Politiaspirant Vilhelm Beck er på sit første praktikophold, da han bliver kaldt rutinemæssigt ud til et indbrud. På gerningsstedet findes en død 17-årig dreng, og sagen bliver straks overdraget til Beck-gruppen.

En far til to bliver skuddræbt på en tankstation. Samtidig er Josef suspenderet efter et sammenstød med sikkerhedspolitiet. Klas Fredén, nyudnævnt Säpo-chef, tilbyder at hjælpe ham, men det har en pris. Det bliver en aftale, som får store konsekvenser for både Josef og Klas - og for hele gruppen.

I Beck – Dødvande findes en kriminel mand brutalt myrdet i sin lejlighed. Han var kendt for sin medvirken i et stort røveri af en pengetransport, hvor udbyttet aldrig er fundet, selvom alle indblandede blev grebet. Men under drabsefterforskningen tager alt en chokerende drejning for politiet, da en af deres egne forsvinder.