从言峰教会逃出的Saber和士郎回到卫宫邸时，看到浑身是血倒下的凛的身影。被言峰意外地带走了作为圣杯容器的依莉雅。发誓要破坏灾难元凶圣杯的Saber和士郎，前往成为降灵地的柳洞寺，面对吉尔伽美什和言峰的最后一战！

Efter hændelsen ved kirken, Saber og Shirou vende hjem blot for at finde Rin på gulvet og hårdt såret. Det viser sig at Kirei Kotomine overfaldt hende, mens Shirou og Saber blev besat, og det er ikke alle, fordi han også har taget Ilya og har planer om at gøre hende det offer for den hellige gral. Hjulpet med Rin endelige rådgivning, de begge hovedet til Ryudouji hvor Kirei kommer til at indkalde den hellige gral. Saber vil kæmpe igen med Gilgamesh og Shirou bliver nødt til at forlade hende og beskæftige sig med Kirei, der tydeligvis har en form for personlig vendetta mod Shirou.The sidste kamp er først lige begyndt.

After the incident at the church, Saber and Shirou return home only to find Rin on the floor and badly injured. It turns out that Kirei Kotomine attacked her, while Shirou and Saber were occupied and that's not all because he has also taken Ilya and plans to make her the sacrifice for the Holy Grail. Aided with Rin's final advice, they both head to Ryudouji where Kirei is going to summon the Holy Grail. Saber will battle again with Gilgamesh and Shirou will have to leave her and deal with Kirei, who obviously has some sort of personal vendetta against Shirou.The final fight has just begun.

En revenant à la maison, Saber et Shirou découvrent Rin grièvement blessée suite à la visite de Kotomine. Celui-ci a enlevé Ilya pour en faire le réceptacle du Saint Graal et s'est replié au temple Ryuudouji. Avant de sombrer dans le coma, elle leur donne quelques conseils. Le Maître et le Servant se rende sur la colline, prêt pour l'ultime affrontement qui, une fois terminé, les séparera à tout jamais...

言峰教会から脱出したセイバーと士郎が衛宮邸に戻ると、そこには血だらけで倒れている凛の姿があった。言峰に不意をつかれ、聖杯の器とするイリヤを連れ去られたのだ。災厄の元凶である聖杯を破壊すると誓ったセイバーと士郎は降霊の地となる柳洞寺に向かう。しかし、聖杯を失えば戦いの結果にかかわらず、セイバーはこの世から消滅してしまう。一瞬の迷いが士郎の脳裏をかすめるが、迷いを振り払い、二人は最後の戦いに臨むのだった。そしてセイバーとギルガメッシュ、士郎と言峰、それぞれの宿敵との決戦の火蓋は切って落とされた。

고토미네는 시로의 집으로 찾아가 린을 공격하고 성배의 제물로 쓸 이리야를 납치해 류도사로 간다. 이 사실을 알게 된 시로와 세이버는 류도사로 가 각각 길가메쉬와 고토미네를 상대로 마지막 싸움을 하게 되는데...

Después del incidente en la iglesia, Saber y Shirou regresan a casa solo para encontrar a Rin en el piso y gravemente herido. Resulta que Kirei Kotomine la atacó, mientras que Shirou y Saber estaban ocupados y eso no es todo porque también se ha llevado a Ilya y planea hacerle el sacrificio por el Santo Grial. Ayudados con el último consejo de Rin, ambos se dirigen a Ryudouji, donde Kirei convocará al Santo Grial. Saber volverá a pelear con Gilgamesh y Shirou tendrá que dejarla y tratar con Kirei, quien obviamente tiene algún tipo de venganza personal contra Shirou. La pelea final acaba de comenzar.