스릴러 바크를 뒤로 하고 드디어 어인섬을 향해 여정을 시작한 밀짚모자 해적단은 스파 아일랜드호에서 휴식을 취하기로 한다. 호화로운 리조트에서 모처럼의 여유를 즐기고 있던 루피 일행은 그곳에서 리나와 사요 자매를 만난다. 자매의 아빠가 준 수첩에는 보석 만드는 방법이 적혀 있었고, 자매는 그 수첩의 비밀을 풀기 위해 스파 아일랜드호까지 온 것. 하지만 이들 자매가 가진 수첩을 노리고 집요하게 자매를 쫓아오는 일당이 있었는데…

잡혀간 사요를 구하기 위해 루피는 스파 아일랜드호를 부숴버리기로 결정한다. 밀짚모자 해적단이 자신의 배를 쑥대밭으로 만들자 드랭은 사요를 인질로 수첩을 내놓으라며 협박을 한다. 언니를 구하기 위해 리나는 수첩을 넘겨주려 하지만 사요는 그런 리나를 말린다. 리나는 아빠의 수첩을 보다 예전 생각을 떠올리고 아빠의 연구를 넘겨주지 않기로 결심한다. 그리고 루피는 스파 아일랜드호를 두 동강내버리고 바닷속에서 리나와 사요가 찾던 엑스자를 발견한다. 그리고

밀짚모자 해적단의 항해일지를 본 브룩은 자신도 그들과 어울릴 수 있는 선원이 되기 위해 사소한 거라도 동료들을 돕고 싶어 한다. 하지만 그런 브룩의 마음과는 다르게 사고만 치고. 의기소침해진 브룩은 자신이 정말 이곳에 있어도 되는지 망설인다. 그러던 차에 로빈의 말을 듣게 되고, 로빈에게도 자신과 비슷한 일이 있었다는 걸 알게 된 브룩은 조금 안도하지만, 마지막 루피의 말에 지금까지의 불안감을 완전히 해소하게 된다.

다음 목적지인 어인섬을 향해 가던 밀짚모자 해적단은 구렁이 해류를 만나 위기를 맞지만, 쿠 드 버스트로 탈출에 성공한다. 그리고 마침내 라분을 만났던 언덕으로부터 반대편 세상에 있는 레드라인에 도착한다. 기록 지침에 따르면 그곳은 어인섬 근처가 맞으나, 루피 일행은 정작 어인섬으로 들어가는 방법을 알 수가 없고, 잠수정으로 바다 속을 탐색해보지만, 해수인 바다 토끼만 만나고 돌아온다. 바다 토끼는 루피 일행을 뒤쫓아 와 일행을 위협하지만 루피가 간단히 쓰러뜨린다. 그러자 바다 토끼는 쓰러지면서 뭔가를 토해내는데....

다음 목적지인 어인섬으로 향해 항해하던 밀짚모자 해적단은 레드라인에 다다르고, 인어 케이미와 불가사리 파파구를 만난다. 케이미의 친구인 하찌가 마쿠로 일당에게 납치당했다는 소식에, 루피 일행은 하찌를 구출하기 위해 떠난다. 물고기들의 안내를 따라 납치조직 날치 라이더즈의 아지트로 향하던 중, 하늘에서 나타난 날치 라이더즈의 공격을 받는 밀짚모자 일행. 한편 날치 라이더즈의 아지트에는 철가면을 쓴 보스, 듀발이 이를 갈며 그들을 기다리고 있는데...

케이미와 파파구의 친구인 하찌를 구하러 날치 라이더즈의 아지트로 향하는 루피 일행. 그곳에는 루피 일행에게 깊은 원한을 품고 있는 날치 라이더즈의 두목 듀발이 하찌를 미끼로 기다리고 있었다. 함정인 걸 알면서도 아지트로 들어선 루피 일행은 하찌가 아론 일당의 간부였던 하찌와 동일인물인 걸 알게 되고, 망설임 끝에 구하기로 하는데…

상디의 수배서 그림과 똑같이 생긴 탓에 자신이 얼마나 고생했는지 털어놓는 듀발. 그동안의 분노와 원한으로 듀발과 그 부하인 날치 라이더즈는 상디를 없애려고 하지만 모두 수포로 돌아간다. 날치 라이더즈는 커다란 닻으로 써니 호까지 위기에 빠뜨리려 하지만, 써니 호는 숨겨왔던 비장의 수단으로 위기에서 벗어나고, 비밀병기를 선보이며 날치 라이더즈를 대거 쓰러뜨리는 데 성공하는데...

하찌의 보답으로 문어빵을 포식하던 루피 일행. 듀발은 상디가 바꿔준 얼굴에 대만족하며 루피 일행에게 인사를 하고 사라진다. 루피 일행은 케이미, 파파구, 하찌의 도움으로 어인섬을 가기 위해서는 샤본디 제도에서 배를 코팅해야 한다는 사실을 알게 되고, 코팅 장인을 소개받기로 한다. 샤본디 제도에 도착해 신비로운 풍경에 감탄하던 루피 일행. 하찌는 그 아름다움 뒤에 도사리고 있는 위험을 알고 루피 일행에게 주의를 주는데....

어인섬에 가기 위해 배를 코팅하고자 샤본디 제도에 도착한 밀짚모자 일당. 루피 일행은 잠시나마 샤본디 제도의 새롭고 재밌는 모험을 즐기며 코팅 기술자를 찾아 나선다. 그러던 중 마을에서 소란스러운 소리가 들리고, 그곳에서 루피 일행은 천룡인의 극악무도한 횡포를 접하고 마는데...

현상금 사냥꾼들을 물리치고 드디어 코팅 기술자가 있다는 곳에 도착한 루피 일행. 그곳은 전직 해적인 샤키가 운영하는 바였다. 하지만 코팅 기술자는 나가서 안 들어온 지 오래. 루피 일행은 기술자를 찾아 나서기로 하고, 정보통인 샤키는 이 제도에 루피와 조로를 포함해 억을 넘는 수배자가 11명 모여 있다는 사실을 알려준다.

샤키는 루피 일행에게 소란 피우지 말 것을 당부하고, 루피 일행은 코팅 기술자를 찾아 놀이공원인 샤본디 파크로 향한다. 기술자는 잊고 놀이공원에서 잠시나마 즐거운 한 때를 보내는 루피 일행과 케이미, 파파구, 하찌. 하지만 현상금 사냥꾼에게 정보를 얻은 납치단 두목 피터맨이 놀이공원에 모습을 드러내고, 점점 케이미 곁에 다가가는데…

상디는 납치당한 케이미를 찾기 위해 날치 라이더즈에게 도움을 청한다. 날치 라이더들은 제도 각 지에 흩어진 루피 일행을 찾고, 동시에 납치단을 찾아보기로 한다. 그러면서 루피 일행은 각자 제도에 남아있는 인간의 악한 역사의 잔재를 접하게 된다. 한편 케이미는 경매장에 넘겨지고, 인간 경매장에는 천룡인을 비롯해 수많은 사람들이 모여들기 시작하는데...

인간 경매가 시작되고, 인간들이 하나둘 팔려나간다. 밀짚모자 일행은 날치 라이더들의 도움으로, 피터맨이 케이미를 납치해 경매장에 넘겼다는 사실을 알아낸다. 경매장이 있는 1번 그로브에 밀짚모자 일행과 하찌, 파파구가 하나 둘 모여들고, 케이미를 되찾으려고 하지만, 경매장 직원에게 거절당한다. 나미는 결국 경매에 참가해 케이미를 되찾기로 결심하는데…

인간 경매가 계속 진행되는 가운데, 아직 도착하지 못한 루피는 도중에 조로를 발견하고 경매장을 향한다. 드디어 케이미가 무대에 올라오고, 나미가 입찰준비를 하지만, 천룡인 차를로스가 먼저 거액을 제시하는 바람에 계획은 물거품이 돼버린다. 이때 경매장에 도착한 루피와 조로. 루피는 케이미를 구하러 돌진하고, 하찌는 루피를 막으려다 어인족임이 드러나 궁지에 빠지게 되는데...

루피를 저지하던 하찌는 실수로 어인족임이 드러나게 되고, 차를로스의 총에 맞는다. 분노한 루피는 천룡인 차를로스를 날려버리고, 경매장은 순식간에 아수라장이 된다. 케이미를 구하기 위해 병사들과 한바탕 싸우는 밀짚모자 일당. 로즈워드는 분을 이기지 못하고 해군을 불러들이고, 샤를리아는 케이미를 없애려고 하지만, 갑자기 쓰러지고 만다. 이때 무대를 뚫고 등장한 명왕 레일리가 남은 병사들을 한 번에 제압하는데...

의문의 힘, ‘패기’를 쓰며 등장한 레일리는, 경매장의 병사들을 제압하고, 케이미의 목걸이까지 풀어준다. 키드는 그가 명왕 레일리임을 알아차린다. 레일리는 흩어지면 13번 그로브에서 만나자고 하고, 일행은 경매장을 빠져나가기로 한다. 키드가 먼저 나가며 도발하자 서로 해군을 해치우겠다고 따라나선 트라팔가 로와 루피. 밖은 이미 해군이 포위하고 있는 가운데, 세 명의 선장들은 각자의 능력을 보여주기 시작한다. 한편 이번 사건으로 해군본부에서는 대장 키자루가 나서고, 샤본디 제도를 향해 다가오고 있는데...

루피와 키드, 로는 서로 해군을 해치우겠다며 각자의 능력을 선보인다. 서로의 존재를 인식하고 신세계에서 다시 만나기로 한 세 명의 젊은 해적 선장들. 루피 일행은 날치 라이더즈의 도움으로 해군을 따돌리고 경매장을 빠져나가는데 성공하지만, 로와 키드 일행 앞에는 예상치 못한 인물이 나타나는데…

날치 라이더즈의 도움으로 해군을 따돌리고 샤키의 바에 도착한 루피 일행과 레일리. 레일리는 자신의 정체와 해적왕 로저와의 이야기를 들려주고, 밀짚모자 일당은 소스라치게 놀란다. 이 세계의 모든 걸 알고 있는 전설의 인물 앞에서, 밀짚모자 일당은 궁금한 게 많지만 모험을 통해 알아가기로 하고, 더 이상 묻지 않기로 한다. 이제는 배 코팅이 본업인 레일리. 밀짚모자 일당은 그가 코팅 작업을 하는 동안, 해군 대장을 피해 잠시 흩어져 있기로 한다. 한편, 그 시각, 항구에는 대장 키자루가 대포를 타고 상륙하는데...

배 코팅 작업을 마친 뒤 다시 만나기로 하고 헤어진 레일리와 루피 일행. 그 시각, 항구에는 속속들이 해군이 도착하고, 초신성 보니와, 카포네는 각자의 능력으로 해군에 맞선다. 대장 키자루도 도착해 괴력을 선보이고, 호킨스와 우루지, 드레이크가 긴장하는 가운데 아푸는 계속 지켜본다. 한편 칠무해 쿠마처럼 보이는 이가 여럿 나타나 로와 키드가 고전하는 가운데, 마침내 루피 일행 앞에도 나타나는데…

우루지와 드레이크, 호킨스는 바솔로뮤 쿠마만으로도 모자라 키자루까지 등장하는 바람에 고전을 면치 못한다. 구경만 하던 아푸도 나서서 특이한 능력을 선보이며 잠사나마 키자루를 무력화하지만, 오래 가지는 못한다. 호킨스가 당하기 일보직전, 키자루와 센토마루가 연락이 닿으면서 가까스로 목숨을 건진다. 한편 루피 일행의 길을 가로막은 또 한명의 바솔로뮤 쿠마. 그러나 쿠마와 맞선 적이 있는 상디와 조로는 그가 진짜 쿠마가 아님을 직감하는데…

밀짚모자 일당은 그들 앞에 나타난 칠무해 바솔로뮤 쿠마를 힘을 합쳐 쓰러뜨리지만, 뭔가 다른 느낌을 받고, 진짜 쿠마가 아님을 직감한다. 이때, 도망치려는 루피 일행 앞에 거대도끼를 든 남자, 센토마루가 또 다른 쿠마와 함께 나타나고, 루피 일행은 센토마루를 통해 그들이 파시피스타란 걸 알게 된다. 흩어져 도망치기 시작한 루피 일행, 하지만 결국 그들 앞에 대장 키자루까지 도착하고 마는데…

해군의 전투병기 파시피스타에 고전하는 초신성 키드와 로. 한편 밀짚모자 일당 앞에는 파시피스타를 대동한 센토마루가 나타나 고전하는 가운데 대장 키자루까지 등장한다. 조로가 키자루에 의해 죽기 일보 직전, 레일리가 나타나 키자루를 막는다. 레일리가 키자루를 상대하는 사이 도망치려는 루피 일행. 하지만 파시피스타와 센토마루에 발목을 잡히며 절체절명의 위기를 맞고, 설상가상으로 이들 앞에 진짜 칠무해 바솔로뮤 쿠마까지 나타나는데…

키자루와 센토마루, 파시피스타에 맞서 고전하던 루피 일행 앞에 진짜 바솔로뮤 쿠마가 나타나고, 쿠마는 조로를 감쪽같이 사라지게 만든다. 레일리는 키자루를 상대하느라 여력이 없고, 그 사이 루피 일행은 손도 쓰지 못한 채 차례로 쿠마에게 당해 사라진다. 루피는 동료를 지키지 못한 좌절감에 흐느끼고, 쿠마는 레일리에게 무언가 비밀스러운 이야기를 꺼낸다. 그리고 쿠마는 끝내 루피까지 사라지게 만드는데…

다시 돌아온 시대극 특별편! 그랜드지판의 탐정 루피는 풍차 식당 사람들과 함께 100년에 한번 열리는 가마 경주에 참가하기로 한다. 가마 제작을 부탁하러 목수 프랑키를 찾아간 루피 일행은 그곳에서 스릴러 상회 사람들을 만나게 된다. 수상한 스릴러 상회 사람들은 경쟁자들의 가마를 하나 둘 부숴버리는데…

스릴러 상회의 횡포를 보고 기억이 돌아온 브룩은 죄책감에 다시 스릴러 상회로 돌아가지만, 호그백 일행에게 붙잡히고 만다. 얘기를 듣고 찾아간 루피는 브룩을 구하고 동료애를 확인한다. 한편, 가마가 부서져 의기소침한 루피 두목 일행 앞에 듀발의 날치 건달들과 로라의 롤링 파발대가 찾아와 자신들의 부서진 가마를 재료로 제공한다. 풍차 식당 팀은 다 같이 힘을 모아 가마를 완성하고, 다음날, 드디어 경주가 시작되는데…