Alors que chaque Mugiwara (excepté Luffy) essaye de se débrouiller dans son environnement, Luffy lui arrive à la grande prison avec l'aide de Hancock.

Hancock transforme Domino et le Den Den Mushi de la salle en pierre grâce à son Fruit du Démon , avant qu'elle ne subisse la pose des menottes en Granit Marin, ce qui permet à Luffy d'entrer dans la prison.

Baggy et Luffy se frayent un chemin jusqu'à l'entrée du niveau 2 en passant par le niveau 1, où les criminels les moins dangereux sont enfermés mais à cause de Baggy, Luffy est repéré par les Blugoris.

Luffy et Baggy se trouvent maintenant au niveau 2 : l'enfer des bêtes. Tandis que Luffy parvient à gérer les animaux sauvages sans trop de difficultés, Baggy organise une émeute en déverrouillant plusieurs cellules de prisonniers.

Il y a vingt ans, un prisonnier nommé "Shiki le lion d'Or" parvient à s'échapper de la grande prison réputé inviolable : Impel Down. Shiki pour s'échapper n'eu d'autre choix que de couper ses membres inférieur afin de se libérer de ses menottes, choquant Magellan et les gardes constatant son évasion.

Luffy, Sanji, Zoro et Usopp arrivent sur l'île de Little East Blue, une île qui, par certain de ses bâtiments, rappelle aux Mugiwara leur ville d'origine respective.

Après avoir piégé Luffy dans un mystérieux filet, Largo révèle aux Chapeaux de Paille qu'il a mangé le Ami Ami no Mi, un fruit qui lui donne la possibilité de créer des filets avec son corps.

Tandis que Luffy continue son combat contre Largo, Nami fait évacuer les villageois.

Le niveau 6 d'Impel Down est un niveau secret de la prison sous-marine renfermant les plus dangereux criminels de l'histoire, des criminels dont les primes excèdent largement les 100 Millions de Berrys.

Les prisonniers libérés du niveau 2 par Baggy sèment la panique au sein de la si réputée prison d'Impel Down. Du côté de Marine Ford, Sengoku, l'Amiral en Chef de la Marine est furieux contre Garp qui rigole des évènements que Luffy provoquent.

Alors que Luffy continue son avancée vers le niveau 4, Mr. 3 et Baggy délivrent Bonclay de sa cellule. Lorsque ce dernier apprend la présence de Luffy au niveau 3, il part immédiatement à sa recherche. Dehors, les Marines chargés d'escorter Ace souhaitent entrer dans Impel Down pour aider à la capture de Luffy.

Après avoir reçu la visite de Hancock et de Momonga, Magellan est informé de la panique qui règne à Impel Down et reprend les commandes de ses troupes. Sadi, elle, informe le directeur qu'elle vient d'envoyer Minotaurus, un des Gardiens Démoniaques, stopper Luffy et Bonclay au niveau 3.

Luffy, Mr. 3, Mr. 2 et Baggy continuent leur chute vers le niveau 4 : l'Enfer des Flammes.

Les nombreux avertissements de Mr. 2 sur la force du Directeur d'Impel Down résonnent en vain au niveau 4 : le combat est inévitable entre Luffy et le détenteur du fruit du Venin, Magellan.

Après avoir infligé un puissant coup à Magellan, Luffy tombe, les mains victimes de la toxine du poison, hurlant de douleur. Pendant ce temps, Mr. 2, toujours en fuite, continue de courir, frappant les gardes sur son chemin. Bien que les larmes l'assaillent, il se rassure en se répétant qu'il ne pouvait faire autrement...

Magellan ordonne l’emprisonnement de Luffy dans une cellule du niveau 5 : l'enfer des glaces. Au niveau 5, les prisonniers souffrent tellement du froid que leur corps gèle…

Alors que Mr. 2 délivre Luffy de sa cellule, Mr. 3 et Baggy, eux, font face aux Loups Blancs du niveau 5. De leur côté, les grandes figures du personnel d'Impel Down ne sont qu'a moitié rassuré.

Mr. 2 en apprend plus sur le niveau 5.5 et fait enfin la connaissance d'Emporio Ivankov. Ce dernier lui fait d'ailleurs très vite une démonstration des pouvoirs du Horu Horu no Mi en changeant un homme en femme.

Alors que Luffy poursuit son traitement, Mr. 2 et Ivankov retournent dans la salle principale pour discuter et manger. Ivankov explique alors à Bonclay qu'il tient ses pouvoirs du Horu Horu no Mi, le fruit des Hormones.

Alors que Luffy se réveil guéri à la surprise de tous, Magellan se dirige au niveau 6 par l’ascenseur. Domino, qui l'accompagne lui rappelle leur mission : conduire le prisonnier Portgas D. Ace devant les portes d'Impel Down à 9h00 précise.

Luffy, guéri et en pleine forme, se dirige avec l'aide d'Ivankov et d'Inazuma vers le niveau 6 où est emprisonné son frère, Ace. Cependant, Magellan, déjà présent devant sa cellule, fait sortir Ace et l'emmène.

Luffy étant coincé au niveau 6, décide, à contrecœur, de libérer Crocodile de sa cellule. Afin d'éviter une trahison, Ivankov menace de dévoiler un secret gênant à son sujet...

Toutes les troupes d'Impel Down se rendent au niveau 4 pour stopper le groupe de Luffy qui continuent de se battre. Pendant ce temps, Baggy et Mr. 3 atteignent le niveau 2 et libèrent des prisonniers afin de couvrir leur fuite. C'est le chaos à Impel Down !

Luffy, Jinbe, Crocodile, Mr. 2, Mr. 1, Ivankov, Inazuma et les New Kamas continuent de se battre au niveau 4. Pendant se temps, Barbe Noire, s'étant introduit lui aussi dans Impel Down, rencontre Shiliew au niveau 1.

Devant la porte du Niveau 3, Luffy se bat contre Hannyabal qui n'abdique pas malgré la supériorité de Luffy. Cependant, le sous-directeur d'Impel Down, se fit piétiner par Marshall D. Teach, qui arrive en rigolant, sans avoir le temps de faire quoi que ce soit.

Après s'être reçu un "Jet Pistol" de plein fouet, Barbe Noire utilise son Yami Yami no Mi, le Fruit des Ténèbres et annule l'élasticité de Luffy. Le Grand Corsaire explique ensuite les détails de son combat contre Ace.

Alors que Magellan a réussi à rattraper le groupe de Luffy et des évadés, Ivankov décide de rester en arrière pour l'affronter et ainsi permettre à Luffy et ses alliés d'atteindre le niveau 2.

Luffy se retrouve hors de lui lorsque Magellan se vente d'avoir vaincu Emporio Ivankov et Inazuma.

Pendant que Luffy combat Magellan, Crocodile, Jinbe, Daz Bones et Baggy s'occupent de voler un bateau de la Marine pour s'échapper de la prison sous-marine.

Alors que Luffy et nos amis s'enfuient, Magellan s'apprête à partir à leur poursuite. Jinbe, lui, remercie les requins baleine et se tourne vers ses amis qui exultent : ils se sont évadés !

Au niveau 4, l'Equipage de Barbe Noire apparait guéri du poison mortel de Magellan. C'est en vérité Shiliew de la Pluie, l'ancien gardien-chef d'Impel Down qui leur a administré l'antidote.

Des nouvelles de l'équipage ! Nami est encore sur Weatheria avec Haredas. On apprend que l'île céleste, se déplace grâce au vent tout droit en direction de l'Archipel des Sabaody.

Des nouvelles de l'équipage ! Sanji est poursuivi par les Okamas sur l'île de Kedétrav . Afin de pouvoir partir de l'île, le cuisinier accepte d'affronter Caroline, l'okama le plus fort de royaume.

Des nouvelles de l'équipage ! Robin, capturé par la garde de Tequila Wolf, a été envoyé en prison. Cependant, grâce à Soran et à l'armée des révolutionnaires Robin et les autres ont pu être libérés.

Des nouvelles de l'équipage ! Zoro cherche un moyen de s'échapper de l'île sur laquelle il se trouve : l'île de Kuraigana. Perona, envoyée elle aussi par Kuma, accepte de l'aider. Soudain, notre sabreur se fait brusquement attaqué...

Luffy regarde la Vivre Card d'Ace qui continue de brûler et commence une conversation avec Jinbe. Il se rappelle alors que, lors de son enfance, lui et son frère ont toujours été ensemble, que ce soit pour manger, dormir ou même tester leur force.

Alors que Luffy est en chemin pour sauver Ace, tout Marine Ford se prépare pour l'exécution de ce dernier. Les 5 Capitaines Corsaires : Bartholomew Kuma, Dracule Mihawk, Gecko Moria, Boa Hancock et Don Quichotte Doflamingo sont présents et les 3 Amiraux : Aokiji, Kizaru et Akainu s'apprêtent à se lancer en guerre contre Barbe-Blanche.

Alors qu'il ne restent que trois heures avant l'exécution d'Ace, Luffy atteint Marine Ford mais trouve la Porte de la Justice fermée. Partout dans le monde, la nouvelle d'une guerre opposant Barbe Blanche aux forces de la Marine se répand.

Le monde n'en reviens pas : Portgas D. Ace est en vérité le fils biologique du Roi des Pirates, Gol D. Roger !

Barbe Blanche apparait et révèle le pouvoir de son Fruit du Démon, un pouvoir capable de détruire le monde, le pouvoir du Gura Gura no Mi.

Le séisme provoqué par Barbe Blanche et son Fruit du Tremblement provoque un gigantesque tsunami sur le point de se noyer l'ensemble de Marine Ford.

Alors que l'attaque de Mihawk se dirige tout droit vers Barbe Blanche, Joz, commandant de la 3ème Division s'interpose et bloque l'attaque grâce aux pouvoirs du Kira Kira no Mi, le Fruit du Diamant.

La bataille bat à son plein à Marine Ford. Little Oars Jr. impressionne les Marines par sa taille et fonce vers la plate-forme où est enchainé Ace, ouvrant ainsi une voie à travers la baie pour les Pirates de Barbe Blanche.

Alors que Barbe Blanche ordonne ensuite à son équipage de monter sur le corps d'Oz et d'avancer, Doflamingo prend le contrôle d'Atmos grâce à ses mystérieux pouvoirs.

Luffy et son alliance formée avec les prisonniers évadés d'Impel Down arrivent enfin sur le champ de bataille.

Luffy accompagné de Jinbe, d'Ivankov et des Newcomers progressent sur le champ de bataille. Fullbody et Jango essaient d'arrêter Luffy, en vain, avant d'être relayés par le capitaine Hina qui utilise les capacités de son Fruit du Démon, le Ori Ori no Mi.

Un combat après l'autre, c'est le chaos complet sur Marine Ford. Luffy, Jinbe, Ivankov et le reste des Newcomers, combattent sur le front les marines alors que Baggy joue la sécurité et décide de lutter contre la Marine en faisant équipe avec Barbe Blanche.

L'exécution d'Ace s'approchant à grands pas, Hancock donne à Luffy la clef permettant de le libérer son frère de ses menottes. Luffy la prend alors dans ses bras ce qui amène l'impératrice à s'imaginer leur mariage, ainsi que d'autres visions imaginaires de leur idylle.

Luffy se dirigeant vers Ace, tombe nez à nez sur Mihawk. Il cherche alors à l'éviter en activant son Gear Second mais, grâce à sa vue perçante, le Corsaire repère Luffy et l'attaque à distance avec sa lame noire.

Sengoku met son plan à exécution : les Pacifistas contrôlés par Sentoumaru prennent à revers les pirates et les encerclent dans la baie empêchant ainsi toutes fuites.

L'ensemble des pirates et même des Marines sont surpris par l'énorme trahison de Squardo. Ce dernier explique à Barbe Blanche qu'il est au courant du complot orchestré par l'Empereur qui consiste à livrer les 43 capitaines alliés à la Marine en échange de Portgas D. Ace.

Alors que les combats s'intensifient, Barbe Blanche rejoint le champ de bataille. De son côté, la Marine peine à déclencher son piège à cause de la glace, trop épaisse, de Kuzan.

Alors que les communications provenant de Marine Ford sont coupées, les pirates de Barbe-Banche sont toujours encerclés dans la baie et à la merci des tirs de la Marine.

Luffy parvient à esquiver les Amiraux grâce à son Gear Second, mais Kizaru le rattrape facilement et le frappe par terre. Puis, l'ordre est donné : les bourreaux se préparent à exécuter Ace.

Little Oz Jr., après avoir aidé ses camarades à atteindre la Place Oris, meurt sous les coups de canon ennemis.

Alors que Barbe Blanche continue de se battre contre Akainu, Sengoku ordonne la préparation de l'exécution d'Ace. De leur côté, les commandants de Barbe Blanche ainsi que les forces alliées progressent dangereusement vers l'échafaud.

Luffy remis sur pieds, balaye les Marines s'interposant dans sa course vers Ace. C'est alors que Koby décide de se mesurer à lui.

Alors que les pirates et les Marines reprennent lentement connaissance, tout le monde sur Marine Ford est stupéfié par la puissance du pouvoir de Luffy.

Alors que Koby reprend connaissance, Luffy fonce droit sur le Vice-Amiral Garp, son grand père, qui lui barre la route. Différents flashbacks débutent alors retraçant l'enfance de Luffy et sa relation avec son grand père.

Ace est enfin sauvé par son petit frère et tous les deux essayent de repartir en direction de la mer. Ensemble, ils forment un binôme parfait et envoient au tapis de nombreux soldats.

Alors que Barbe Blanche reste sur la baie de Marine Ford pour retenir la Marine, ses pirates eux rejoignent les navires pour s'enfuir.

Alors que l'Amiral Sakazuki s'apprête à achever Ace et Luffy, Jinbe intervient et bloque son offensive.

A l'instar de celui de Garp, le chagrin de Luffy est insurmontable. En état de choc, Marco le protège d'une nouvelle attaque d'Akainu. Pendant ce temps, Jinbe prend Luffy dans ses bras et s'enfuit.

Barbe Noire, fraichement arrivé à Marine Ford avec son équipage, explique à Sengoku comment il est arrivé jusqu'ici. Une bataille acharnée débute ensuite entre Barbe Blanche et Barbe Noire. Marshall D. Teach en profite pour dévoiler à l'Empereur la puissance des pouvoirs du Yami Yami no Mi : son fruit des Ténèbres.

La nouvelle de la mort du légendaire pirate Barbe Blanche se répand comme une traînée de poudre. Pendant ce temps, sous un rideau noir, Barbe Noire prépare son plan à l'aide du corps sans vie de Barbe Blanche.

Dans le but de faire une démonstration de sa puissance, Barbe-Noire annonce son intention de couler Marine Ford. En entendant cela, Sengoku l'attaque, ce qui remotive les soldats de la Marine.

Alors que les combats font rage à Marine Ford, Koby est exténué par la guerre et ne comprends plus les raisons de toutes ces morts. Barbe Noire, lui, sème la panique avec ses séismes.

Shanks apparaît devant tout le monde et déclare qu'il est venu faire cesser cette guerre. Par miracle tout le monde l'écoute.

Tandis que la Marine informe ses soldats à travers le monde de sa « victoire suprême », les Supernovae apprennent eux aussi la nouvelle. Pendant ce temps, les habitants du monde à la suite de l'annonce de cette victoire s'attendaient à la paix.

Depuis la mort de Barbe Blanche, les pirates du monde entiers ne cessent d'attaquer les territoires anciennement protégés par l'Empereur. Pendant ce temps, Luffy, Jinbe et l'équipage de Trafalgar Law arrivent sur Amazon Lily.

Durant ce cross-over, Luffy part sur une île pour trouver de la nourriture avec Sanji, Chopper, Nami et Zoro. Là, ils rencontrent Toriko et son partenaire qui sont eux aussi à la recherche de nourriture. Toriko apprend alors à Luffy à apprécier la nourriture et comment la chasser.

Cet épisode est un flashback qui se déroule 10 ans avant l'histoire actuelle. Garp emmène Luffy au dessus du village Fuschia, au Mont Corvo, où vit la famille Dadan.

Alors que Luffy tente toujours désespérément de suivre Ace, il arrive dans le Grey Terminal, une zone de non-droits où les gens souffrent et où les'" maladies et les crimes se propagent.

Ace et Sabo parviennent à sauver Luffy des pirates, mais Ace veut continuer son combat contre Porchemy. Sabo prend alors la décision de le rejoindre et, ensemble, ils parviennent à le mettre hors d'état de nuire.

Ace, Luffy et Sabo continuent leurs aventures quotidiennes. Un jour, ils décident de se rendre dans la ville haute du Royaume de Goa où Sabo est mystérieusement reconnu par un homme. Sabo avoue donc à Ace et Luffy qu'il est, en vérité, né de sang noble mais que puisqu'il n'avait pas le caractère des nobles il eût pris la décision de quitter la ville. Plus tard, les 3 gamins se mettent à boire une coupe de saké, se promettant de devenir pirates et scellant par la même occasion leur fraternité.

Nous sommes toujours dans le flashback sur l'enfance de Luffy. Au Mont Corvo, Ace, Luffy et Sabo font vivre un enfer à Dadan. À la suite de la visite de Garp, les trois gamins décident de quitter leur maison et d'établir un repère en forêt. Alors qu'Ace, Luffy et Sabo dorment dans leur nouvelle base secrète, Dadan, qui a réussi à les retrouver, se fait prendre par un de leurs pièges...

Luffy et les autres continuent de vivre normalement jusqu'au jour où ils se retrouvent poursuivis par un ours. Heureusement, ils sont sauvés par Naguri, un habitant du Grey Terminal et ancien capitaine pirate.

Les 3 frères commencent à se faire entraîner par Naguri. Ceux-ci l'aident en échange à construire un bateau pirate. Ace, Luffy et Sabo, étant devenus plus fort, partent combattre le tigre géant.

Bluejam retrouve Ace, Luffy et Sabo, et le père Sabo contraint celui-ci à revenir dans la ville noble. Sabo, d'abord réticent, accepte pour protéger ses frères. Une fois rentré, il apprend qu'un incendie va être déclenché dans le Grey Terminal. Il court donc dans le but de prévenir Ace et Luffy, qui au même moment travaillent pour Bluejam et ignorent tout de l'incendie.

Sabo, ramené par son père dans la ville, se voit enfermé pour éviter qu'il ne s'échappe. L'incendie débute et les habitants du Grey Terminal se retrouvent sans échappatoire.

Dadan et son équipe de bandits surgissent pour sauver Ace et Luffy de Bluejam. Alors que Dadan et Ace restent en arrière pour combattre Bluejam, le reste de la famille Dadan et Luffy évacuent rapidement.

Alors que Sabo venait tout juste de prendre la mer, son bateau est détruit volontairement par le Dragon Céleste. Après avoir échappé à l'incendie du Grey Terminal, Ace et Dadan rentrent au Mont Corvo.

Ace et Luffy s’entraînent durement pour devenir plus puissant. Après de nombreuses années de travail, ils atteignent l'âge de 17 ans chacun leur tour et prennent successivement la mer.

Retour sur l'équipage du Chapeau de Paille. Pour chacun d'eux on aperçoit les quelques mésaventures qu'ils ont connues jusqu'ici.

Rayleigh débarque à la nage sur l'île des femmes après que son bateau ait coulé. Tandis qu'il redonne son chapeau à Luffy , les Pirates du Heart en profitent pour s'éclipser. Rayleigh propose alors à Luffy d'attendre un peu avant de retrouver ses amis, lui rappelant qu'ils sont encore trop faibles pour affronter les prochains dangers.

Luffy souhaitant retrouver ses amis par tous les moyens, écoute néanmoins Rayleigh qui a une seconde proposition à lui faire.

A l'instar de ses camarades, Zoro veut aussi partir de l'île pour rejoindre Luffy et les autres à Sabaody.

Luffy se rend à Marine Ford, accompagné de Jinbei et Rayleigh. De son côté, Chopper part à Sabaody sur le dos d'un oiseau mais lorsqu'il reçoit le journal, il pousse un cri de stupéfaction.

Luffy retourne au QG de la Marine accompagné de Jinbe et de Rayleigh, où les travaux de reconstruction ont commencé.

Baggy retrouve son équipage et reçoit une lettre du Gouvernement qui l'étonne. Pendant ce temps, tout le monde reçoit le journal avec les nouvelles de Luffy, tout l'équipage comprend ainsi la signification du "3D2Y" marqué sur le bras de Luffy, hormis Zoro.

Trafalgar Law qui ne se trouve pas loin de l'Archipel Sabaody annonce à son équipage qu'il compte attendre un peu avant de franchir Red Line.

Retour sur Nami qui tente de se faire pardonner auprès des savants et décide de devenir une meilleure navigatrice.

Brook étant devenu une attraction pour le peuple des longs-bras repense dans sa cage au moment où il a rencontré Luffy et décide de devenir plus fort pour l'aider.

Après avoir fait ses adieux à Jinbe, Luffy se rend sur une île sauvage à côté d'Amazon Lily.

Luffy a bien grandi. Au bout de ses deux ans d'entraînement intensif, il est même devenu le maître de l'île de Rusukaina. Une fois ses adieux fait aux animaux avec qui il est devenu ami, il repart direction l'Archipel Sabaody où l'attendent Rayleigh et les membres de l'Équipage du Chapeau de Paille. Zoro qui arrive le premier se rend dans le bar tenu par Shakky.

Luffy se retrouve confronté au faux Luffy et à sa bande. Evidemment il les neutralise facilement en utilisant les pouvoirs que lui avait enseignés Rayleigh sur l'île Rusukaina.

Robin arrive sur le Sunny qui est maintenant muni du revêtement et rencontre Franky.

Sur le Grove 46 où se rassemblent un grand nombre de pirates, Caribou aperçoit un marine et lui donne un coup de lance. Chopper, Usopp et Nami, eux, arrivent sur le Sunny et retrouvent Robin et Franky.

La réunion des Faux Chapeaux de Paille continue jusqu’à ce que Sentoumaru arrive. Il assomme le faux Luffy et dévoile aux autres pirates sa véritable identité.

L'équipage parvient à se réunir alors que la Marine essaye de les stopper avant leur départ. C'est alors que Boa Hancock, Héraclès, Perona, Rayleigh, Haredas, les Okamas ainsi que l'Oiseau Géant qui a ramené Chopper, protègent tour à tour les membres de l'Équipage au Chapeau de Paille. Ces derniers sont alors enfin prêts. Le Thousand Sunny se submerge donc dans l'eau afin de se diriger vers leur prochaine destination : l'île des Hommes-Poissons !