L'équipe de Hotchner est auditée par une commission sénatoriale. L'unité est soupçonnée d'avoir enfreint la loi pour venger la mort de l'agent Prentiss. Depuis la disparition de cette dernière, Morgan a travaillé d'arrache-pied pour capturer son assassin, Ian Doyle. Il finit par le localiser en suivant la trace de son fils, Declan. Après l'arrestation de Doyle, l'équipe réalise que l'enfant a été enlevé.

L'équipe se rend à Durant, dans l'Oklahoma, où deux jeunes filles ont été assassinées en l'espace de trois jours. Les victimes, blondes aux yeux bleus, ont subi des sévices sexuels avant d'être mutilées avec de l'acide sulfurique. Autre particularité : le tueur leur a fait revêtir des habits des années 80. Peu de temps après le début de leurs investigations, les agents apprennent la disparition d'une autre adolescente.

Un homme se rend dans les locaux de Synalock, une société de sécurité implantée à Charlottesburg, en Virginie, et y massacre huit personnes. Dépêchée sur place, l'équipe ne tarde pas à établir que le tueur est un professionnel et qu'il avait pour cible le patron de l'entreprise, Adam Warner. Quelque temps plus tard, Mark et Mary Dolan sont retrouvés abattus dans leur maison. Les enquêteurs relient d'emblée les deux affaires.

Le proviseur Givens est assassiné alors qu'il s'apprêtait à commémorer le massacre commis dans son lycée dix ans auparavant. A l'époque, un élève, Randy Slade, avait abattu certains de ses camarades avant de faire exploser une bombe. Rossi et Hotchner interrogent le petit frère de Randy, Brandon, aujourd'hui adolescent. Dans sa chambre, ils trouvent une liste recensant les personnes que Randy voulait tuer.

Alors que Rossi déjeune avec sa première ex-femme, un appel l'oblige à retourner au bureau : un garçon de 8 ans, Bobby Smith, a disparu depuis quarante-huit heures. Sa mère, Marlene, une dépressive chronique, vient seulement d'alerter les autorités car elle croyait l'enfant chez sa grand-mère ! Alors que l'équipe débute son enquête, Marlene est retrouvée morte et une autre disparition d'enfant est signalée ?

Sur un lac de Californie, un groupe de campeurs assiste à la remontée de trois cadavres par les plongeurs de la police. Au même moment, un des vacanciers resté sur la rive est enlevé par un individu. Son corps est retrouvé dans un autre lac de la région. Les autopsies révèlent que l'assassin a tenté de réanimer ses victimes. Bien que perturbé par la demande de son ex-femme, Rossi enquête avec l'équipe.

Après le passage d'une série de tornades, les corps de deux adolescents ont été découverts mutilés dans le Kansas. Les indices ont tous été détruits par la tempête. L'équipe se rend sur place et recherche un homme obsédé par les tornades. Dans le même temps, Jennifer est soumise à une pression importante car son fils est sujet à de fortes fièvres. Son compagnon lui reproche d'être trop prise par son travail.

Monica Kingston, une femme du groupe de soutien que Penelope Garcia anime en faveur des personnes ayant subi un drame, a disparu. La victime, dont la fille a été enlevée sept ans plus tôt, avait développé un lien d'amitié avec Penelope. Cette dernière insiste auprès des membres de l'équipe pour que tout soit fait afin de la retrouver. Elle est en effet persuadée que son amie a été contactée par l'homme qui a kidnappé sa fille.

Cinq élèves d'une école militaire sont retrouvés morts par pendaison dans les bois à l'issue d'une mission de plusieurs jours. L'administration de l'établissement pense qu'il s'agit d'un suicide collectif à cause d'une mot laissé sur les lieux. Hotchner et son équipe sont invités à traiter cette affaire en toute discrétion. Ils se heurtent rapidement à la loi du silence qui règne au sein de l'école.

Deux hommes ont été retrouvés morts, battus à mort, dans une ruelle de Philadelphie. Selon toute vraisemblance, il s'agit d'un règlement de comptes. Lorsque que d'autres meurtres similaires se produisent, l'équipe est appelée sur place. Au même moment, Jimmy, un boxeur dont le dernier combat a été difficile, fait tout pour trouver de l'argent afin de soigner son fils, qui est atteint d'une leucémie.

Un couple a été assassiné dans un parc à San Francisco. Les indices trouvés sur la scène de crime laissent penser que l'assassin est le Tueur du Zodiaque. D'autres meurtres similaires amènent l'équipe de Rossi à prendre les choses en main. Reid pense qu'il s'agit plutôt d'un imitateur particulièrement intelligent car il laisse à chaque fois des messages codés très complexes sans révéler qui en est le destinataire.

L'équipe est appelée dans le Texas pour traquer un violeur récidiviste qui s'en prend de nouveau à ses anciennes victimes. Celui-ci agit selon un mode opératoire très précis : il ligote ses proies avec des cordes de piano ce qui lui a valu le surnom du Pianiste. Rapidement, les enquêteurs soupçonnent qu'ils ont affaire à deux violeurs. Dans le même temps, Emily fait un bilan de sa thérapie avec Hotchner.

L'équipe se rend dans le New Jersey pour élucider le meurtre d'un patron de casino dont le corps a été découvert dans son bureau.Les suspects ne manquent pas mais les enquêteurs écartent vite la thèse du règlement de comptes. Lorsqu'un deuxième meurtre similaire, puis un autre, sont commis, ils tentent de définir le profil du tueur. Reid est envoyé sous couverture dans le casino pour l'identifier.

En Californie, un jeune couple découvre sur la plage le corps ensanglanté d'un homme dans une cabine de sauveteurs. Dépêchés sur place, les enquêteurs trouvent deux autres cadavres. Les trois victimes sont des maîtres-nageurs et ont été tuées de la même manière : une balle dans la tête avant d'être émasculées post-mortem. Les enquêteurs découvrent au fil de leurs recherches qu'ils avaient tous connu une récente rupture sentimentale.

Deux familles entières ont été sauvagement assassinées à leur domicile en Californie du Sud. Elles semblent avoir été victimes d'un gang mais l'enquête se révèle très vite plus complexe. Le tueur semble vouloir faire croire à des crimes racistes dans le but de réactiver la haine raciale dans la région. Les enquêteurs s'intéressent de près à un politicien dont les discours sont extrêmement ambivalents…

L'équipe s'envole pour Atlanta où deux prostituées ont été tuées à quelques jours d'intervalle. Les traces retrouvées sur elles ainsi que la similitude de leurs blessures laissent supposer qu'il s'agit d'un tueur en série qui agit selon un rituel bien précis. Les enquêteurs pensent que le criminel est un homme frustré sexuellement et qui se venge sur des prostituées. Selon toute vraisemblance, il n'agit pas seul.

L'équipe se rend à Seattle pour enquêter sur le meurtre de deux couples survenu dans leurs maisons sans qu'il n'y ait aucune trace de lutte, ni d'effraction. L'équipe tente d'établir un profil du criminel lorsqu'un troisième couple est agressé. Les recherches montrent que les victimes avaient comme point commun d'être membres d'une association de familles d'adoptants. Parallèlement, Penelope est persuadée que Kevin lui cache quelque chose.

Un adolescent quasiment à l'état sauvage est trouvé errant sur une route par une famille. Mutique et apeuré, l'enfant porte des cicatrices aux chevilles et des marques de morsure sur le corps. Derek établit un lien avec lui tandis que Garcia parvient à l'identifier et à retrouver sa mère. L'équipe cherche parallèlement un enfant qui vient d'être enlevé.Tout indique que le ravisseur est le même.

L'équipe enquête sur une femme dont le corps sans vie a été trouvé dans les locaux désaffectés d'un hôpital psychiatrique. La victime a été habillée en costume de style gothique et maquillée avec soin. Aaron a la conviction qu'il s'agit d'un rituel satanique commis par plusieurs personnes. De nouveaux cadavres sont bientôt signalés. Au fil de ses recherches, Garcia établit un lien entre les différentes victimes.

Derek est appelé à Chicago où sa sœur Désirée a été victime d'un grave accident de voiture. Celle-ci lui révèle qu'elle a été percutée au moment où elle venait de voir dans un véhicule sa cousine Cindi portée disparue depuis huit ans.Toute l'équipe rejoint Derek pour lui prêter main forte et tenter de retrouver la jeune femme. Il semblerait qu'elle soit sous l'emprise d'un homme qui a fait d'elle son esclave.

L'équipe se rend en Oklahoma où le meurtre d'une jeune femme a eu lieu. Le mode opératoire est en tout point semblable à celui du tueur en série Rod Garrett qui a récemment subi la peine capitale. Les enquêteurs pensent qu'il s'agit d'un imitateur ou d'un admirateur et décident de rencontrer sa veuve pour l'interroger. Mais bientôt, de nouveaux meurtres se produisent. Si le genre des victimes reste le même, la manière de tuer diffère.

L'inspecteur Rossi accepte de faire une conférence sur la psychologie des tueurs en série à des étudiants. Il s'appuie sur le cas d'un meurtrier qui a assassiné, selon un mode opératoire d'une violence extrême, une centaine de femmes sur une période de plus de vingt ans. Pour mieux illustrer les méthodes de travail de l'unité, tous les membres de l'équipe sont présents et exposent leur expertise respective.

Alors que tous les membres de l'équipe profitent de leur week-end, un braquage a lieu dans une banque. L'action est menée par un groupe de tueurs en série surnommés les Baccara car ils portent tous des masques représentant des cartes à jouer. Le mari de JJ est l'un des premiers à intervenir sur cette prise d'otages. La situation déjà très tendue dégénère quand plusieurs civils sont exécutés par les braqueurs.

Après l'explosion de la banque, l'équipe pénètre dans les locaux pour tenter de trouver des survivants. JJ comprend que Will s'est sacrifié pour sauver les civils. Blessé, ce dernier est emmené en voiture par Izzy et un homme présent parmi les otages de la banque, mais qui se révèle être son complice. JJ est au comble de l'angoisse lorsqu'elle découvre que les malfaiteurs détiennent son fils.