Mulder ja Scully saavat jatkaa työtään vain siinä tapauksessa, että pystyvät esittämään tutkimuslautakunnalle todisteita maapallon ulkopuolisen elämän olemassaolosta.

Kohti länttä pyrkivä vakavasti sairas mies pakottaa Mulderin autonkuljettajakseen, sen jälkeen kun hänen vaimonsa on menehtynyt järkyttävällä tavalla.

Vihollissotilaiden vangiksi joutunut Mulder viedään loistoristelijälle, jossa hän kertoo ällistyneelle kuulijakunnalle, että toinen maailmansota on päättynyt.

Nevadan autiomaan yli pyyhkäisevä lentävä lautanen aiheuttaa uskomattoman muutoksen alueella vierailevassa Mulderissa ja eräässä paikkakunnalla pysyvästi asuvassa virkamiehessä.

Mulder yrittää sopeutua perhe-elämään Nevadan autiomaassa, samalla kun hänen hahmossaan esiintyvä Morris Fletcher ottaa Scullyn suureksi hämmästykseksi kaiken irti poikamiespäivistään.

Mulder ja Scully vierailevat jouluaattona vanhassa talossa, jolla on synkkä menneisyys.

Mulder epäilee, että pahuuden voimat ovat liikkeellä, kun odottava äiti menettää lapsensa epäilyttävissä olosuhteissa.

Kuivuuden vaivaamalta seudulta löytyy mies, joka väittää pystyvänsä yllättäviin tekoihin.

Mulderilla ja Scullylla on vuorokausi aikaa pelastaa vakavasti sairastunut FBI:n apulaisjohtaja Skinner.

Scullyn tutkimuksen kohteena on rikoksen uhreja kamerallaan ikuistava vanha mies, joka kertoo vaistoavansa kuoleman läheisyyden.

Avaruusolioiden kaappaama Cassandra Spender löydetään yllättäen leikkaussaliksi muunnetusta rautatievaunusta, ja käy ilmi, että hän on Mulderin ja Scullyn tutkimusten avainhenkilö.

Mulder pääsee vihdoinkin selville avaruusolentojen ja Syndikaatin välisestä salaliitosta.

Salaisten kansioiden isä, eläkepäiviään Floridassa viettävä agentti Arthur Dales kutsuu Mulderin ja Scullyn paikalle, kun näyttää siltä, että paraikaa riehuva pyörremyrsky on tuonut mukanaan jotakin hyvin tavallisuudesta poikeavaa.

Mulder, Scully ja epätoivoinen pankkirosvo elävät painajaismaisen maanantain tapahtumat uudelleen ja yhä uudelleen.

Avioparina esiintyvät Mulder ja Scully muuttavat suositulle omakotialueelle kolmen mysteerisen katoamistapauksen jälkeen.

Mulder ja Scully jäljittävät vankilasta kadonnutta rikollista, jolla ilmeisesti on kyky mennä vaikka läpi harmaan kiven.

Scully ihastuu selittämättömällä tavalla murhatutkimuksen pääepäiltyyn, Mulderin naapurissa asuvaan kirjailijaan.

Arthur Dalen veli kertoo avaruudesta tulleesta baseball-sankarista, joka pelasi 1940-luvulla mustien joukkueessa Roswellissa, Uudessa Meksikossa.

The Lone Gunmen -ryhmän jäsenet Byers, Frohike ja Langley yrittävät lypsää sisäpiirin tietoa Las Vegasissa pidettävän konferenssin jäseniltä, kun salaperäinen hahmo monen vuoden takaa, Susanne Modeski, ilmaantuu kasinolle.

Mystisissä olosuhteissa kuolleen nuoren parin luurangot vievät Mulderin ja Scullyn Pohjois-Karolinaan alueelle, jonka taivaalla vuosisatojen ajan on havaittu merkillisiä valoilmiöitä.

Afrikasta löydetyt salaperäistä kirjoitusta sisältävät metalliesineet ovat Mulderin käsityksen mukaan todiste siitä, että elämä maapallolle on tuotu ulkoavaruudesta.