Rufy viene trovato da Koby, un mozzo agli ordini della piratessa Alvida.

Rufy e Kobi arrivano a Sheltz Town dove incontrano il temibile cacciatore di pirati Zoro.

Rufy, dopo aver aiutato Zoro, lo convince ad entrare nella sua ciurma. Per Kobi inizia una nuova vita.

Rufy, Nami e Zoro affrontano Buggy, il pirata clown.

La ciurma di Cappello di Paglia si allea con il sindaco della città e con un cane per affrontare Buggy.

Zoro affronta Kabaji, un abile spadaccino. Rufy e Buggy a loro volta si scontrano.

Buggy ricorda il suo vecchio compagno di ciurma Shanks. Buggy insulta Shanks facendo infuriare Rufy. Nami, Zoro e Rufy abbandonano l'isola.

Rufy, Nami e Zoro incontrano il famigerato bugiardo della città, Usop.

Il maggiordomo Klahadore della ricca Kaya, è in realtà un pirata che lavora con un ipnotizzatore per assassinare Kaya.

Zoro e Nami salvano Rufy. Usop tenta di allertare i cittadini della minaccia, ma la gente non gli crede.

Rufy, Nami, Zoro e Usop arrivano giusto in tempo per affrontare i Pirati di Kuroneko.

Kaya scopre la vera natura di Klahadore. Jango ipnotizza i suoi uomini per aumentare la loro forza.

Kuro arriva sulla scena e, con Zoro ferito, Rufy debilitato, Nami e Usop troppo deboli per gestirlo, sembra non ci sia speranza. Tuttavia, la stessa Kaya sembra contrattare con Kuro.

Kuro combatte Rufy, Jango insegue Kaya in ritirata e Zoro affronta Buchi.

Cipolla, Carota e Peperone, i bambini membri della "ciurma" di Usop, intervengono in aiuto di Kaya e combattono contro Jango. Continua il combattimento tra Kuro, conosciuto per la sua velocità nel combattimento, e Rufy.

Zoro arriva in soccorso della ciurma di Usop sconfiggendo Jango. Anche Kuro a sua volta viene sopraffatto da Rufy. Kaya e Merry, un altro suo maggiordomo, come ringraziamento regalano alla ciurma di Rufy un'imbarcazione: la caravella Going Merry. Usop si unisce alla ciurma per realizzare il suo più grande sogno: diventare un coraggioso pirata.

Rufy e la sua ciurma giungono in un'isola che gode della fama di essere stregata alla ricerca di un tesoro. In essa incontrano il vecchio pirata Gaimon che da vent'anni vive in quell'isola insieme a un gran numero di animali stravaganti ma fedeli ed amichevoli. L'uomo, intrappolato all'interno di un forziere, è rimasto nell'isola per difendere un tesoro che lui non ha mai visto. Pertanto la ciurma di Rufy lo aiuta, scoprendo in tal modo che il tesoro è inesistente. Gaimon tuttavia decide di rimanere nella sua isola capendo che l'unico tesoro da difendere non erano altro che i suoi amici animali.

Zoro si ricorda del suo passato e della sua amica Kuina, alla quale prima di morire fece la promessa che sarebbe diventato lo spadaccino più forte del mondo. Questa bambina, figlia del suo maestro di spada Koshiro, era sempre stata molto più abile di lui nell'uso della spada. Zoro pertanto si era duramente allenato per poterla sconfiggere. Infine la ciurma incontra due vecchi amici di Zoro, Yosaku & Johnny.

Rufy e la sua ciurma si dirigono verso il ristorante sul mare, Baratie, per ingaggiare un cuoco. Uno scontro con il capitano Fullbody però fa sì che Rufy danneggi il ristorante. Pertanto Zef, il capo cuoco della nave, lo prende come sguattero per ripagare i danni.

Giunge nel ristorante sul mare un pirata stremato dalla fame di nome Gin. Nessuno vuole servirlo perché è un uomo del temibile Creek. Solo Sanji, il vice capo cuoco, decide di sfamarlo. Gin se ne va ringraziando Sanji.

Creek informato da Gin giunge alla Baratie per sfamare sè e la sua ciurma. Successivamente, ignorando l'aiuto ricevuto, decide di requisire l'imbarcazione.

Creek riconosce nel capo cuoco il pirata Zef Piede Rosso, celebre per la potenza dei suoi calci. Creek pretende che Zef gli consegni il suo vecchio diario di bordo in cui sono contenute informazioni importanti sulla Rotta Maggiore. Nami, dopo aver visto i volantini dei ricercati, fugge con la Merry verso una destinazione sconosciuta.

Improvvisamente la nave di Don Creek viene tagliata in due dal grande spadaccino Drakul Mihawk, cacciatore di pirati e membro della temibile flotta dei 7. Zoro lo sfida, rimanendo però quasi ucciso. Mihawk colpito dalla sua forza combattiva decide di salvargli la vita lanciandogli una sfida per il futuro. Infine Usop, Zoro e Johnny partono all'inseguimento di Nami

Incomincia lo scontro tra i cuochi della Baratie aiutati da Rufy e Creek e i suoi uomini. Sanji si scontra con uno degli uomini più forti di Don Creek, Pearl.

Sanji ricorda il suo passato. Zef gli salvò la vita sacrificando la sua gamba[5] in quanto condivide con lui il sogno di trovare l'All Blue. I due inoltre naufragarono su un'isola deserta nella quale patirono a lungo la fame. Zef lasciò con uno stratagemma tutte le scorte al giovane Sanji. Sopravvissuti a questa esperienza i due decisero di aprire un ristorante nel mare per aiutare tutte le persone che si fossero trovate in quella stessa condizione. Sanji è quindi pronto a tutto pur di difendere la Baratie. Infine Gin si offre volontario per uccidere Sanji.

Sanji e Gin iniziano a combattere fra loro. Quando però sembra che Gin abbia la meglio, il pirata non riesce a finire l'uomo che gli aveva salvato la vita. Rufy cerca di raggiungere Creek.

Creek, infuriato, lancia sulla nave un gas velenoso per sbarazzarsi dei nemici. Tutti si infilano la maschera antigas, ma Gin cede la sua a Rufy. Rufy propone a Zef di lasciarlo andare nel caso riuscisse a battere Don Creek. Così continua lo scontro tra i due.

Rufy sconfigge Don Creek. Gin prende il suo capitano e parte con il resto della sua ciurma.

I cuochi mettono in piedi una farsa per convincere Sanji a partire con Rufy e fargli realizzare il suo più grande sogno: trovare l'All Blue, il luogo in cui i pesci di tutti i quattro mari si incontrano. Sanji, pur scoprendo l'imbroglio, decide di unirsi alla ciurma di Cappello di Paglia e parte sulla sua nave con Rufy e Yosaku alla volta di Arlong Park.

Usop, Zoro e Johnny arrivano nell'isola in cui Nami è sbarcata. Dopo aver ormeggiato scoprono che essa è controllata da un manipolo di temibili uomini-pesce guidati da Arlong. Zoro viene catturato e scopre che Nami è un membro della loro ciurma.

Nami libera Zoro intimandogli di abbandonare l'isola con tutti gli altri. Usop incontra la sorella di Nami, Nojiko.

Usop viene catturato dagli uomini-pesce. Apparentemente Nami uccide Usop gettandolo in acqua. Johnny assiste alla scena. Rufy, Sanji e Yosaku giungono nell'isola. Incontrati gli altri, Johnny racconta a tutti l'omicidio operato da Nami. Nessuno però gli crede.

Usop ritorna dai suoi amici. Racconta che Nami gli ha salvato la vita fingendo di ucciderlo. Per far ciò Nami si è pugnalata la mano e ha gettato Usop in mare.

Giunge Nojiko e racconta a tutti il passato di Nami. Le due sorelle erano state adottate da una giovane donna di Coconut Village: Bellmer. Ella crebbe le due bambine fino a quando giunsero nell'isola gli uomini-pesce. Essi imposero a tutti gli abitanti del villaggio dei pagamenti in denaro. Bellmer non potendo pagare per sé e le sue figlie, si ribellò e fu uccisa da Arlong.

Nojiko continua il suo racconto. Arlong, venuto a conoscenza dell'abilità di Nami nel disegnare le cartine nautiche, decide di portarla con sé. Dopo alcuni giorni, la bambina torna al villaggio dichiarando a tutti di essere entrata nella ciurma di Arlong. In verità, Nami è arrivata ad un accordo con Arlong: in cambio di 100 milioni di berry avrebbe riscattato il Villaggio di Coco. Mentre Nojiko è intenta nel raccontare questa triste storia, la Marina giunge nell'isola con l'intenzione di sequestrare tutti i tesori di Nami.

La Marina in combutta con Arlong, che non vuole perdere il prezioso contributo di Nami, sequestra il tesoro della ragazza. La popolazione del villaggio di Coco capitanata da Genzo, venuta a conoscenza del fatto ed essendo consapevole del patto stipulato con Arlong, decide di ribellarsi e di attaccare la base degli uomini pesce. Nami disperata chiede finalmente aiuto a Rufy e alla sua ciurma.

Rufy, Sanji, Zoro e Usop decidono di sfidare la ciurma di Arlong. Intanto Johnny e Yosaku si mettono alla guardia delle porte di Arlong Park per evitare l'intervento dei cittadini.

Rufy rimane intrappolato in un blocco di pietra e Arlong lo lancia in acqua. Zoro e Sanji vorrebbero aiutare il loro capitano ma vengono trattenuti dai luogotenenti di Arlong Hacchan e Kuroobi.

Zoro riesce a sconfiggere Hacchan ma non può più combattere. Sanji intento a liberare il capitano deve lottare contro Kuroobi. Usop fugge dalla base degli uomini-pesce seguito dall'ultimo luogotenente di Arlong: Pciù.

Sia Kuroobi che Pciù vengono sconfitti, ma anche Sanji non è più in grado di combattere. Nojiko e Genzo liberano Cappello di paglia. Inizia lo scontro con Arlong.

Continua lo scontro tra Rufy e Arlong. Il giovane pirata appare in difficoltà.

Rufy sconfigge Arlong e distrugge il suo palazzo. Anche lo studio simbolo della prigionia di Nami viene distrutto.

Inizia una gran festa al villaggio di Coco per la sconfitta di Arlong. Nami decide di prendere il mare con i suoi nuovi amici, desiderosa di realizzare il suo più grande desiderio: disegnare una cartina del mondo intero. Prima di partire Nami deruba tutti i suoi concittadini per stemperare la tristezza derivante dalla sua partenza.

Saliti sulla nave, la ciurma scopre un volantino con il volto di Rufy ed una taglia di 30 milioni di berry. Mihawk, venuto a conoscenza del fatto, decide di portare la notizia a Shanks il rosso.

Bagy il Clown, dopo varie vicissitudini, arriva nell'isola del vecchio pirata Gaimon con il quale stringe una sincera amicizia. Successivamente, incontra Albida che, dopo avere mangiato uno dei frutti del diavolo, quello Swish-Swish, che rende il corpo scivoloso, è diventata anche una bellissima donna.

Moji e Kabaji, convinti della morte dell'amato leader, iniziano a combattere fra di loro per decidere chi sarà il nuovo capitano. Dopo una lunga lotta sembra prevale Richi, il leone di Moji, che li colpisce nel sonno. Nella notte i pirati vengono catturati da un gruppo d'indigeni. Ma Bagy e la sua nuova alleata vengono in aiuto dei pirati liberandoli.

La Going Merry arriva a Rogue Town, isola natale del grande Re dei pirati Gol D. Roger dove fu anche giustiziato. I membri della ciurma si dividono per far compere. Rufy va alla ricerca del luogo in cui fu giustiziato Gold Roger. Incontra Smoker, un capitano della Marina. Giungono nell'isola anche Bagy ed Albida alla ricerca di Rufy.

Zoro con l'aiuto di Tashigi, vice di Smoker, acquista le sue nuove spade. Esse sono dotate di un grande potere. Bagy continua a cercare Rufy.

Usop intento a comprare un nuovo paio di occhiali da cecchino inizia a litigare con una bambina. Lei è la figlia di Daddy Masterson, un temibile cacciatore di pirati ormai in pensione, che sfida a duello Usop. Il pirata dal naso lungo riuscirà nell'impresa dimostrando il suo coraggio e la sua grande precisione.

Sanji, mentre è alla ricerca di cibo per le scorte della nave, incontra un pesce molto raro che però non è in vendita, ma può essere vinto solo partecipando ad un concorso di cucina. Sanji decide di partecipare e seppur ostacolato dalla bella Carmen, riesce a vincere.

Rufy finalmente trova il luogo in cui fu giustiziato Gold Roger. Ma viene trovato anche da Bagy, Albida e anche dalla Marina. Rufy sta per essere giustiziato sulla gogna in cui anche il re dei pirati fu ucciso. Miracolosamente Rufy riesce a salvarsi e con la sua ciurma riesce a scappare verso la Going Merry. Bagy, la sua ciurma e Albida vengono catturati dalla Marina, ma riescono poi a fuggire e a prendere il mare.

I pirati riprendono il mare essendo ormai arrivati ai confini della Rotta Maggiore. Sulla nave i cinque pirati ribadiscono i loro desideri e la loro amicizia.

In una notte tempestosa una bambina di nome Apis scappa da una nave della Marina. La bimba giunge sulla nave di Cappello di Paglia. All'inizio è un po' intimorita dai pirati, ma ben presto familiarizza con loro, confidandogli così di essere fuggita dalla Marina.

Giunti nell'isola di Apis, la bimba conduce i giovani dal suo anziano nonno. La bambina durante un estenuante racconto del vecchio sparisce nel nulla. Rufy, avendola seguita, scopre che Apis ha come amico un vecchio drago di nome Ryu. La bambina può comunicare con lui in quanto ha mangiato uno dei frutti del diavolo ovvero quello Whisper-Whisper che le permette di parlare con qualsiasi animale.

Il vecchio Ryu esprime il desiderio di andare nell'isola perduta in cui afferma potrebbe riprendere le forze. Erik, un mercenario al soldo dell'ammiraglio di divisione Nelson (che vuole ottenere l'immortalità con le ossa del vecchio Ryu), arriva sull'isola. Erik ha mangiato uno dei frutti del diavolo, quello Gust-Gust che gli permette di scatenare fendenti d'aria tagliente dalle mani. La ciurma di Rufy però riesce a prendere il mare con Ryu e Apis.

La ciurma di Rufy arriva in quella che dovrebbe essere l'isola perduta ma ben presto capiscono che non è quella. In essa però trovano le indicazioni per quella vera.

Erik, che ha ormai raggiunto la Ciurma di Cappello di Paglia, si scontra con Zoro. Nel frattempo, gli altri riprendono il mare, ma si ritrovano di fronte alla flotta dell'ammiraglio Nelson.

Rufy, Sanji e Zoro iniziano a combattere contro la potente flotta dell'ammiraglio Nelson che ormai li ha circondati. Ryu cerca di aiutare i suoi amici, ma a sua volta viene colpito dai cannoni e ferito gravemente. Rufy arrabbiato distrugge la nave dove si trova Nelson, dividendola in due con un devastante calcio.

Ryu con un ultimo grido chiama i suoi compagni che arrivano a centinaia: il luogo della battaglia navale non è altro che l'Isola Perduta o il Nido dei Draghi. Apis capisce finalmente che il vecchio Ryu era venuto a morire in quell'isola. Ma mentre il vecchio Ryu muore, le uova dei draghi si schiudono mostrando il ciclo della vita. Nel frattempo, Erik trova ed uccide l'ammiraglio Nelson e si scontra con Rufy, il quale, nonostante le ferite provocategli dalle potenti tecniche dell'avversario, riesce a resistervi ed a sconfiggerlo per poi lanciarlo via con un Gom Gom Bazooka.

Prima di entrare nella Rotta Maggiore, la ciurma di Rufy deve scalare con la Going Merry la Reverse Mountain, un'alta montagna. L'improvvisa comparsa di Erik, che si era nascosto dentro la nave per vendicarsi, non causa problemi in quanto Nami provvede tempestivamente a farlo cadere con un calcio ed i ragazzi riescono nell'impresa. Ma, all'arrivo, una grandissima balena ingoia la nave.