Lisa veut parler à quelqu'un qui la comprendrait mieux. Elle part alors à la recherche d'autres génies dans le monde. Elle en rencontre un au Texas, Gene. Chett, jaloux, recherche la théière dans laquelle vit Gene. Il trouve l'adresse du maître de Gene et lui fait savoir où se trouve Gene. Plus tard, lorsque Lisa découvre tout cela, Chett réalise qu'il a fait une erreur. Il essaye de récupérer Gene, et de le libérer des pièges de son maître. Cependant, une seconde après avoir été libéré, il quitte Lisa pour une autre femme...

Gary et Wyatt essayent de se rapprocher de Lisa en jouant avec elle à des jeux de filles, mais ça ne suffit pas. Lisa veut de vraies filles avec qui parler. Elle décide de devenir amie avec une des serveuses du Java man. Mais Lisa va devoir mentir constamment pour dissimuler le fait qu'elle est un génie, et le mensonge lui pèse tellement qu'elle décide de partager son secret avec la serveuse...

Au lycée Farber, on rend honneur à Scampi, le Directeur. Mais certains étudiants caricaturent sa photo. Scampi n'en sait pas assez pour découvrir qui est responsable. Lisa, désolée pour lui, lui propose de l'aider à découvrir qui sont les coupables. Malheureusement, tandis que Lisa et le Directeur recherchent des indices, ils mènent tous à Wyatt et à Gary, alors qui sont tous les deux innocents...

Wyatt veut une enveloppe très solide pour son dossier à l'université de Paxton. Aussi, Lisa transforme l'enveloppe et la rend indestructible. Elle la teste elle-même en soufflant dedans, en la jetant dans le feu, et en la donnant à Chett pour jouer avec. Avec tout ce qu'il entend sur l'université qu'il a choisie, Gary se rend compte que ce n'est pas n'importe où. Il prie Lisa et Wyatt de l'aider, mais Lisa refuse d'avoir recours à la magie pour l'entrée dans une école. Mais quand Gary lui explique ce que cette école représente pour lui, Lisa lui donne un casque qui va lui permettre de gagner le triathlon de Farber high school. Mais Gary découvre la célébrité avant même son entrée à l'université, il est déja extrêmement populaire et on lui offre de nombreux contrats...

Wyatt veut rencontrer la fille parfaite pour lui, donc Lisa crée un chapeau magique qui transformera la fille de ses rêves en réalité. Cependant, quand Chett et Gary utilisent le chapeau pour faire vivre leurs filles idéales, il s'avère qu'il ne peut exister qu'une seule fille à la fois

Chett parlant continuellement des femmes comme des objets sexuels, Lisa décide de faire de Chett un strip-teaser au Chip 'N 'Tails, le club des femmes local. Mais Chett devient rapidement un stripper extrêmement populaire !

Wyatt et Gary repensent à la façon dont leurs pères n'ont jamais joué avec eux quand ils étaient petits. Lisa accepte de les renvoyer dans le temps dans la peau de leurs pères. Ils pourront ainsi passer un peu de temps avec eux-mêmes en tant qu'enfants. Mais le souhait dégénère quand Gary se retrouve dans le corps de sa mère au lieu de celui de son père...

Wyatt sort beaucoup, mais aucune des filles ne le satisfait. Lisa invente un détecteur d'épouse qui se déclenche dès que sa future femme s'approche de lui. Elle est là, assise à côté dans le java Man. Chett trafique le détecteur pour qu'il sonne dès que Lisa s'approche de Wyatt pour lui faire croire qu'elle est la femme idéale pour lui. Malheureusement pour lui, Lisa voit son petit manège et le piège. De son côté, Wyatt, qui prend la chose trop au sérieux, perd sa future femme. Mais après tout cela, ils se rendent compte que le détecteur n'a jamais vraiment marché.

Chett donne au principal Scampi un cochon en porcelaine en récompense, et il reçoit en même temps le titre “d'éducateur de la décennie”. Lisa crée une plateforme holographique pour que les garçons puissent combattre, comme dans Stalag 17.

Alors que le directeur Scampi, habillé en toge, les salue à l'école, Gary et Wyatt sentent que quelque chose ne va pas bien. Ils ont des problèmes car, non seulement ils sont en retard, mais aussi parce qu'ils ne sont pas habillés correctement. Ils doivent retourner à la Rome antique et réparer ce qu'a fait Chett.

Pendant que Gary et Wyatt sont à l'école, Lisa joue à un jeu virtuel, Génie le détective. Elle se retrouve dans les années 30. Chett la rejoint, mais il ne veut pas jouer avec elle. Il ne sait pas non plus que lorsque quelqu'un meurt dans le monde virtuel, cette personne meurt également dans le monde réel. Maintenant, Lisa doit sauver Chett. Wyatt rejoint le jeu pour l'aider.

Tout comme dans la Guerre des Etoiles, Lisa rejoint son maître Génie sur une comète, pour en apprendre plus sur ses pouvoirs.

Les fantômes des vieux élèves de Farber hantent l'école. Quand ils découvrent que la nouvelle bibliothèque ne doit pas être construite au-dessus du salon de leur professeur, ils concoctent un plan pour hanter Scampi comme dans Shining.

Dans une parodie de "Blanche Neige", Mme Donnelly ne se sent plus belle. Lisa essaye de l'aider, mais en vain. Mme Donnelly se met à vouloir être la plus belle d'entre tous.

Les deux agents Scolder et Molly du Fly Boy rejoignent la course de Stever dans un nouvel épisode où vont apparaître de vieux personnages.

Pour tester Chett, Lisa, se “met” enceinte. Chett souhaitant prendre en charge la grossesse devient enceint au lieu de Lisa.

Alors que personne ne s'entend avec Farber, Lisa décide de zapper quelques aliens pour l'aider à effacer cette haine. Mais, au lieu de l'aider, les aliens vont attaquer l'école.