艾瑪、瑪麗瑪格麗特、大衛、雷吉娜、戈登先生和虎克進入夢幻島尋找被綁架的亨利，他們碰到一群不太友好的美人魚，這些美人魚恐嚇他們說要在搜尋開始之前就將其結束；在從迷失男孩們手裡逃跑時，亨利發現自己在和一個從彼得潘營地逃出來的男孩一起逃跑；為了解艾瑪和亨利一家的命運，傷癒歸來的尼爾與穆蘭一起穿越了魔法森林。

就在艾瑪、瑪麗瑪格麗特、大衛、雷吉娜和虎克繼續在夢幻島尋找亨利的時候，彼得潘出現在驚慌的艾瑪面前，並向她提供了一張地圖，這張地圖將揭示她兒子的下落。但讓地圖上出現的唯一方法就是艾瑪停止否認她的真實身分，並接受自己對自己身分的真實感受。戈登先生從一個朋友那裡得到一些意想不到的建議，這些建議將使他理解在夢幻島的旅程。與此同時，在童話世界裡，邪惡女王答應讓白雪公主和白馬王子平靜地生活，但是要求她放棄王位，白馬王子則盡力要讓白雪公主拒絕這個要求。

為了繼續尋找彼得潘的藏身之處並拯救亨利，虎克建議找到奇妙仙子，希望她能把他們直接帶到他的營地。彼得潘向亨利透露了他把亨利帶到夢幻島的原因。在魔法森林裡，尼爾計劃把自己送到艾瑪身邊，這需要使用羅賓漢最珍貴的東西之一。與此同時，在童話世界裡，奇妙仙子提出可以幫助雷吉娜改善她的生活。

戈登先生決定與潘當面對峙，但他是去救亨利，還是屈服于關於這個男孩會毀掉他的預言呢？尼爾發現自己又回到了夢幻島，被一名忠誠于潘的迷失男孩看守著。隨著毒性深入，大衛掙扎在生死邊緣掙扎。與此同時，在童話世界裡，侏儒怪正在尋找失蹤的貝爾，他被一個用音樂拐走小孩的神秘之人帶走了。

致命的夢影之毒在大衛體內擴散使他危在旦夕，虎克帶他最後一程，去找一個六角儀，這個六角儀可以解密那張可以他們離開夢幻島的地圖。與此同時，在童話世界裡，基利安鐘斯（又名虎克）和他的兄弟利亞姆船長受國王之命揚帆起航，去一片未知之地尋找一種強大的土生植物，它可以醫治百病。

在童話世界裡，愛麗兒在深海中救出溺水的白雪公主，作為回報，白雪公主讓她的新朋友結識了埃里克王子，從此她瘋狂愛上了王子。與此同時，艾瑪、瑪麗瑪格麗特、大衛和虎克試圖拯救被囚禁在潘營地裡的尼爾。雷吉娜和戈登先生不情願地合作去設法打敗潘。

戈登先生和雷吉娜讓愛麗兒帶著一件物品回到童話鎮，這件物品可以讓貝爾找到一件可以幫助打敗潘的藏物。但他們不知道的是，有兩個人闖入了小鎮，並企圖不惜一切代價阻止他們的行動。與此同時，艾瑪、尼爾和虎克試圖找到彼得潘影子居住的暗幽谷，以便捕捉他的影子。因向她隱瞞他中毒的事情，瑪麗瑪格麗特對大衛非常生氣。

潘把亨利帶到一個祕密的洞穴，在那裡他讓亨利相信，只有他自己才能拯救魔法和夢幻島。隨著艾瑪、瑪麗瑪格麗特、大衛、雷吉娜、戈登先生和虎克努力拯救亨利並發現他們就在通往潘藏身之處的路上，一場善惡決戰即將展開。與此同時，回到童話世界，年輕的侏儒怪得到了一件魔物，可以幫助他與不稱職的父親重新開始。

亨利命懸一線，阻止潘從最忠實信徒之心獲得強大魔力的行動正在展開。與此同時，在童話鎮，雷吉娜決定彌補生活中的空虛，並在戈登先生的幫助下，去收養一個嬰兒。

童話鎮的居民們正為亨利和我們的英雄們從夢幻島凱旋而欣喜若狂，但是隱藏很深的潘在祕密實施一場陰謀，這將讓小鎮居民的生活天翻地覆。與此同時，在童話世界裡，因為要去尋找一個可以阻止雷吉娜前進的神秘生物，白雪公主和白馬王子的蜜月一點也不浪漫。

在冬季最後一集中，阻止潘對童話鎮居民施下另一個詛咒的行動正在展開，這個詛咒讓居民失去真實的靈魂。

在侏儒怪犧牲性命來阻止潘施下另一個詛咒之後，雷吉娜消除了她最初的詛咒，這個詛咒抹去了童話鎮的存在，讓童話鎮的居民們回到了童話世界。而艾瑪和亨利則回到了我們的現實世界，他們也沒有了童話鎮的記憶。然而，在魔法森林裡，一切都不太順利。虎克來到紐約拜訪艾瑪，試圖喚醒她的記憶，讓她再次幫助童話故事中的家人和朋友們擺脫絕境。

艾瑪和亨利來到童話鎮，與她的朋友和家人團聚，卻發現沒有人記得他們是如何回到鎮上的，或者他們過去一年在童話世界裡度過的時光。但是艾瑪確信鎮上有人要為這個新的詛咒負責，並與雷吉娜一起試圖揭開他們的身分。與此同時，在過去的一年裡，在羅賓漢的幫助下，雷吉娜試圖闖進她那已經被邪惡女巫佔領的城堡。

當艾瑪、大衛、雷吉娜和虎克繼續尋找邪惡女巫時，相反的，邪惡女巫正在為大衛策劃一個黑暗的驚喜。她在策劃下一個針對鎮民的行動，而那名塞琳娜的囚犯在她的監視下是無能為力的。與此同時，在前一年的童話世界裡，白馬王子偶然發現了被困在高塔里的長髮公主，為了讓她獲得自由，他必須幫助她直面恐懼。

尼爾發現自己又回到了童話鎮，他渴望能和他兒子亨利重聚，亨利對他父親的記憶已經消失了。尼爾同時也在努力尋找自己的父親——侏儒怪，他剛得知他還活著但失蹤了。雷吉娜發現自己和羅賓漢可能有關聯。與此同時，在前一年的童話世界裡，為父親之死而痛不欲生的尼爾，在貝兒和被施了魔法的蠟燭人盧米埃的幫助下，試圖找到神奇魔法來讓侏儒怪起死回生。

在侏儒怪成為她的奴隸後，塞琳娜向雷吉娜發起生死決鬥。她們之間的家族關係浮現出來後，這讓邪惡女王倍感震驚。全體鎮民一起將尼爾埋葬了。與此同時，在從前的奧茲國，當充滿嫉妒心的塞琳娜發現她有一個妹妹雷吉娜，並且侏儒怪正在訓練她成為一股不可小覷的強大力量後，塞琳娜請求巫師把自己送到童話世界。

愛麗兒回到童話鎮，懇求虎克幫她找到埃里克王子。新詛咒生效後，王子再也沒有回到鎮上。艾瑪同意讓雷吉娜教她如何使用魔法，以使她打敗塞琳娜。因為亨利覺得他倆無趣，瑪麗瑪格麗特和大衛試圖證明他們也能帶來虎克帶給他的那種歡樂。與此同時，在過去一年的童話世界裡，憤怒的愛麗兒因為失蹤的埃里克王子而與虎克對質，她認為埃里克是被那個黝黑的海盜綁架並殺害的。但當虎克坦白海盜旗被偷了，而埃里克很可能是竊賊的俘虜時，愛麗兒在不知情的情況下向他提供了誰是罪魁禍首的線索。於是虎克帶著愛麗兒出發尋找他的船。

在塞琳娜偷走她的心臟後，雷吉娜施了一個咒語，這樣她就可以與在另一個國度的亡母柯拉對話，從而發現她拋棄塞琳娜的真相。而貝兒則無意中發現了塞琳娜大費周章的最終目的。與此同時，在童話世界裡，年輕的柯拉被一個自稱是王子的男人欺騙，最後留下她一個人孤零零的，還懷了孕。但與真正王子的邂逅可能會讓柯拉過上她渴望已久的王室生活，但她必須保守懷孕的祕密，否則可能會失去一切。

塞琳娜威脅虎克，讓他用自己遭到邪惡女巫詛咒的嘴唇去親吻艾瑪，否則她就殺死亨利。但是這個吻會耗盡艾瑪的一切魔力。雷吉娜和羅賓漢之間的感情也在加速升溫。與此同時，在去年的童話世界裡，白雪公主和白馬王子決定去尋找南方善良女巫格琳達，期望女巫能幫助他們打敗塞琳娜。將所有童話人物送回童話鎮的詛咒終於被某人施放，但誰沒料到是這個人。

瑪麗瑪格麗特即將臨產，孩子隨時可能出生。童話鎮的居民們高度警惕，以確保塞琳娜無法偷走她的新生嬰兒，否則她將穿越時間並改變她的命運，這樣的話雷吉娜將不復存在。與此同時，在以前的奧茲國，格琳達試圖說服塞琳娜與她的邪惡天性作鬥爭，並加入由她和她的姐妹女巫們組成的奧茲國守護者行列。但是一個來自堪薩斯州的年輕女孩可能會導致塞琳娜的毀滅。

就在瑪麗瑪格麗特和大衛在老奶奶餐廳舉行的加冕禮上為他們的兒子命名的時候，艾瑪和虎克掉進了塞琳娜開啟的時間傳送門，一起回到了詛咒發生之前的魔法森林。但在尋找返程之路的過程中，他們必須小心謹慎，絕不能做出任何改變，也不能冒險改變朋友和家人的生活，以及他們自己本身。