秘密のレシピを巡って、今までに何度となく争いを繰り広げてきたカーニさんとプランクトン。はたして、その争いの原因は何だったのか。それは1人の小学生時代にまでさかのぼる。昔、ビキニタウンで唯一のバーガーショップといえば「スティンキーバーガー」。子供たちに大人気のお店だった。スティンキーはおいしいバーガーを作り、子供たちに尊敬され、お金持ちになった。

プランクトンがこのところ秘密のレシピを盗みに現れない。不審に思ったカーニさんはスポンジ･ボブとパトリックにプランクトンの様子を探るためにスパイになれと命じる。

今回はパフ先生の「運転マナー講座」。良いドライバーと悪いドライバーを例に挙げて、運転のマナーについて学んでいく。

リピーター客を増やすには、お客さんの名前を覚え親近感を持たせることだと考えたカーニさんはコンテストを開催。

カニカーニに大物料理評論家が来ることに。その評論家とはテレビなどで自分のコーナーを持つほど有名なジーン・ホタテ。スポンジ・ボブは緊張のあまり固まってしまう。そのジーン・ホタテがやってきた。イカルドの素っ気ない応対にすぐさま帰ろうとした。

　平穏に過ごしたいイカルドに、またもや邪魔が入る。イカルドと一緒に仲良く遊びたいスポンジ・ボブは何度もイカルドの家を訪ねるのだが、そのつど断られる。そこでスポンジ・ボブは、いつでも遊べるように自分だけのイカルドを作ろうと決心。そして木で「ミニ・イカルド」を完成させた。すっかり仲良しになったミニ・イカルドは、スポンジ・ボブと一緒にカニカーニへ行き、一緒に働くことに。

大好きなカニカーニに早く行くには早く寝ることが一番だと考えたスポンジ･ボブ。でも目がさえて眠れない。その翌日、やはり寝坊をして遅刻してしまった。このままではクビになると不安にかられスポンジ･ボブはカニカーニで寝泊りすることに。

ビキニタウンの町中が凍りつくような寒い日。カニカーニの店内も冷え切っている。なぜならカーニさんは暖房費までケチり誰にも温度調節器には指一本触れさせないからだ。

いつものようにカーニバーガーを作っていたスポンジ・ボブは、そのうちの0つに恋をしてしまった。そして「パティちゃん」という名前までつけた。あまりの愛おしさに、どうしてもお客さんに食べさせたくないと悩んだ末、家に連れて帰ってしまった。

イカルドのことが大好きなスポンジ・ボブ。一緒に日の出を見ようと、パトリックを連れて毎朝イカルドの家へ行く。だがイカルドは、うっとうしくてたまらない。

遊園地「グローブワールド」に新しいアトラクションが登場した。その名も「炎のげんこつコースター」。どこよりも巨大で早く、そして乗った者は皆、背骨が抜けてしまうという、とっても痛いジェットコースターだ。スポンジ・ボブとパトリックは一番乗りしようと張り切っている。

カニカーニのフライ係第0号 ジムが、純金製のリムジンで現れた。ジムはかつてカニカーニの「最高の従業員で賞」を取っているほど優れたフライ係である。カニカーニを辞めたあと、世界中の一流店で修行を積み、今では優雅な引退生活を送っているというのだ。

ある夜、恐怖小説を読んでいたスポンジ・ボブは、あまりの怖さに一睡もできなかった。翌朝、カニカーニに出勤してからも、昨夜の後遺症で暗闇を極端に嫌がる。

おカネが大～好きなカーニさん。どうしても愛するおカネちゃんたちと話がしたくてたまらない。そのためなら何でもすると叫んだとたん、さまよえるオランダ人が登場し、「お前の魂をくれるなら望みをかなえてやる」と言う。

今回は海賊パッチーが、とっておきの面白い物語を聞かせてくれる。驚くべき速さでカーニバーガーを作るミラクルマシンとスポンジボブの戦いの物語だ。

ビキニタウン･ダンス大会が開催される。ダンスが大好きなイカルドは優勝を狙いそのトロフィーを飾るためのケースまで作っていた。

科学の大会に出場するためにテキサスへ行ったサンディが、もうすぐ帰ってくる。スポンジ･ボブとパトリックは「おかえりなさいパーティー」をするため、ケーキやプレゼントを用意する。

スポンジ・ボブとのパーティーで大騒ぎし、スポンジ・ボブの家で寝てしまったパトリック。目を覚ましてみると、スポンジ・ボブの手においしそうなドーナツが。どうしてもそのドーナツが欲しくなったパトリックは、スポンジ・ボブの手からもぎ取り、内緒で自分の家へ持ち帰ってしまった。だが、いざ食べようとすると…

カニカーニの閉店時間。片づけを終えて帰ろうとした時、どんなに洗っても落ちてくれないお皿が1枚。そこでスポンジ･ボブは「汚れピカピカ･マシーン6000」なるものを作り、しつこい汚れに挑む。

今日はパフ先生のボート教習所で記念写真を撮影する日。スポンジ・ボブはおめかしして行きたいと思っている。いつもより念入りに身支度をし、家を出た。家を一歩出たとたん、海草が落ちてきて服が汚れてしまう。さっそく家に戻り、また一から身支度をする。

パトリックの様子がおかしい。以前にも同じ症状を見たことのあるスポンジ・ボブには、すぐに分かった。パトリックはカーニバーガーの禁断症状で苦しんでいるのだ。

ある日、スポンジ・ボブのもとへ一通の手紙が届いた。送り主は罪を犯し刑に服していた、いとこのブラックジャック！

女性の悲鳴が聞こえ助けに駆けつけたスポンジ・ボブ。そこに立ちはだかるクレイジーフィッシュ。その大男と戦うことになり...というところでスポンジ・ボブは目が覚めた。朝、スポンジ・ボブは身支度のため歯磨きをしようと思ったが、ふたがなかなか開かない。

スポンジ・ボブのアイデアで、マーメイドマンとフジツボボーイがカニカーニのCMに出演。これが大当たりし、カニカーニは連日大盛況。

カニカーニを、わずかな量の食事で高い料金を取れる高級レストランにすべくカーニさんが「シェフ交換プログラム」を実施。よその高級店から一流シェフがカニカーニにやってくる。

突如、スポンジ・ボブの体に吹き出物ができた。ニキビだと思って薬を塗ったが、なかなかかゆみが収まらない。実はこれ、カビだったのだ！カビはどんどん増殖し、スポンジ・ボブの体はカビだらけに。かゆくてかゆくてたまらない。

いつものようにしゃぼん玉遊びをしているスポンジ・ボブとパトリック。ひょんなことからキラキラかがやく金属のかけらを発見。ビキニタウン自然博物館へ行って調べてみると、それはなんと失われた都市、アトランティスの魔よけのかけらだった！アトランティスは道路が黄金で作られ、ダイヤモンドの街灯があるという。そしてアトランティス人は芸術性に優れ、豊かな財力があり、最先端の科学技術を持ち、高度な武器を備えている。

「太陽の島」でキャンプが行われることになり、パトリックをつれて参加することにしたスポンジ・ボブ。だが船着場で別の船に乗り込んでしまった。それは囚人たちを「地獄の島」に輸送する船。その船には恐ろしい鬼の刑務所長が乗船していて、騒ぎ立てるスポンジ・ボブとパトリックにいろんな罰を与える。

カニカーニでスポンジ・ボブが勢いよく開けたドアに顔がぶつかり、イカルドは大ケガをしてしまった。イカルドはすぐさま病院へ運ばれ、手術が行われた。手術から1週間後、イカルドの顔の包帯を取る日がやって来た。包帯を取ったイカルドの顔は、ものすごくハンサムだった！

親友の証になるような服を探していたスポンジ･ボブとパトリックは、おそろいの軍服を着ている戦争再現者たちに出会う。彼らは「ビキニタウンの戦い」の再現イベントに参加していたのだ。

カニカーニに、ミス･グリッスルプスと仲間たちが食事にやってきた。彼女たちは「愉快でおいしいものに反対する魚類組織連合」のメンバー。愉快でおいしいものは許せないと言うのだ。スポンジ･ボブが、カーニバーガーがどれほどおいしくて愉快なものかを話す。

ある強風が吹く日のこと。風が吹くとスポンジ・ボブの空洞から音が出ることが分かった。その音はクラゲたちのお気に入りだった。そのためクラゲたちにまとわりつかれ、スポンジ・ボブはおちおち仕事もできずにいた。そんな時、突風のためカニカーニの屋根が飛ばされた。もちろんスポンジ・ボブも飛ばされてしまった。それでもクラゲたちが追ってくるため、スポンジ・ボブは洞窟に隠れることに…

スポンジ･ボブとパトリックがクラゲ遊びをしていた時、地面に埋まった船を発見。それを見たカーニさんは「これを使ってカニカーニの移動レストランを始める」と言いだした。しかも、「売れなければ帰ってくるな」と。

シャームおじさんから、いとこのスタンリーの世話を任されたスポンジ･ボブ。スタンリーは、触る物すべてを壊してしまうという厄介者だった。

サバイバルキャンプに行くサンディのことが、うらやましくてたまらないスポンジ・ボブとパトリック。一緒に連れて行ってと頼むが、弱虫な2人に「食うか食われるか」の世界では生き残れないと考えたサンディは、一緒にいくことを拒む。そこで2人はこっそりとサンディのジープの荷台に乗りこみ、内緒でついていった。だが途中でジープから落ちてしまう。