דרמה היסטורית אפית העוסקת בחייו המוקדמים של אחד מגדולי האמנים- ליאונרדו דה וינצ'י, ובאנשי הצללים שניסו לעצור אותו ואת הקדמה בתקופת הרנסנס.

דה וינצ'י מתקשה לעמוד בהתחייבויתיו למדיצ'י ואף על פי כן הוא מוצא זמן לחפש את ספר העלים. שליחו של האפיפיור, ריאריו, מגיע לפירנצה ומתקבל בכבוד הראוי לו.

המאבק בין רומא לבית מדיצ'י מתלהט. דה וינצ'י מנסה לרדת לחקר המפה המסתורית. קלריס מבקשת מלוקרציה לעזור לה לשמור על שמו הטוב של בעלה.

הרוזן ריאריו מאיים בפלישה לפירנצה ותוקף את מכרות האלום. לורנצו מבקש עוד נשק לחיזוק העיר. בקי ממתין למותו על גלגל העינויים.

פיירו דה וינצ'י מוצא את עצמו כסנגורו של בנו המואשם במעשים מגונים ובכפירה. גם החברים נחלצים לעזור.

לאונרדו יוצא לשחרר את החבשי מידי שליט טרנסילבניה, ולאד השלישי. לורנצו דה מדיצי מחפש בעל ברית שיפעל עמו נגד רומא. קלריס אשתו משתדלת להרות וללדת לו יורש.

פרק סיום העונה. הרוזן ריאריו ומשפחת פאצי סוגרים את המלכודת על בני מדיצ'י. דה וינצ'י מתכונן לצאת למסע, אבל האירועים מעכבים אותו בעיר.