Da Vinci tenta salvar a vida de Lorenzo enquanto os Pazzi lideram a revolução em Florença. O plano de Leonardo para ir em busca do Livro das Folhas é frustrado pelo Conde Riario.

Leonardo usa sua inteligência para salvar Florença, enquanto o Papa Sixtus reúne forças. Já Nico tenta resistir às tentações de Riario.

Leonardo continua sua busca pelo Livro das Folhas. Enquanto isso, Papa Sisto toma medidas agressivas contra Florença, forçando Lorenzo a fazer grandes sacrifícios. Ao mesmo tempo, Lucrezia viaja para Roma para formar novas alianças.

Leonardo tenta navegar o Atlântico sem mapas. Lucrezia entra clandestinamente no Vaticano para uma importante reunião. A identidade de Lorenzo é descoberta durante sua viagem para Nápoles.

Lorenzo busca ajuda para salvar Florença em uma paixão antiga. Clarice luta para manter o controle do banco de Médici em meio a conspirações. Leonardo chega ao Novo Mundo e Segredos sobre seu passado surgem enquanto ele enfrenta problemas com os nativos.

Leonardo e Riario enfrentam desafios quando entram no Domo celeste. Lorenzo se torna parte dos jogos sangrentos do rei Ferrante. Já Lucrezia se encontra com os turcos em Constantinopla.

Leonardo e seus aliados enfrentam ameaças mortais, a cada passo na busca para o Livro das Folhas. Enquanto isso, Carlo ajuda Clarice, ao mesmo tempo no Oriente Lucrezia intriga o filho do Sultão.

Leonardo e Riario se deparam com a morte. Enquanto isso, Zoroaster e Nico planejam uma fuga. Já Lorenzo espera para conhecer o rei de Nápoles. Para completar, Bayezid busca a diplomacia em Roma.

Uma aliança inesperada é necessária para salvar a Itália do ataque otomano. Enquanto isso, Riario enfrenta o perigo, ao mesmo tempo em que Nico toma o controle do destino de Vanessa.