou výzvu?

Když se Luminara ztratí, Obi-Wan a Ki-Adi Mundi se ji vydají s četou klonovaných vojáků hledat. Pátrání je zavede do záhadného doupěte, kde se proti Jediům vyrojí horda nemrtvých válečníků.

Posádku zásobovací lodi, ve které cestují Ahsoka a Barriss, ovládnou geonosianští mozkoví červi. Padawanky musí červům zabránit v dalším šíření.

Mistr Jedi Eeth Koth je zajat a mučen generálem Grievousem. Anakin, Obi-Wan a Adi Gallia naplánují, jak mistra Kotha zachránit. Jediové však brzy zjistí, že mazaný generál má svůj vlastní plán.

Při pátrání po generálu Grievousovi na Saleucami se Rex a Jediové setkají s klonovaným dezertérem.

Při vyšetřování záhadných událostí kolem vévodkyně Satine z Mandaloru odhalí Obi-Wan pravdu o takzvaném „Spiknutí na Mandaloru“.

Zatímco Jediové a jejich klonovaní vojáci brání vévodkyni Satine před zavražděním, Anakin zjistí, že Obi-Wan a vévodkyně mají společnou minulost.

Coruscant chce vyslat republikové síly, aby zakročily na Mandaloru proti Umrlčí hlídce. Satine s Obi-Wanem prchají před republikovými úřady a snaží se celou věc vyřešit.

Senátor Onaconda Farr zemře za záhadných okolností a Padmé Amidala vyšetřuje, kdo jejího oblíbeného „strýčka“ zavraždil.

Obi-Wan a Anakin se snaží dostat klonované vojáky na Christophsis. Tam se bohužel střetnou se separatistickým admirálem Trenchem, který je mnohem nebezpečnější, než si Jediové mysleli.

Anakin, Obi-Wan a Ahsoka uzavřou křehké spojenectví se čtyřmi nebezpečnými nájemnými lovci, aby ochránili farmáře před Hondo Onakou a jeho bandou pirátů.

Nová republiková superzbraň probudí na Malastaru netvora Zilla. Jediové musí vymyslet, jak zkázonosného tvora zkrotit.

Když netvor Zillo uprchne, musí se Jediové rozhodnout, zda vzácné zvíře, poslední svého druhu, zabít, aby ochránili miliony životů.

Malý hoch vyhlásí válku rytířům Jedi, kteří z něj udělali zahořklého a osamělého sirotka.

Boba Fett a jeho banda nájemných lovců vlákají Anakina a Mace do smrtonosné pasti na Vanqoru. R2-D2 se musí probojovat zpět na Coruscant a varovat Radu Jediů.

Plo Koon a Ahsoka pročesávají podsvětí Coruscantu s cílem nalézt Bobu Fetta. Následně se vydávají na Florrum, aby ho i s jeho bandou nájemných lovců zajali.