Depuis la mort de Strauss, Hotch travaille jour et nuit. Ses supérieurs lui proposent de prendre la place d'Erin, définitivement. Il réfléchit à cette éventualité au cours de sa nouvelle enquête qui le conduit avec son équipe à Glendale, en Arizona, où deux jeunes femmes, sans lien apparent, ont été violées puis assassinées. Les deux corps ont été retrouvés dans un parc de la ville, attachés à une croix, dans une position de recueillement.

L'équipe repart en Arizona après avoir compris qu'elle avait arrêté Jesse, le jumeau de Wallace, pour la série de meurtres. Les enquêteurs décident de surveiller Carla, la mère des frères Hines, en espérant ainsi retrouver la trace de Wallace. Ce dernier découvre dans le même temps l'existence de Jesse dont il ignorait tout. Il lui confie tous les meurtres qu'il a commis, ce qui crée une vive tension entre les deux hommes.

L'équipe est mise en état d'alerte après une fusillade survenue à Dallas. Un tireur a ouvert le feu à douze reprises et tué six personnes. Les enquêteurs se demandent si cet événement est lié à l'anniversaire de l'assassinat du président Kennedy. Les victimes choisies au hasard laissent supposer qu'il s'agit d'un acte terroriste. Dans cette affaire, l'équipe collabore avec l'agent Tanya Mays qui se révèle très efficace.

Un homme est retrouvé errant dans les rues de Baltimore après avoir subi une lobotomie. Atteint d'un syndrome d'enfermement, il essaie d'aider l'équipe de Hotchner à retrouver son tortionnaire. Parallèlement, Mateo Cruz est affecté au poste de chef de section laissé vacant par Erin Strauss. Les agents ignorent que JJ le connaît intimement. Cruz décide de suivre l'équipe à Baltimore pour observer ses méthodes de travail.

Samantha, une adolescente, est enlevée dans une petite ville du Kansas. Son père, Eddie Lee Wilcox, un ex-détenu aux pulsions violentes, fait figure de principal suspect. Il aurait agressé le petit ami de Samantha avant de disparaître avec elle. Dans le même temps, Hotch s'évanouit au cours d'une réunion avec ses agents et doit être hospitalisé d'urgence. L'équipe se rend donc sans lui dans le Kansas.

L'équipe de profileurs se rend à Boston pour enquêter sur le meurtre par strangulation de trois hommes. Dans les trois cas, le tueur a volé le portefeuille de sa victime et lui a coupé une mèche de cheveux. Un peu plus tard, un adolescent est tué de la même façon, ce qui complique les recherches des agents. Ces derniers remontent la piste d'une certaine Ashley Fouladi, avec laquelle l'une des victimes a passé la nuit avant d'être tuée.

L'équipe se rend à Chicago où un adolescent de 16 ans a ouvert le feu dans un restaurant, tuant trois clients avant d'être abattu par un policier en civil présent sur place et qui venait de terminer son service. Quatre ans plus tôt, sa mère avait signalé la disparition du jeune homme et l'autopsie révèle qu'il avait subi des maltraitances. Les agents sont convaincus que le tireur avait un complice.

Hotchner se rend en Virginie avec son équipe pour enquêter sur la découverte de deux squelettes de femmes enterrées dans le jardin d'une famille sans histoire, les Johnson. D'après le légiste, les victimes auraient été tuées dix ans auparavant, mais Lyle, le fils de la famille Johnson, semble être le coupable idéal. Au fil d'un interrogatoire musclé, il finit par avouer le double meurtre. Bientôt, un troisième cadavre est déterré du jardin.

L'équipe part pour Saint Louis où un garçon d'une dizaine d'années a disparu. Ses parents, Malcolm et Lida Taffert, avaient reçu récemment et à plusieurs reprises des appels téléphoniques anonymes d'un enfant. Spencer Reid fait rapidement le lien avec une affaire plus ancienne d'enlèvement d'enfant, en tout point similaire. Les agents pensent qu'ils ont affaire à un imitateur. Malcolm Taffert éveille les soupçons de l'équipe.

Alex Blake est sollicitée par son père, Damon Miller, ancien capitaine de police, pour une affaire en cours à Kansas City. Il est en effet persuadé que le meurtre d'un homme, retrouvé dévêtu et tabassé à mort, est lié à l'assassinat de deux adolescents, survenu un an plus tôt. Les modes opératoires sont similaires et les enquêteurs pourraient avoir affaire à un tueur en série. Sur place, l'équipe collabore avec Scott, le frère d'Alex, également dans la police.

Des hackers laissent un message sur le serveur du département de la justice affirmant que Sam Russell, condamné à mort pour les meurtres de huit prostituées, est innocent. L'équipe n'a que deux jours pour vérifier la culpabilité de Russell. Garcia reconnaît les méthodes d'un collectif de justiciers qui sévit sur Internet. Pirate informatique avant d'intégrer l'équipe de Hotchner, la jeune femme se sent personnellement impliquée.

Rossi se rend à Los Angeles pour retrouver l'un de ses vieux amis, vétéran du Vietnam, dont il n'a plus de nouvelles. Dans le même temps, l'équipe s'envole pour Cleveland où un homme a tué quatre personnes en une seule journée. Toutes les victimes étaient des malfrats. Pourtant, rien n'indique qu'il s'agisse d'un règlement de comptes entre gangs. Bientôt, le tueur récidive en exécutant un homme en train d'agresser son épouse puis une bande de dealers.

L'équipe est en alerte depuis la disparition de JJ et tout porte à croire qu'elle a été enlevée. Le chef de section Mateo Cruz, avec lequel elle a travaillé au Département d'Etat pour une mission secrète, a lui aussi disparu. Les deux agents sont aux prises avec des tortionnaires qui veulent obtenir leurs codes secrets liés à une opération confidentielle. Hotchner rappelle Emily Prentiss pour cette affaire.

Deux auto-stoppeuses ont été assassinées à Pittsburgh (Pennsylvanie). Dans les deux cas, les corps ont été découverts dans un fossé bordant une autoroute. Le mode opératoire est similaire : les cadavres sont emballés dans un rideau de douche. Grâce à ces éléments matériels, le FBI parvient à remonter jusqu'à une chambre de motel. Il parvient à identifier un couple qui utilise le meurtre comme préliminaire à leurs ébats.

La petite Gabby Hoffer, 4 ans, est kidnappée dans le véhicule de sa tante, Sue Walsh. Celle-ci a laissé la petite fille sans surveillance, endormie dans la voiture, le temps de faire quelques courses en pleine nuit. La mère de l'enfant est en croisière dans les Caraïbes avec son nouveau compagnon. Hotchner et son équipe sont aussitôt envoyés sur place, dans le Mississippi. Ils s'intéressent au père biologique de l'enfant.

Les corps de deux femmes, décédées par noyade, sont retrouvés dans le désert de Las Vegas. L'équipe d'Aaron se rend sur place et découvre leur identité : l'une était une serveuse et ancienne toxicomane, l'autre, une voleuse qui sévissait dans les casinos. Parallèlement, Finn, un jeune voyou nouvellement arrivé à Las Vegas, rencontre un mystérieux inconnu. L'individu l'emmène dans les tunnels de la ville, où il vit avec des SDF.

Un jeune garçon est enlevé par un inconnu en rentrant chez lui. Parallèlement, les profileurs du FBI se lancent dans une nouvelle affaire : les meurtres de trois personnes, retrouvées dans une forêt de Milwaukee (Wisconsin), avec des marques de morsure sur le corps. Ils apprennent que les victimes, décédées à des mois d'intervalle d'un arrêt cardiaque, ont été retenues prisonnières durant plusieurs jours avant de mourir.

Morgan rend visite à Daria Samsen, qui séjourne dans un hôpital psychiatrique depuis plusieurs mois après avoir été séquestrée pendant près d'un an dans la banlieue d'Hamilton. La jeune femme, qui avait réussi miraculeusement à s'évader contrairement à d'autres codétenus, doit prochainement témoigner au procès de ses bourreaux et Morgan l'aide à rassembler ses souvenirs. Mais Daria est rongée par la culpabilité.

L'équipe de Hotchner se rend dans une zone rurale de Virginie-Occidentale pour enquêter sur les meurtres de Charles Howard et de Mathias Lee, tués à deux jours d'intervalle. Les policiers découvrent que les deux hommes, fabricants de métaphétamine, appartenaient à deux familles en guerre depuis plusieurs années : leurs pères se livraient une compétition acharnée comme coursiers d'alcool de contrebande. Bientôt, une troisième victime est à déplorer.

L'équipe de Hotchner se rend à Memphis, dans le Tennessee, pour enquêter sur l'enlèvement d'une jeune fille à la sortie d'un supermarché. Cette dernière a été neutralisée à l'aide d'un taser par un individu qui portait un masque de cochon. Morgan doit, par ailleurs, affronter la colère de Savannah, déçue de le voir, encore une fois, s'éloigner pour son travail.

Les corps de personnes empoisonnées à l'arsenic sont découverts à Long Beach, en Californie. Aucun élément ne semble relier les victimes entre elles si ce n'est un mot - qu'elles ont toutes reçu - annonçant leur mort inévitable et imminente. Sur chaque cadavre, le meurtrier a laissé un bout de ficelle d'une longueur différente. Il semble agir selon un mode opératoire lié à la mythologie grecque.

Toute l'équipe se rend au Texas pour enquêter sur les meurtres de prostituées. Il semble que le ou les tueurs ont eu des mobiles religieux pour commettre leurs méfaits. Forcés de mener leurs investigations sous le regard de la police locale, les agents fédéraux ont quelques difficultés à recueillir les informations nécessaires. Les prostituées, encore en vie et pouvant témoigner, semblent contraintes au silence.

Au lendemain de la fusillade avec le prédicateur Mills, plusieurs personnes sont blessées ou décédées. Parmi les morts, on compte Mills ainsi que le shérif Coleman. Morgan a été touché et Reid se trouve dans un état critique. Les agents sentent désormais que les criminels se cachent au sein même de la police locale. À l'hôpital, Reid lutte pour rester en vie.