En enquêtant sur un cambriolage, les ninjas découvrent "Premier Empire", un jeu vidéo inédit qui prend le contrôle de tous les autres jeux de Ninjago.

Les ninjas font le lien entre la disparition de Jay et Premier Empire et se rendent sur l'île Dyer pour interroger le créateur du jeu, Milton Dyer.

Cyrus Borg découvre un secret étonnant concernant Premier Empire. Les ninjas combattent le Mécanicien dans le but d'atteindre le niveau treize.

Le ninjas, perdus dans Premier Empire dont ils ignorent toutes les règles, tentent de trouver Jay en échappant aux sbires d'Unagami.

Dans l'une des zones de jeu, un samouraï dénommé Okino est en pleine crise existentielle, après avoir échoué à mener ses maîtres à la victoire.

Pour arrêter Unagami, les ninjas doivent se procurer trois Key-tanas. Le premier se trouve à Terra Karana, l'une des zones les plus dangereuses du jeu.

Les ninjas arrivent aux falaises de l'Hystérie et voient qu'Unagami change les joueurs en cubes d'énergie pour bâtir un portail vers le monde réel.

Toujours à Terra Karana, Okino doit choisir entre aider ses alliés, les ninjas, ou obéir aux ordres d'Unagami, son maître.

C'est bientôt le Grand Prix des Cinq Milliards. Lloyd rencontre Numéro 7, une pilote chevronnée qui pourrait bien être la clé de la réussite.

Les Visières Rouges, les soldats d'Unagami, trouvent le garage secret de Scott et attaquent les ninjas.

Les ninjas ont à peine le temps de pleurer la disparition de leurs amis, qu'ils doivent se mettre en route rapidement pour Terra Domina.

À Ninjago City, Zane et Pixal arpentent la ville à la recherche de Milton Dyer et découvrent que les apparences sont trompeuses.

Zane, kidnappé par le Mécanicien, se retrouve face à Unagami alors que Pixal demande à Milton Dyer comment arrêter Premier Empire

Jay se retrouve seul face à Unagami, tandis que celui-ci se prépare à découvrir la vérité sur son identité.

Unagami arrive dans le monde réel et sème la terreur sur Ninjago City. Jay, Zane et Pixal tentent d'éviter le pire en réunissant Unagami et Dyer.