Rod Medicejských je napadnutý rodom Pazziovcov a pápežovými mužmi pri katolíckej omši. Mladší Lorenzov brat Giuliano nemal také šťastie a umiera pri obrane svojej rodiny. Zvyšok rodiny na čele s Clarice úspešne uteká vďaka kapitánovi mestskej stráže Dragonettim. Lorenzo je vážne ranený a uteká pod chodbami florentského kostola za pomoci Leonarda da Vinciho. Avšak varuje ho, že za jeho vzťah s Lucreziou ponesie následky. V meste začína veľká vzbura. Prívrženci rodu Medicejovcov a ich odporci.

Lorenzo sa dozvie o osude svojho brata Giuliana a chce sa okamžite dostať domov. Ale v uliciach Florencie zúri občianska vojna. Tá podporuje chaos, ktorý je pôdou potrebnou pre rod Pazziovcov, aby sa mohli ľahšie stať vládcami Florencie. Lorenzo je na dne a nevidí pre Florenciu žiadnu budúcnosť. Vanessa sa mu ale zdôveruje, že oheň jeho brata stále planie pod jej srdcom. A tak Lorenzo plánuje prehovoriť k celému mestu, aby mu dal novú nádej.

Leonardo sa pokúša získať loď pod svoju správu, ale dostáva sa do konfliktu s vojvodom Alfonsom z Kalábrie. Medzitým sa v tom istom čase v Ríme pápež rozhoduje venovať rekonštrukcii mesta. Zároveň sa dozvie, že vo Florencii opäť vládnu Medicejovci a pápežovi spojenci skončia na šibenici. A to vrátane kardinála Orsiniho. Pápež situáciu využije ako zámienku ako svojim nepriateľom zavariť a okamžite celú Florenciu exkomunikuje. To v podstate znamená, že s mestom nikto ďalší nemôže obchodovať. Medzitým sa Lucrezia ďalej pokúša dostať do Anjelského hradu a stretnúť sa so svojím otcom, pápežovým väzňom. Leonardo sa nechce len tak vzdať lode, ktorá by ho mohla zobrať na západ a podnikne poriadne dobrodružnú cestu na palubu.

Kardinál Mercuri pomáha Lucrezii dostať sa do Anjelského hradu, kde pápež drží v zajatí svoje dvojča a jej otca, ktorý je právoplatným pápežom. Leonardo, Zoroaster a Amerigo plávajú na západ do nového sveta. V jeho plavbe mu pomáhajú aj otroci, ktorým pomohol zo zajatia od vojvodu z Kalábrie. Gróf Riario je rovnako na ceste na západ. Spolu s ním aj Leonardov priateľ Nico, ktorý mu plavbu nijako neuľahčuje. Súčasne sa Piero da Vinci a Lorenzo Medicejský vydávajú do Ráma, aby navštívili samotného pápeža.

Lorenzo, Riario a jeho priatelia sú zajatcami Inkov. Ima sa prihovára Leonardovi, že ak sa chce dostať ku krypte vedenia, musí sa s ňou zaviazať na veky. Ale najskôr musí prejsť ťažkou skúškou. Medzitým je Lorenzo mučený Alfonsom, vojvodom z Kalábrie, aby z neho mohol dostať dôležité informácie. A kráľ Ferrante chce Lorenza rýchlo dostať na šibenicu.

Ima pripravuje Leonarda na cestu ku krypte. Riario nie je nadšený, že tam ide iba Leonardo. A preto presvedčí Inkov, aby tam mohli ísť spoločne. Vo Florencii pokračuje Lorenzova žena Clarice v milostnom vzťahu s Carlom Medicejským. Keď sú spolu napadnú ich neznámi útočníci, ktorí sa pokúšajú zabiť aj Vanessu. Medzitým Lucrezia v mene pravého pápeža navštevuje osmanského princa Bayezida.

Leonardo a Riario spoločne čelia tvárou v tvár smrti. V priebehu toho Zoroaster a Nico plánujú ich útek. Ippolita Sforza si vylieva svoje srdce do Lorenzovho lona. Lorenzo vidí len jednu cestu a snaží sa spojiť s Neapolom. Osmanský princ Bayezid navštevuje Rím a pápeža Sixta v snahe nájsť mier medzi talianskymi štátnymi celkami a Osmanskou ríšou. Ale pápež na nič také nechce pristúpiť. Berie princa do zajatia a ponižuje ho pred rímskym ľudom.

Leonardo sa spoločne so svojimi priateľmi plaví domov do Florencie, ktorá sa veľmi zmenila. Obsadil ju v mene pápeža Sixta Urbinský vojvoda Federico da Montefeltro. Súčasne je Lucrezia podrobená dôkladnému výsluchu zo strany Osmanskej ríše. Lorenzo Medicejský a Piero da Vinci sa konečne stretávajú so samotným pápežom. Riario prichádza pokľaknúť pred pravého pápeža, väzňa toho súčasného. Medzitým je Leonardo uväznený do väzenia, kde sa stretáva aj s Carlom Medicejským.

Leonardo je zradený zo strany Carla Medicejského, ktorý zabíja jeho majstra Verrocchia, a podpaľuje jeho dielňu. Našťastie kapitán Dragoneti zachraňuje Leonarda pred uhorením. Vanessa je rozhodnutá opustiť palác Medicejských, ale v tej chvíli príde na rad jej pôrod a narodenie dediča Giuliana a celého rodu Medicejovcov. Po ponížení osmanského princa Bayezida je vojna medzi talianskymi krajinami na spadnutie. Teraz nezostáva nič iné, iba aby sa Neapol, Florencia a ďalšie celky spojili proti spoločnému nepriateľovi, Osmanskej ríši.