Il primo episodio della sesta stagione conclude la caccia della squadra al serial killer che terrorizza Los Angeles e che ora tiene in ostaggio la figlia del Detective Spicer della polizia di Los Angeles.

J.J. cerca di ricongiungere una famiglia alla figlia scomparsa, mentre la squadra subisce una tragica perdita.

Diverse donne vengono assassinate, e uno schema familiare suggerisce a Rossi di riesaaminare un vecchio caso che lo turba da 25 anni.

La squadra profila un serial killer che prende di mira coppie sposate.

Un serial killer prende di mira le famiglie del Midwest; Ellie Spicer fugge dalla famiglia che la tiene in affidamento e corre a trovare Morgan.

La squadra va a Detroit per catturare un killer che, da tre anni a questa parte, colpisce durante "la notte delle streghe", la festa cittadina che precede Halloween.

La squadra dà la caccia a dei serial killer in Indiana che uccidono danzatrici esotiche e scaricano i loro corpi nei campi di granoturco.

Una donna viene rapita e uccisa in un vicolo di Washington, D.C., e la squadra corre a caccia del killer prima che colpisca un'altra volta.

La squadra dà la caccia a un killer che prende di mira i bambini sul sentiero degli Appalachi.

La squadra profila un killer che prende di mira le donne in una chiusa comunità del Nuovo Messico; nel frattempo Hotch chiede aiuto a un cadetto dell'FBI.

Morgan si pente di avere aiutato un prigioniero ad ottenere la libertà vigilata, quando l'uomo uccide qualcuno pochi giorni dopo il suo rilascio.

Mentre la squadra indaga su una serie di omicidi ritualistici a Miami, Reid è colpito da forti emicranie e allucinazioni, che lo fanno preoccupare per la sua salute.

La squadra si reca a Los Angeles per indagare su alcuni insoliti omicidi in città; Prentiss svela nuovi dettagli sul suo passato misterioso.

La squadra viene convocata a New York per indagare alcune misteriose scomparse; Prentiss riceve notizie inquietanti su uno dei suoi ex colleghi all'Interpol.

Il legame di Reid con un ragazzino autistico potrebbe aiutare la squadra a localizzare i genitori scomparsi del ragazzo; Prentiss recluta due ex colleghi dell'Interpol per dare la caccia a un vecchio rivale.

Prentiss sospetta che il suo vecchio rivale all'Interpol abbia commesso una serie di omicidi, facendola preoccupare per la sicurezza della squadra, mano a mano che lui le si avvicina.

Mentre Prentiss si prepara ad affrontare una volta per tutte il suo vecchio rivale, Ian Doyle, la squadra si rivolge a un suo ex membro per trovare Prentiss e catturare Doyle.

La squadra si reca a Portland per catturare una gang di assassini prima che aggrediscano un'altra vittima.

La squadra indaga su un killer che colpisce a Tampa, mentre affronta la perdita di Prentiss.

La squadra rintraccia un assassino che perseguita studentesse del college; nel frattempo, passa sotto la supervisione di Strauss, che subentra a Prentiss.

La squadra è chiamata in una cittadina turistica del Nord Carolina dopo che una donna viene rinvenuta gravemente ferita e un'altra è dispersa.

La squadra indaga sui cadaveri ritrovati in fondo all'oceano al largo di Jacksonville; il caso coinvolge Morgan personalmente, quando sua zia ritiene che la figlia scomparsa sia una delle vittime.

La squadra indaga su un sospetto traffico di esseri umani; Hotchner accenna a cambiamenti sul lavoro mentre un membro del team torna a farsi vivo.