小人たちの反乱に怒り、自ら回収に乗り出したキュィーンだが、フランキーに邪魔され怒り心頭。そして戻ってきたセニョールとフランキーの激しいバトルが再開した。一方、ヴィオラは小人たちを手助けしようと、行方不明のマンシュリー姫を探す。

幼い頃の記憶をたどり、ついにマンシェリー姫の居場所を突き止めたヴィオラ。そのころ、王宮のある台地を通過、ひまわり畑に近づくにつれ、ルフィとの対面を妄想するバルトロメオ。ヴィオラからの連絡で、マンシュリー姫の居場所が、おしおき部屋だと聞き目に涙が浮かべたレオは、レベッカにそこはいたずらが過ぎてリク王に叱られた幼いヴィオラと一緒に反省した場所だと教える。そして、こっそり食料を持ってきてくれたレベッカの母、スカーレットのことがみんな大好きで、小人たちはみんな彼女を慕っていたと語った。

ルフィたちを先に行かせ、グラディウスの相手を買って出たロビンとバルトロメオ。キャベンディッシュも加わり、まさに命がけの激しい戦いを繰り広げる。一方、藤虎を相手に熾烈な戦いを続けるサボは、その真意を確かめようとするが……。

ルフィたちの到着を前に、最高幹部ディアマンテから狙われることになったレベッカ。必死に逃げ惑うレベッカだが、執拗なディアマンテの前に逃げ場を失い追い詰められる。もはやこれまでかと思ったそのとき、レベッカを救うべくキュロスが駆け付ける！

オモチャの奴隷たちを奪われ復讐に燃えるシュガー。そうはさせまいとするウソップだが、万一、失敗すればルフィを失うだけでなく、すべてが無になってしまう。仲間たちの助けを借り、ウソップはドレスローザの未来を賭けた一撃を放つ！

ついに決戦の地、王宮最上階へ到着したルフィはボロボロになったベラミーと再会する。失態を罵られ、ベラミーを道具のように扱うドフラミンゴの卑劣さに怒りを爆発させるルフィ。ドフラミンゴに放つ、ルフィとローの秘策とは？

ローとの連携技によってドフラミンゴに接近、至近距離からの攻撃を成功させたルフィ。出し抜かれ、怒りにまかせルフィとローをいたぶるドフラミンゴだったが、やがて、恐るべき事実を語り始めるのだった。

自らを天竜人だと明かしたドフラミンゴ。衝撃の事実に言葉を失うルフィたちだが、圧倒的な力の差を前に苦戦する。裏切り者、ローの処刑を開始しようとするドフラミンゴによってオペオペの実の真の力、ローの壮絶な過去が明らかになる。

ローがドフラミンゴファミリーへの仲間入りを志願して一週間が過ぎた。コラソンに手ひどく扱われるローに、ラオGは血の掟を忘れるなと忠告する。ドフラミンゴは弟であるコラソンに傷をつけた者は死を与えると言うのだ。ジョーラとマッハバイスはローの肌が白く変色しているのを見て血相を変える。ドフラミンゴは騒ぐ二人を一喝、珀鉛病は伝染病ではなく中毒だと言い、ローにどうやって逃げたのかと尋ねた。ローは顔色ひとつ変えず、死体の山に隠れて国境を越えたと答え、自分を痛めつけたコラソンに復讐すると告げる。

血の掟を破り、コラソンに刃を突き立てたロー。一方、天竜人の身分を捨て、家族で聖地マリージョアを離れた幼い日の記憶にうなされるドフラミンゴ。自らの手で父の首を持ち帰るまで追い詰められた、その壮絶な過去とは？！

ローの本名を聞いたコラソンは、珀鉛病の治療法を探すため、ローを連れファミリーから離れる。珀煙病の治療方法を探し、旅に出た二人だが、有効な治療法は見つからない。最初は反発していたローも、自分を助けるために必死なコラソンに心を開いていく。

珀鉛病の治療法を求め、旅を続けるコラソンとロー。すでに半年が過ぎ、焦るコラソンは、ドフラミンゴがオペオペの実の取引を行うと知り、それを奪うことを決意する。高熱で倒れたローを残し、コラソンは危険を覚悟で取引先に向かう！

瀕死の重傷を負いながら、持ち帰ったオペオペの実をローに食べさせたコラソン。身動きできないコラソンに頼まれ、海兵に文書の入った筒を渡す役目を引き受ける。コラソンの身を案じながら、一人の海兵に助けを求めたローだったが……

奪われたオペオペの実、そして裏切り者コラソンを逃すまいとイトを張り巡らせるドフラミンゴ。一方、ローを逃がすため、死を覚悟して単身、ドフラミンゴの前に姿を現したコラソン。裏切り者として制裁を受け、傷だらけになりながらもローに本心を伝える。

自らの命と引き換えに自由を与えてくれたコラソン。その恩に報いるべく、憎き仇のドフラミンゴに挑んだローだが必死の攻撃も通用しない。ドフラミンゴに嘲笑されながらもローは、ここに来たのは13年前のけじめをつけ、コラソンの本懐を遂げるためだと言うと、自由になるのはドフラミンゴを止めたときと攻撃を仕掛けた。ドフラミンゴが天竜人であることを引き合いに、神の天敵と呼ばれるDの名を持つルフィをどう思うかと尋ねるロー。バカバカしいと一蹴するドフラミンゴだが、ローが自分もDの一族だと明かすと豹変する。

亡きコラソンの願いを果たそうと、まさに命がけの戦いを仕掛けたローだったが、ドフラミンゴの反撃によって絶体絶命のピンチに追い詰められる。一方、ベラミーを操りなおも攻撃を仕掛けるルフィの怒りが爆発する。

怒りの一撃で偽ドフラミンゴをブッ飛ばしたルフィ。そしてベラミーを操るドフラミンゴに怒り、自由にしろと叫ぶ。攻撃をかわすだけのルフィに、ベラミーを始末させるのをあきらめるドフラミンゴ。ベラミーを解放すると今まで通り、自由にしてやると言い放つ。傷つき、地面に投げ出されながら、かつて、ドフラミンゴと交わした約束を思い出すベラミー。裕福な街、ノーティスに育ったベラミーは退屈を嫌い、同じ北の海出身のドフラミンゴに憧れ、傘下に入れてもらうおうと仲間たちを従え、ドフラミンゴの元へ乗り込んだ。

敵であるベビー５から求愛され驚くサイ。結婚など認めないと反対、激突するチンジャオとラオＧ。サイに尽くし、献身しようとするベビー５を疑い、拒絶するサイは無謀ともいえる要求をつきつけ、思わぬ形で悲しい過去を知ることになる。

王宮のある台地2段目のラオGとベビー5との戦いは決着したが、戦いは激しさを増していく。姿を隠し、舞踏石を繰り出すピーカの執拗な攻撃に手こずるゾロだが、加勢を申し出たエリザベローに、これから先、何が起こるかわからない以上、宝刀は取っておくべきだと忠告する。一方、4段目、ひまわり畑ではディアマンテとキュロスの激しい斬り合いが続いていた。ディアマンテは俺とお前には因縁しかないと、スカーレットを失い、嘆き悲しんでいた姿をバカにしてキュロスを挑発、勝負を仕かけると見せかけレベッカを狙う。

グラディウスの罠を逃れ、レベッカの元へ急ぐロビン。一方、キャベンディッシュ、バルトロメオ両名に苦戦するグラディウスに加勢するデリンジャー。本性をあらわし、牙をむくデリンジャーの前にあらわれたハクバとは……。

あざやかな手並みでハクバを捕えたロビン。噂に聞いていたものの、交互に入れ替わり、二重人格のように豹変するキャベンディッシュを目の当たりに驚きを隠せない。ハクバを抑えつけ、ロビンに斬りつけたことを謝罪したキャベンディッシュは、ハクバを無差別に斬りつける厄介者だと説明する。入れ替わろうとするハクバと言い合いになり、ついには互いの表情が半分ずつ出たまま固まってしまう。それを半ば呆れるバルトロメオだが、グラディウスが壁ごとロビンを吹き飛ばそうとしているのを見抜き、阻止しようと突進した。

戦闘不能に陥った幹部たちを密かに運ばせ、起死回生のチャンスを狙うジョーラ。しかし、鍵を握るマンシェリー姫に抵抗され激怒する。姫を救うべく向かったレオとカブ。絶体絶命の姫を救うことができるのか？！

マンシュリーの奪還に成功、幹部の復活を阻止したレオ。ただちにヴィオラたちの元へ戻ろうとするが、レオに甘えたいというマンシェリーの恋心に気がつかず、わがまま扱いして怒らせる。カブに鈍いと呆れられながら、マンシェリーを背負い脱出するレオ。ボロボロの身体を引きずり、ドフラミンゴへ事態を報告しようとするジョーラ。万一、工場に何か起きても、チユチユの能力で復元する計画が、マンシェリーを奪われた今となっては叶わないからだ。だが、すでに体力は限界、セニョールに最後の望みを託し、力尽き倒れる。

フランキーとセニョール、まさに男の意地を賭けた戦いに終わりの時が近づく。一方、キュロスのしぶとさに呆れながら、体力の限界を見抜いたディアマンテは死の星屑を仕掛け、キュロスもろともすべてを葬りさろうとする！

ディアマンテが放った死の星屑。降り注ぐ無数の鉄球を全身に受け、もはや限界と思われたキュロスだったが、妻の仇、そして、ドフラミンゴにより支配され、虐げられた人々すべての怒りを込め、ディアマンテに最後の一撃を放った！

旧王の台地に到着したピーカは、ドレスローザの人々の希望の象徴となったリク王を処刑すべく呼び出した。一方、猛者たちの手を借りて、ピーカを倒し、リク王を救う作戦を開始したゾロ。熾烈な戦いに決着のときが迫る！

激闘の末、ついに最高幹部ピーカを倒したゾロ。残るファミリーはドフラミンゴとトレーボルのみ。一方、ドフラミンゴに裏切られながら、プライドにかけてルフィと戦おうとするベラミーはまさに命を賭けた一撃を放つ！

ベラミーとの決着をつけたが、怒りが収まらずドフラミンゴの待つ最上階へ向かうルフィ。旧王の台地では、ヴィオラが千里眼でルフィとベラミーの戦いが終わったことを見届けていた。これで戦況が有利になったと言うタンクに、ヴィオラはローが倒されたことを伝える。余裕をみせて最上階でルフィを待ち受けるドフラミンゴ。その足元には痛めつけられたローが倒れていた。力の差を見せつけたドフラミンゴは、ルフィが迷わずベラミーを倒せばローを救えたかもしれないと言うと、コラソンの復讐を誓うローの執念をあざ笑った。

ドレスローザの秘密を守るため、鳥カゴによってすべてを終わらせようとするドフラミンゴ。死の糸が迫り、逃げ場を失った人々でドレスローザは大混乱となる。生か死か、すべてをかけた最後の戦いが始まろうとしていた！

執念の一撃によってドフラミンゴを追い詰めたローだったが、あと一歩のところで叶わず絶体絶命の危機におちいる。ローを狙うドフラミンゴを力技で止めたルフィ。覇王色の覇気がぶつかり合う、すさまじい戦いが始まった！

覇王色の覇気が激突、力の差で弾き飛ばされ、先回りしたトレーボルに捕まり、身動きを封じられたルフィ。勝利を確信したトレーボルはドフラミンゴにローの処刑を続行するよう促す。いかなる攻撃をも通じないトレーボルの身体の秘密とは？！

ローの処刑を邪魔され、どこまでも自分の邪魔をしようとするルフィに激しい怒りをぶつけるドフラミンゴ。刻一刻とドレスローザ崩壊の時が迫る中、ルフィは虐げられた人々の怒りと希望を背負い、ドフラミンゴとの最後の戦いを開始する！！

鳥カゴの収縮が進みドレスローザ崩壊の時が迫る。海兵たちは少しでも安全な場所へと、人々を中心街へ誘導する。王の台地2段目では、ベビー5からドフラミンゴの非情さを教えられたサイが、見過ごすわけにいかないと決意、猛者たちと共に立ち上がった。ここなら安全と思っていたウソップも、ヴィオラから収縮の中心がドフラミンゴの居る王宮の台地で、戦いが長引けば危険と教えられ悲鳴を上げる。一方、ゾロに続き、下へ降りた錦えもんたちは、ゾロが鳥カゴを止めに行こうとしているのを知っておどろきの声を上げた。

鳥カゴの収縮が進み、崩壊の時が迫る中、秘策ギア４を発動、圧倒的な力と技によって、あと一歩のところまでドフラミンゴを追いつめたルフィ。しかし、覚醒したドフラミンゴの逆襲に苦戦を強いられる！ドフラミンゴの告げる悪魔の実の真の姿とは？！

ドレスローザの命運を賭け、ドフラミンゴと死闘を繰り広げるルフィ。その戦うさまを見た人々は、ルフィに希望を託し、生き抜こうと必死に中心街を目指す。一方、渾身の大蛇砲でドフラミンゴを追い詰めたルフィだが、ギア4の制限時間が迫っているうえ、覚醒したドフラミンゴの反撃に苦戦する。何とか接近戦に持ち込もうとするルフィだが、ドフラミンゴの操る巨大な糸に挟み撃ちにされ糸の束に閉じ込められてしまう。逃れようともがくルフィをそのままに、ドフラミンゴはその隙に傷ついた内臓を修復を急いだ。

制限時間を超え、力つきて倒れたルフィを処刑しようと襲いかかるドフラミンゴ。覇気が回復するまでの十分間、ただひとつの希望、ルフィを守るため命がけの戦いが始まった。さらに、ゴムゴムの実を狙うバージェスの魔手がルフィを狙う！

いまだ覇気の回復しないルフィを処刑すべく、執拗に追うドフラミンゴ。一方、鳥カゴの収縮を食い止めようと奮闘するゾロたちだったが鳥カゴの収縮を止められず、もはや、これまでかと思われたそのとき、奇跡の光が降り注ぐ。

東西に別れ、鳥カゴを阻止しようとするゾロたちだが、すさまじい力の前に苦戦していた。ウソップは避難しようとする人々に、仲間が鳥カゴを止めようとしていることを説明、元気な者は力を貸すように命令して各地へ向かわせた後、状況を見てもらおうとして、ヴィオラの姿が見えないことに気づく。一方、ルフィを誘い出そうと選手たちを血祭りに上げるドフラミンゴだったが、一向に出てこないルフィに苛立ち、選手たちを手にかけていく。その一部始終を千里眼で見ていたヴィオラは、あまりのむごたらしさに言葉を失う。

ドレスローザ崩壊まで60秒。いまだルフィ回復の兆しはなく、無情にも収縮を速めた鳥カゴが王の台地を切り刻み始めていく。一方、ドフラミンゴは非情にも、レベッカを操り、肉親であるヴィオラを処刑させようとする！

ドレスローザ滅亡を賭けた最終決戦が始まった。すべてを支配しようとするドフラミンゴに怒りを爆発させるルフィ。虐げられた人々すべての怒りを晴らすべく、ルフィ渾身の新必殺技が今さく裂する！！

持てる力のすべてを込めた大技、大猿王銃によって、みごとドフラミンゴを倒したルフィ。その衝撃はすさまじく、周囲の建物を巻き込み、瓦礫と化して地上へ降り注ぎ、巻き込まれてはたまらないと、思わず人々は逃げ出した。仁王立ちのルフィを見上げ、それぞれ、今日まで抱き続けた思いを胸に涙を浮かべるレベッカとヴィオラ。とうに限界を超えていたルフィは、すべてを出しつくして力尽きてしまい、再び意識を失うと地面へ落下する。しかし、激突寸前のところでローに救われ、レベッカたちのもとへ届けられた。

ドフラミンゴの支配から解放され、自由を取り戻したドレスローザだが、鳥カゴの収縮、さらに各地での激戦により荒れ果て、かつての姿を失う。復興を託されながら、引き受けることをためらうリク王のもとを訪れた藤虎はおどろくべき行動に出る！

海軍大将による土下座、その衝撃的な光景は隣国から中継され、瞬く間に世界各地へと広まった。藤虎の体面をおもんばかり、土下座をやめさせようとするリク王だが、藤虎はドフラミンゴを野放しにしていた政府が、今になって正義の名のもとに捕えようとすることを批判、この国を取り戻したのは海軍ではなく、海賊、戦士、市民たちだと断言する。一方、手分けして戦っていた麦わらの一味が合流を果たしていた。ヴィオラはウソップたちがルフィを捜していることを知ると、レベッカにここにいることを教えようと微笑んだ。

海軍の目を避け、密かにルフィたちが身を寄せるキュロスの家を訪れたサボ。再会を喜び、眠っているルフィを起こそうとしたロビンを止め、状況を知ったCP0が引き返して来ており、可能であれば早く出航するように勧める。エースのほかに兄弟がい たのかとおどろくゾロたちに、自分は死んだことになっていたのだと言うと、12年前の事件について語り始めた。幼い日、サボはエース、ルフィと杯をかわして義兄弟となり、共に夢を語り合い、修行に励んでいた。だが、その夢は思いがけず、無残な形で踏みにじられてしまう。

2年前、最悪の事実を目の前に突き付けられ、封印されていた記憶を取り戻したサボ。失ったものの大きさに慟哭しながら、ある思いを胸にドレスローザへ向かう。そして、コロシアムでもう一人の兄弟、ルフィと再会を果たす！

サボが帰るのを見届け、ロビンたちの会話に加わったキュロスは、ルフィを起こそうとするゾロを止め、好きなだけ眠らせてやってほしいと頼んだ。ドレスローザの人々がどれだけルフィに励まされたか。感謝の言葉を述べるキュロスを、ゾロは酒に誘う。ゾロから怪我が治ったら手合せしたいと言われ、キュロスは光栄だと返した。やがてゾロが休み、一人、王宮を見上げたキュロスはレベッカのことを思い出し、その名をつぶやく。しばらく考え込んだ後、ペンを取り手紙を書きあげると、誰にもいわず、そっと家を出ていった。

サイコロの目を理由にルフィたちへの手出しを禁じ、自らは動こうとしない藤虎だったが、ドレスローザ近海に大目付であるセンゴク、そしておつるの船が接近していた。いまだ目覚めないルフィ、そして麦わらの一味に危機が迫る！

ルフィたちを一網打尽にせよ。藤虎の命令を受けた海兵たちはキュロスの家へ急行した。船もない状態でどうやって逃げるのかとパニック状態のウソップに、バルトロメオはいつでもルフィたちが脱出できるよう海軍に見張りをつけてあると話す。すでに東の港には脱出用の船が用意され、港への道は街の各所に待機した海賊たちが海兵たちの足止めを買って出ていた。海兵たちの銃撃をかわし、東の港へ向かったルフィだったが、キュロスの考えにどうしても納得できず、後から合流することを約束して一人で王宮へと向かう。

猛者たちの協力によって海軍の包囲網を突破、東の港でルフィを待つゾロたちに海軍大将藤虎が迫る。一方、レベッカを王宮から連れ出したルフィ。英雄から一転、国中から追われる身となりながら、島を出ようとするキュロスのもとへレベッカを送り届ける。

コラソンの死の真相を追及され、本当なら二人で逃げるはずだったと悔しさをにじませるロー。大恩人であるコラソンが亡くなってからは、ドフラミンゴを討つためだけに生きてきたと言うと、自分が「D」の名前を持つ者であると明かした。それを聞いたセンゴクは動揺しながらも、受けた愛に理由をつけるなとローを叱咤激励する。コラソンの思い出を語れる者は、もはや海賊であるローだけ、コラソンのために何かしたいのならお互い覚えていよう、コラソンなら自由に生きろと言ったはずだとローに言葉をかける。

藤虎の猛虎に吹き飛ばされ、海に落ちるところをハイルディンにキャッチされたルフィ。すぐさま反撃しようとするが、それどころではないというハイルディンにより、ルフィは有無をいわさず霧の向こうへと連れさられてしまう。この状況でどうやって逃げるのかと危ぶむウソップに、オオロンブスは5キロ先の霧の中にみんなの船が止めてあると言うと、そこまでは船と船をロープでつないだ橋を渡るのだと説明した。まだ戦っている途中だとハイルディンに叫ぶルフィ。対する藤虎は逃がすまいと、次の手に打って出る。

盃をかわし、傘下入りを懇願する海賊たちに困惑するルフィ。諦めてもらおうと説得するが海賊たちも一歩も退かない。そこへジョーカーとの取引を潰された連中が一群となり、ルフィたちを狙って攻撃を仕掛けてくる！！

宴に沸くルフィたちから離れ、一人、遠ざかるドレスローザに思いをはせるロー。ロビンに声をかけられるが、そっけない態度を取って去っていく。ところ変わって、復興の始まったドレスローザ。国中がリク王の復位に沸く中、密かに事件を調べるCP。地下交易港から盗まれた武器は、革命軍の仕業だと睨んでいた。一方、リク王によって、トンタッタの小人たちの存在が明らかになった。そして、国を救った恩人としてルフィたちの石像が立てられる。この後、ドレスローザは人間たちと妖精が共存することとなった。

ゴーイングルフィセンパイ号で一路、ゾウへと向かったルフィたちだったが、突如、出現した謎の島、シルバーマインの襲撃を受ける。仲間たちから引き離されたルフィとバルトロメオは二人だけで光り輝く島へと乗り込んだ！

要塞からの脱出を図ったルフィとバルトロメオだったが、デザイアの攻撃で地下へと落下してしまった。脱出しようにもバトルボートは壊れて外への連絡はできない。見れば、いるところにレールが敷かれており、海賊連合のメンバーのデザイアすら、こんな場所は知らないという。まもなく汽笛の音を響かせながら、トロッコ人間アベロンが接近する。ルフィの命を狙うが、機転を利かせたバルトロメオに邪魔される。たが、すぐさまレールを切り替え、デザイアもろとも、ルフィたちの命を奪おうと攻撃を仕掛けてくる。