Ett övervakningsband hotar Doggetts utredning av biträdande redaktör Kersh.

Utredningen av Kersh fortsätter. Doggett försöker avtäcka sanningen om en kvinna med övernaturliga förmågor.

Agenterna försöker hitta ett samband mellan en mentalpatient och flera satanistiska mord.

Agent Reyes teoriserar att en galen mördare som kritiskt skadat Doggett kan ha kommit till jorden från en parallell dimension.

En tonårings skalle kollapsar efter att han gör ett korkat stunt. Köttätande flugor verkar ligga bakom kollapsen.

Scully är hoppfull om att kunna återförenas med Mulder när en främling erbjuder information om vad som fick Mulder att gömma sig. Men hennes förtroende för främlingen kan utsätta Mulder för ännu mer fara.

Agent Doggett vaknar upp i en stad i Mexiko och har förlorat minnet. Han kämpar med att få tillbaka sitt minne så han kan ta reda på varför han befinner sig på en okänd plats.

Agent Reyes utreder ett fall där offret blivit flått levande. Reyes tar hjälp av Scullys expertis vilket genast ger utdelning när hon hittar en länk till ett fall från sextiotalet.

En religiös sekt gräver upp ett rymdskepp likt det Scully upptäckte i Afrika. FBI döljer upptäckten för arkiv-x-gruppen vilket kan få förödande konsekvenser för Scullys baby.

Scully blir frustrerad när FBI inte lyckas tar reda på vilka som har kidnappat hennes son så hon tar saken i egna händer.

När Reyes skadas i en bilolycka och hamnar i koma måste Doggett och Scully söka svar som kan rädda hennes liv.

Scully, Doggett och Reyes undersöker ett mordfall som Doggett var inblandad i flera år tidigare. De försöker komma fram till om mannen som blev fälld verkligen var skyldig.

När Reyes använder sig av numerologi för att komma i kontakt med en mördare blir hon och Scully instängda med en mystisk man som kan visa var den person de söker efter är.

Några monster under en liten pojkes säng kan vara mer än bara en vild fantasi. Harrison ger Doggett och Reyes i uppdrag att undersöka om pojkens påstående om att monstren skulle finnas på riktigt är sant.

När en lurendrejare hävdar att han känner till en supersoldats hemliga identitet, vänder sig Reyes och Doggett till Lone Gunmen för hjälp. Med deras hjälp börjar de söka efter sin gamla vän, Yves Adele Harlow.

En av Scullys elever visar sig ha en ovanlig förmåga att göra profiler på seriemördare. Hans kunskaper kastar nytt ljus på det olösta mordet på Doggetts son.

Agenterna undersöker en serie ovanliga dödsfall som kan kopplas till en man som bor i ett hus där en populär tv-serie spelats in.

Mulder anklagas för att ha mördat Knowle Rohrer och ställs inför en militärdomstol. Han får hjälp av en grupp vittnen som stödjer hans teori om att allt är en konspiration från regeringens håll.

Med hjälp av helikopter tar sig Mulder in i en regeringsbyggnad i Mount Weather-anläggningen. Efter att ha styrt alla mot centrum av anläggningen lyckas Mulder ta sig undan och in på en högbevakad avdelning.