סקאלי מתעסקת בתיקים סודיים על ניסויים בחייזרים והופכת למטרה.

תוכנית להכלאה בין בני אדם לחייזרים חושפת מידע על אחותו של מאלדר.

הסוכנים נעזרים במגד עתידות שחוזה את המוות של מאלדר.

מאלדר וסקאלי מקשרים סדרת רציחות בבית סוהר לאסיר שהוצא להורג.

הסוכנים מחפשים אחר רוצח המשתמש באינטרנט כדי למשוך את קורבנותיו.

מולדר וסקאלי חוקרים כשקטוע ארבעת גפיו הופך לחשוד העיקרי בסדרה של מקרי מוות משונים.

אישה שחוותה קשר על טבעי עם נער מוחזקת שבוייה ע"י אדם משוגע.

סרט וידאו של "ניתוח שלאחר המוות של חייזר" ורצח של דיפלומט יפני מביאים את מולדר לחפש אחרי יצור משונה ברכבת.

כאשר מולדר נלכד על גבי רכבת ממולכדת במתקן נפץ, סקאלי מחפשת אחר האמת מאחורי מעורבות הממשלה בניסויים סודיים.

סקאלי נאלצת להגן על ילד שיש לו פצעי צליבה כמו של ישו.

הסוכנים באים לעזרתה של עיירה הנמצאת תחת התקפה של ג'וקים רצחניים.

היערכות נדירה של כוכבי הלכת נותנת לשתי נערות כוחות טלקינטים מסוכנים.

מאלדר וסקאלי מנסים להבין מדוע סדרת רציחות נמשכת גם לאחר תפיסתו של הרוצח. בתחילה הם חושדים ברוצח חקיין או שותף פוטנציאלי, אך במהרה הם מבינים שלרציחות מקור סבוך ואפל בהרבה.

הסוכנים רודפים אחר ישות רדיואקטיבית ששוחררה מספינה טרופה ממלחמת העולם השנייה.

מאלדר רודף אחרי ישות חייזרית חסרת צורה שנמצאת בגוף של קריסק.

מאלדר וסקאלי משתתפים במרדף משטרתי אחר רוברט פאטריק מודל - רוצח סדרתי מסוכן, שניחן ביכולת על טבעית מבעיתה: לשלוט במעשיהם של בני אדם כרצונו.

מאלדר וסקאלי מתעמתים עם רוח של שאמאן שמתגלמת בגוף של חתול.

הסוכנים חושפים משחק שבו הורגים מהגרים סינים בשביל האיברים שלהם.

מאלדר וסקאלי חוקרים טיוח ממשלתי של חטיפת עב"ם.

מאלדר מפתח תאוריה שהרוצחת שהם מחפשים היא סוקובוס, שדה קנאית.

הסוכנים חוקרים יצור אגדי שחי באגם וקרוי "ביג בלו".

הסוכנים חושפים קנוניה שקשורה בשליטה מוחית באמצעות אותות טלוויזיה.

ישות עם יכולות ריפוי נותנת לסוכנים רמזים על "הפרויקט".