Una ragazza di sedici anni, Amanda, volontaria nella Care First, un'associazione che si prende cura dei senzatetto, sparisce improvvisamente. Il clamore del caso finisce per coinvolgere la Crimini Maggiori. Presto viene ritrovato il corpo della ragazza, malamente occultato nel seminterrato della vecchia casa dei suoi genitori.

Un corpo decapitato viene ritrovato insieme ad un video dell'esecuzione in stile ISIS. Il team si scontra con gli investigatori federali sulla giurisdizione. Sharon, Rusty e Gus discutono questioni di famiglia. Buzz vede il video dell'omicidio del padre e dello zio.

Mentre sta visionando una potenziale casa da comprare, Flynn (con Provenza e Buzz) scopre una donna assassinata, un'agente immobiliare, galleggiante in piscina. Tra i sospettati ci sono il suo chirurgo plastico e il suo dentista. Provenza dà a Buzz alcuni fascicoli di crimini simili a a quello dell'omicidio del padre e dello zio a un bancomat. Flynn, Sharon e Rusty rivedono la casa insieme e decidono che non va bene.

Mentre Julio lavora per diventare un padre adottivo, finisce indagato da un assistente sociale per il metodo sorprendente ideato per catturare il killer di un brutale omicidio.

La squadra indaga su una rapina apparentemente casuale e sull'uccisione del marito di una coppia britannica in vacanza. Provenza dà consigli a Buzz riguardo alle indagini sugli omicidi del padre e dello zio. Rusty e sua madre si riconciliano.

Un uomo che sta vivendo un momento di grave difficoltà (Jere Burns) inizia ad uccidere persone del suo passato che crede gli abbiano fatto torto. Rusty lavora su impronte digitali per l'indagine di Buzz.

Un'ex star bambina che sta riavviando la sua carriera muore e Flynn indaga per fare un favore a sua figlia; Buzz rimugina su come procedere nella sua indagine sull'omicidio di suo padre e dello zio, mentre Rusty prende una decisione per quanto riguarda la gravidanza di sua madre e raggiunge un nuovo traguardo nel suo rapporto con Gus. Stephanie Courtney fa un'apparizione cameo come medico amorale.

La squadra indaga sull'omicidio di un avvocato divorzista con i sospetti che vanno dalla moglie ad una prostituta che possedeva un collegamento sorprendente con la vittima; gli sforzi di Buzz per trovare l'assassino di suo padre, infine, ottengono un risultato; a Julio viene affidato Mark Jarvis, un bambino fastidioso.

L'indagine della squadra sull'omicidio della madre di Mark porta ad una organizzazione criminale (la Fratellanza di Zyklon) che pianifica di iniziare una guerra razziale. Buzz e Provenza interrogano uno dei due uomini sospettati di aver ucciso il padre e lo zio di Buzz.

Il processo per omicidio di un suprematista bianco prende una svolta terrificante quando l'imputato afferra una pistola (che si pensava scarica) introdotta in aula come prova ed uccide diverse persone, tra cui il vice capo Taylor, prima di essere a sua volta ucciso da Sharon. La squadra cerca di determinare chi possa aver cospirato per rendere possibile la sparatoria e per distruggere la Fratellanza di Zyklon. Buzz continua ad indagare sugli omicidi del padre e dello zio interrogando un testimone.

La squadra continua la sua indagine sulla cospirazione che ha permesso la sparatoria in tribunale e su una possibile connessione di famiglia con Dwight Darnell; l'indagine di Buzz porta al nome dell'assassino di suo padre e dello zio.

Il team è in grado di chiudere la Fratellanza di Zyklon, ma deve ancora rintracciare la vera mente dietro la sparatoria in tribunale; il nuovo figlio adottivo di Julio, Mark, viene affidato ai suoi nonni, cosa che porta ad un addio commovente; con l'aiuto di Rusty, Buzz è in grado di identificare e arrestare l'assassino del padre e dello zio, che confessa il reato; tuttavia, l'uomo ha una famiglia, cosa che lascia Buzz alquanto disturbato; Fritz Howard pensa di prendere il lavoro di Taylor; alla fine della puntata, Andy crolla per un apparente attacco di cuore.

Andy è sopravvissuto al suo attacco di cuore ed è tornato a lavoro. La squadra indaga su un omicidio brutale avendo il fiato sul collo del nuovo Vice Capo (Camryn Manheim); nel frattempo Buzz riceve una lettera angosciante, Sharon riceve notizie angoscianti su un vecchio nemico e Rusty si preoccupa sul suo futuro con Gus.

La squadra indaga su un omicidio che la porta a un gruppo di pedofili. Rusty deve fare i conti con le conseguenze della sua decisione riguardante Gus e le implicazioni del perché ha preso quella decisione.

Un caso di omicidio si mette male quando l'avvocato difensore Linda Rothman riesce a distruggere la credibilità della detective Amy Sykes in tribunale. La Rothman ha come investigatore della difesa Mark Hickman, una vecchia nemesi di Amy.

l corpo di un uomo molto pesante viene trovato su un albero a più di 12 metri di altezza, il dottor Morales arriva sulla scena del crimine con il padre, un detective in pensione da Uruguay. Nel frattempo, Julio Sanchez cerca di ottenere la tutela legale di Mark Jarvis mentre Andy Flynn prepara una sorpresa speciale per Sharon.

L'agente in pensione, Mary Conrad, viene colpita mortalmente alla testa con un pesante oggetto in cui e' incastonato il suo distintivo da poliziotto. Provenza e Mary nel '73 erano stati compagni di corso all'Accademia di polizia, ma lui non riesce proprio a ricordarla.

Will Sax, un giovane studente di legge, viene ucciso da un'auto pirata mentre tornava a casa in bicicletta. Gia' dai primi rilevi della scientifica, la Crimini Maggiori si rende conto che non si e' trattato di un incidente, ma di un omicidio. Dalle indagini emerge che, dieci anni prima, Will aveva ucciso in un incidente d'auto un ragazzo...

L'omicidio di un uomo dai lontani trascorsi di piccola criminalita', per poco non si trasforma in una strage di poliziotti. Mentre, infatti, gli agenti intervengono in forze sulla scena del crimine, qualcuno fa esplodere una bomba che uccide una giovane poliziotta e ferisce alcuni dei presenti.

Dopo l'esplosione al cimitero, i detective della Crimini Maggiori sono certi che le bombe non siano opera di terroristi, ma dell'ex marine Cristian Ortiz, assetato di vendetta nei confronti dell'ex moglie Liseth, che lo aveva incastrato per l'omicidio del suo fidanzato. Ma non e' tutto...