מאלדר וסקאלי חושפים טיוח עב"מים וניסויים ממשלתיים.

הסוכנים מוצאים סימנים לקניבליזם מודרני וקשרים לחיי נצח.

מאלדר וסקאלי נקראים לעזרתה של תלמידה לשעבר של סקאלי, החוקרת את היעלמותם הבלתי מוסברת של מספר אנשים ומובילה אותם אל ד"ר צ'סטר ריי באנטון - מדען המפחד מצילו שלו.

בזמן שסקאלי חוקרת את התפשטותה של מחלה מדבקת וקטלנית בבית כלא, מנסה מולדר לאתר שני פושעים שברחו ונדבקו במחלה.

מאלדר וסקאלי חוקרים את מותו של פעוט בן שנתיים. ניתוח של תצלומי האירועים שקדמו למותו רומזים להתערבות אפשרית של ישות על טבעית וכי משפחת הילד אינה זרה לאירועים מסוג זה.

הסוכנים מתעמתים עם כוח שאינו מכדור הארץ, וגורם להם להזדקן במהירות.

סקאלי ומאלדר חוקרים רצח של איש קרקס מוזר הידוע כ-"איש התנין" וחוקרים את כל עמיתיו המוזרים בקרקס.

מולדר וסקאלי מתמודדים עם מישהו או משהו שמבריח בעלי חיים מגני החיות. האם המשחררים הם חייזרים שפועלים לשחרורם של בעלי חיים?

צייד ראשים חטף את סקאלי בזמן שמאלדר חושף אג'נדה חייזרית.

מאלדר מגלה דברים על אחותו, כשחייה של סקאלי בסכנה.

הסוכנים פוגשים כומר וודו שיש לו את היכולת להקים מתים לתחייה.

מאלדר וסקאלי חושפים כת שטנית בהנהגת מורה שטני.

מאלדר רודף פטישיסט מוות שהאובססיות שלו יכולות להוביל לרצח.

הסוכנים עוזרים לאישה בהריון שירשה זיכרונות גנטיים קטלניים.

מאלדר וסקאלי מתמודדים עם רוחות רפאים רצחניות בבית אבות.

הסוכנים חושפים ניסוי שכלל בני נוער אלימים ודנ"א חייזרי.

מולדר וסקאלי נקלעים לתוך אתר עם סכנה למגפה, כאשר הם חלק מקבוצה, וצריכים להתמודד עם המצב.

מאלדר חושף רמזים לחטיפתה של סקאלי בזמן שהיא נלחמת על חייה.

מאלדר קושר סדרה של מקרי מוות זוועתיים לקבוצה של ערפדים מודרניים.

מאלדר פותח בחיפוש כאשר סקאלי נחטפת על ידי כוחות בלתי נראים.

מאלדר מזדהה עם אדם חמוש באקדח שנפל קורבן לניסויי חייזריים.

מאלדר ושותפו החדש, אלכס, מתמודדים עם אדם שיכול להרוג באמצעות חלומותיו.

מאלדר וסקאלי חוקרים גל רציחות בו כל החשודים טוענים שביצעו את הרצח לאחר שראו מסרים במכשירים אלקטרוניים בביתם.

מאלדר וסקאלי רודפים אחרי הפלוקמן, מוטנט במערכת הביוב של ניו ג'רזי.

מאלדר ממהר להגיע לעב"מ שהופל, לפני שהצוות הממשלתי יוכל להסתירו.