Vụ mất cắp Mắt Trái của Độc Quỷ Vương làm gián đoạn quá trình tập luyện của Rin. Để bảo vệ Mắt Phải, các pháp sư trừ tà đến Kyoto.

Đến Kyoto, cả nhóm hướng tới nhà trọ của gia đình Suguro. Hầu hết các nhân viên của văn phòng khu vực đều bị thương, và tất cả mọi người bị nghi ngờ.

Yaozo tổ chức một cuộc họp để cố gắng tìm ra kẻ phản bội trong Giáo phái Myoda, và mọi nghi ngờ đổ dồn vào Tatsuma — bố của Suguro.

Suguro thấy Juzo bước vào Hầm Giam, và tình cờ nghe thấy Mamushi tuyên bố cô cùng phe với Todo. Suguro vẫn còn nghi ngờ bố mình.

Rin bị tống vào nhà tù biệt giam. Tại đó, Yukio đọc cho cậu một lá thư từ Tatsuma. Với việc cả hai Mắt đều đã bị đánh cắp, Yaozo triệu tập một cuộc họp.

Lá thư của Tatsuma kể lại câu chuyện về cách Fujimoto có được Thanh kiếm Koma nhiều năm về trước. Ở hiện tại, Todo và Mamushi đã đến Nhà nguyện Goma.

Độc Quỷ Vương sống lại và Vatican kết án tử cho Rin. Các bạn học cố gắng giải thoát cậu, và tất cả phụ thuộc vào Shiemi.

Khi chướng khí lan rộng khắp Kyoto, tất cả mọi người đều hướng đến Rakuhoku. Rin và các bạn học tìm kiếm Tatsuma, và Yukio chạm trán với Todo — lúc này đã thay đổi.

Todo khiêu khích Yukio về cảm xúc thật của cậu đối với anh trai mình. Suguro chấp nhận thỏa thuận với Goha-en, đồng thời cậu và Rin tìm kiếm Độc Quỷ Vương.

Độc Quỷ Vương xuất hiện khi nhóm tiếp viện đến hỗ trợ Yukio. Suguro, Rin và Kuro bị mắc kẹt trong kết giới và Rin không thể rút thanh kiếm ra.

Todo không thể phân rã. Mặc dù Rin đã rút được Thanh kiếm Koma, nhưng Độc Quỷ Vương lại quá mạnh. Khi mọi chuyện dường như đã không còn hy vọng, Ucchusma xuất hiện.

Ngọn lửa xanh của Rin giúp thanh tẩy khu vực. Tàn cuộc, mọi người đi tham quan, nói chuyện chân thành và bàn về tương lai của Rin.