Leonardo kann die Leiche des Gehängten an sich bringen und findet merkwürdigerweise in ihr einen Schlüssel und einen abgerissenen Fingernagel. Eine weitere Spur führt ihn schließlich zu einem Buch in hebräischer Sprache mit 27 Bildern, die, richtig angeordnet, ein unbekanntes Land mit dem Himmelszelt darstellen. Unterdessen hat er für die Medici eine Wunderwaffe entwickelt, eine Art Maschinengewehr, das jedoch noch nicht voll einsatzbereit ist. Rom und der Papst versuchen, die instabile politische Lage zwischen den italienischen Stadtstaaten für sich auszunutzen, und bedrohen Florenz, da die Stadt am Arno über kein Heer verfügt …

Riario erörtert seine Niederlage mit dem Papst und einem mysteriösen Gefangenen. Fälle von dämonischer Besessenheit in einem Kloster werden den Medicis zugeschrieben, doch Leonardo macht sich auf die Suche nach einer rationalen Erklärung.

Becchi wird verhaftet und beschuldigt, ein Spion Roms zu sein. Die Armeen Roms und Florenz’ stehen sich gegenüber und Leonardo offenbart seine neueste Waffe.

Lorenzo beauftragt Piero da Vinci, seinen unehelichen Sohn Leonardo, mit dem er zerstritten ist, vor Gericht zu verteidigen. Doch während einer Darbietung anlässlich eines Besuchs am Königshaus überrascht Leonardo den korrupten Richter. Zurück in seiner Werkstatt angekommen, wird Leonardo von dem Türken erwartet.

Ein Hinweis des Türken zum Buch der Blätter führt Leonardo in die Walachei, wo er auf Vlad Dracula trifft. Lorenzo und Piero treffen den Herzog von Urbino. Die Suche nach dem wahren Spion geht weiter.

Leonardo konstruiert einen Unterwasseranzug und nutzt den Weg über die Kanalisation, um in den Vatikan zu gelangen, wo er den Papst und den mysteriösen Gefangenen trifft. Giuliano enthüllt die wahre Identität des Spions von Rom.

Die Pazzis planen, Lorenzo und Giuliano am Ostersonntag zu ermorden. Der Türke erzählt Leonardo, wo er das Buch der Blätter finden kann. Lucrezia legt ein Geständnis ab, während Leonardo alles daran setzt, die Medicis zu retten.