קובי, ילד השייך לצוות פיראטים של פיראטית בשם אלוידה וחולם להיות קצין בחיל הים, מוצא בתוך חבית את לופי, ילד הטוען שהוא יהפוך להיות מלך הפיראטים. קובי מגלה שלופי יכול למתוח את גופו כמו גומי כתוצאה מאכילה מפרי שטן. לופי מביס את אלוידה וקובי יוצא איתו למסע.

לופי וקובי מגיעים לאי בו נמצא בסיס של חיל הים. הם מגלים שתושבי האי חיים בפחד מפני מפקד חיל הים, קפטן מורגן ובנט המלפו, אשר משליטים הרס בעיר. הם הולכים לבסיס ורואים את צייד הפירטים רורונואה זורו, אשר מוזחק שם בשבי. לופי מחליטל גייס את זורו לצוות הפירטים שלו.

לופי משכנע את זורו להצטרף לצוות שלו ולאחר שלופי מחזיר לזורו את חרבותיו, הם מביסים את קפטן מורגן. לאחר מכן, לופי עוזר לקובי להגשים את חלומו ולהצטרף לחיל הים.

בזמן שלופי וזורו שטים, כובעו של לופי כמעט עף והוא נזכר בחברו הטוב, פיראט בשם שאנקס, ובחוויה שקרתה לו בילדותו. לאחר מכן, ציפור תופסת את לופי ולוקחת אותו לעיר שבה נמצא הפיראט באגי הליצן. לופי פוגש את נאמי ומביס פיראטים מהצוות של באגי.

לופי מבקש מנאמי להצטרף לצוות שלו בתור נווטת והיא מסרבת. נאמי לוקחת את לופי לבאגי הליצן ומצווה להרוג אותו אך לא עושה זאת וזורו נחלץ לעזרתו. זורו נלחם בבאגי הליצן אך מפסיד כיון שבאגי אכל מפרי שטן כמו לופי, אך לבסוף הם מצליחים לברוח.

לופי, זורו ונאמי פוגשים את שו-שו, כלב השומר על חיות למזון לבעלי חיים שבה פעם חי עם בעליו ומחכה שהוא יחזור. הם פוגשים את ראש העיר ומגלים שבעליו של שו-שו מת. לופי נלחם נגד מוג'י, פיראט בצוות של באגי, ההורס את החנות של שו-שו ומביס אותו.

לופי, זורו ונאמי פוגשים פיראט נוסף בצוות של באגי, האקרובט קאבאג'י. זורו נלחם נגדו ולבסוף מנצח. לופי מתחיל להילחם בבאגי ומגלה שבאגי הוא יריב מסוכן כי הוא יכול לפצוע את לופי.

לופי ממשיך להילחם בבאגי. הוא מגלה שבאגי מכיר את שאנקס. לבסבוף הוא מנצח את באגי בעזרת נאמי. נאמי מצטרפת לצוות ולאחר ומפליגים מהאי לאחר שתושבי האי חושבים שהם האשמים לכל ההרס.

הצוות מגיע לכפר סירופ ומכירים ילד בשם יוזופ, הידוע כשקרן הגדו לשל האי. הם מגלים שיוזופ הוא בנו של יאזופ, חבר בצוות של שאנקס.

לאי מגיע בחור מוזר בשם ג'אנגו, המהפנט אנשים והולך אחורה כל הזמן. יוזופ, מבקש מקאיה לתת לצוות ספינה אך מגורש מביתה ע"י המשרת קלהדול.

אוסופ ולופי מגלים על הקונספרציה ועל התחבולה של קפטן קורו ועל התוכנית שלו, ולאחר מכן יוסופ רץ לספר את השמועה בעיר ולקאיה אבל בגלל היותו שקרן כפייתי אף אחד לא מאמין לו.

צוות כובעי הקש ויוסופ מתכננים איך לעצור את פלישת הפיראטים של קורו, אבל טועים בכיוון של החוף. כעת כולם רצים לחוף הצפוני ובינתיים הפיראטים כבר הגיעו. יוסופ מגיע ראשון ונאלץ להתמודד איתם לבדו.

לופי וזורו הגיעו לחוף שבו מתרחש הקרב, ג'אנגו מהפנט את הפיראטים ומוסיף להם כוח עצום! בעוד שלופי מאבד הכרה וזורו נאלץ להלחם באחים ניבאן שהופנטו.

שאמאן ובוצ'י מנסים לתקוף את קלהדול לאחר שגער בהם אך הוא חושף את יכולותיו ושולח אותם חזרה לקרה. זורו מצליח להביסם ונאמי מצליחה להעיר את לופי.

לופי מתחיל להילחם נגד קורו ויוזופ מורה לחבורה שלו לקחת את קאיה למקום מבטחים. ג'אנגו מתחיל לרדוף אחריהם. קורו מספר על העבר שלו ועל תוכניתו.

הקרב בין לופי וקורו ממשיך בעוד למרות כל המאמצים, ג'אנגו תופס את קאיה.

הקרב בין לופי וקורו מסתיים בניצחון של לופי. יוזופ וזורו מצליחים להביס את ג'אנגו ולהציל את קאיה. קאיה נותנת לצוות ספינה חדשה ה-"גוינג מרי" ויזוופ מצטרף לצוות.

הצוות מגיעים לאי שבו הם פוגשים איש בתוך תיבה בשם גאימון, התקוע על האי. הם מגלים שבאי זה חיות חיות מוזרות שלא ראו בשום מקום אחר. הצוות וגאימון מתיידדים ולופי עוזר לגאימון להשיג תיבות אוצר שחיפש.

בעוד זורו ישן על הספינה, הוא נזכר בילדותו ובחברתו/יריבתו קווינה ועל השבועה שנשבעו. בסוף הפרק פוגש הצוות שני חברים וותיקים של זורו, ג'וני ויוסאקו.

הצוות פוגש בג'וני ויוסאקו, שותפיו של זורו לצייד פיראטים לשעבר. לאחר שנאמי מרפא את יוסאקו מהמחלה בה חלה, צפדינה, הם יוצאים אל המסעדה הימית הצפה, בחיפוש אחר טבח. בעקבות עימות עם ספינת מארין, לופי פוגע במסעדה, ונאלץ לעבוד במקום במשך שנה.

לאחר שפיראט רעב בשם גין נזרק מהמסעדה מפני שלא יכל לשלם על ארוחה, סאנג'י מגיש לו אוכל. לופי שמתחיל לעבוד במסעדה כמלצר, מנסה לשכנע את סאנג'י להצטרף לצוות, אולם סאנג'י מתעקש להשאר במסעדה.

לאחר שגין חוזר למסעדה ביחד עם הקפטן שלו, דון קריג, קריג מרמה את סאנג'י, מקבל אוכל, ולאחר מכן דורש 100 ארוחות עבור אנשיו ואת הספינה. למרות התנגדותם העזה של הטבחים, זף מסכים.

בעל המסעדה, זף, מתגלה כפיראט גדול המכונה "אדום הרגל", אשר הפליג בעבר בגראנד ליין, אך בשלב מסוים בחייו איבד את רגלו. גין מספר אודות האסון שאירע להם במהלך ההפלגה שלהם, כשהם נתקלו ב-"עין הנץ" מיהוק, שהרס את כל הספינות שלהם פרט לספינה אחת. לאחר שאנשיו אכלו וכוחם חזר אליהם, דון קריג פותח בהתקפה על הבאראטי, כאשר מיהוק מופיע בשדה הקרב.

הפיראטים של דון קריג נלחמים על המסעדה. שני טבחים, פטי וקרנה, מנסים לתקוף את דון קריג בעזרת ספינה קטנה אך נכשלים. סאנג'י מתחיל להלחם נגד פנינת הפלדה. בינתיים, ג'ין מצמיד רובה לראשו של זף ומציע לסאנג'י אלטרנטיבה.

פנינת הפלדה מכה בסאנג'י ללא הפסקה בגלל שג'ין חטף את זף ואיים להרוג אותו. סאנג'י נזכר איך הכיר את זף ואיך זף הציל את חייו.

לופי משמיד את רצפת המסעדה בעוד שג'ין מחסל את פנינת הפלדה, מתחיל להלחם בסאנג'י בעצמו ומצליח לדחוק את סאנג'י לפינה אבל לא מצליח להרוג אותו בגלל העבר שלהם. דון קריג רותח מזעם ומשחרר פצצת רעל ומורה לג'ין לזרוק את מסכת הגז שלו, מה שג'ין עושה.

פצצת הרעל פוגעת בג'ין קשות והוא גוסס. לופי מתחיל להלחם נגד קרייג. קריג משתמש בסוגים רבים של נשק ולבסוף שולף את הנשק האיימתני שלו "החנית". הוא מעיף את לופי וכמעט מביס אותו. זף מסביר שלופי יכול לנצח בגלל האמונה שלו והרצון שלו. לופי מצליח לשבור את חוד החנית של קריג.

לופי מביס את קריג אך נופל לים וניצל ע"י סאנג'י. ג'ין עוזב את המסעדה ביחד עם כל השודדים ומודיע שהוא יחכה ללופי בקו הגדול.

דון קריג הובס, והחיים על המסעדה חזרו למצב נורמלי. סאנג'י מחליט לעזוב ביחד עם לופי. יוסאקו בא ומודיע שנאמי ברחה עם הספינה לאי אנשי הדג ושזורו, יוזופ וג'וני רודפים אחריה. שלושתם יוצאים גם הם לרדוף אחרי נאמי.

בעוד לופי, סאנג'י ויוסאקו שטים לעבר האי של ארלונג, יוזופ, זורו וג'וני מגיעים לאי. זורו נחטף ע"י אנשי דג.

זורו מגלה שנאמי היא בחרת צוות של ארלונג. יוזופ פוגש בנוג'יקו, אחותה של נאמי והיא מצילה אותו מפני איש דג.

זורו בורח מארלונג פארק אך יוזופ נתפס. נאמי אמורה להרוג אותו אך במקום לעשות זאת, היא דוקרת את עצמה ומצילה אותו. לופי, סאנג'י ויוסאקו מגיעים לאי.

ג'וני מספר לצוות איך נאמי כביכול הרגה את יוזופ. לופי לא מאמין לו אבל נאמי מגיעה ומאשרת זאת. היא אומרת להם לעזוב את האי אך לופי אומר שהם יישארו. יוזופ חוזר ומפיח את השמועה על מותו. הצוות פוגש את נוג'יקו והיא מספרת להם את סיפור ילדותה של נאמי.

נוג'יקו מספרת לצוות על אימם החורגת של נאמי ושלה, בלמר. היא מספרת להם איך ביום בהיר אחד, הגיעו אנשי הדג לאי והתחילו לזרוע הרס.

נוג'יקו ממשיכה בסיפורה. היא מספרת להם איך ארלונג הרג את בלמר ואיך נאמי הצטרפה למשפחת ארלונג.

חיל הים בא לביתה של נאמי ודורש את הכסף שאותו גנבה. נאמי מגלה שארלונג בגד בה. אנשי הכפר מחליטים ללכת ולהילחם בארלונג. נאמי מנסה לעצור אותם אך לשווא. לופי בא ואומר לנאמי הבוכה שהוא חבר שלה ושהוא יעזור לה. לופי, זורו, יוזופ וסאנג'י הולכים לכיוון ארלונג פארק בכדי להילחם באנשי הדג.

הצוות מתחיל להילחם באנשי הדג. לופי מתחיל להילחם נגד ארלונג והקרב שקול עד שארלונג תוקע את לופי בבטון וזורק אותו לים.

זורו מתחיל להילחם בהאטצ'ן, תמנון פיראט בצוות של ארלונג. לבסוף הוא מביבס אותו.

סאנג'י נלחם בקורובי, איש דג קראטיסט ולאחר קרב קשה, מנצח אותו. יוזופ בורח מהאיזור כשאחריו דולק צ'ו, אחד מהפיראטים של ארלונג. לבסוף הם מתחילים להילחם ויוזופ מביס אותו.

זורו וסאנג'י מנסים למונע מהאטצ'ן להגיע ללופיץ אל ארלונג מביס אותם בקלות. הפצע של האט'צן נפתח והוא לא מגיע אל לופי. לופי משתחרר ומתחיל להילחם נגד ארלונג.

לופי מתחיל להילחם בארלונג ברצינות ומגלה על יכולתו של ארלונג לשחזר את מלתעותיו.

הקרב של לופי וארלונג מגיע אל סופו בניצחון של לופי.

תושבי האי חוגגים ביחד עם הצוות. לבסוף הצוות מםליג משם לעבר הלא נודע.

בעוד הצוות שט לו בשקט, בממשלה נערכת ועידה חשובה שבה מוחלט לתת ללופי באונטי. בפרק מראים את התגובות של אנשים בכל מיני מקומות שונים לבאונטי שניתן לו.

לאחר הקרב שלו עם לופי, באגי עף לאי אחר עם חלקי גוף חסרים. וכך באגי יוצא למסע שלו בחיפוש אחר הצוות שלו והחלקים החסרים, בדרכו מתידד עם אנשים בלתי סבירים.

צוותו של באגי משערת שהוא כבר מת, והצוות מתחיל להתווכח ולריב מי יקח את מקומו של הקפטן, רק כדי להתיפס על ידי שבט קניבלים.

הצוות מגיע לעיר שבה נולד וגם הוצא להורג גולד רוג'ר, לוגטאון. לופי הולך לכיוון הגרדום ובדרך נכנס לבר. לאחר שהוא יוצא נכנס לבר סמוקר, קפקטן סמוקר, מפקד חיל הים בעיר ומשתמש פרי שטן. אנשיו באים ואומרים לו שהאיש שכרגע פגש היה לופי. בסוף הפרק לופי מגיע לגרדום.

זורו הולך לקנות לו חרבות חדשות כשבדרך הוא פוגש את טאשיגי, סגניתו של סמוקר בעוד היא מביסה שודדים בעזרת חרבה הנדירה. הוא שובר בטעות את המשקפיים שלה ובתור פיצוי היא מכריחה אותו לנקות את בסיס חיל הים. הוא בורח ומגיע לחנות נשקים שבה מתברר שהוא מחזיק בבעלותו חרב נדירה והחרב שהוא רוצה בחנות היא חרב מקוללת. זורו מתגרה בגורל וכשמוכיח שהוא ראוי לחרב, נותן לו אותה בעל החנות בחינם.

פילר - יוזופ רואה בחנות משקפיים מיוחדות שאותן הוא רוצה אך ילדה קטנה לוקחת לו אותן. הוא רודף אחריה ופושג את אביה, צייד הגולגלות הידוע, דאדי האבא. הוא נענה לדו קרב שמנצחו יזכה במשקפיים. יוזופ מפסיד. דאדי מגלה שאביו של יוזופ הוא יאזופ, האיש היחידי שניצח אותו אי פעם בדו קרב. יוזופ מזמין אותו לאתגר נוסף ובו הוא מנצח וזוכה למשקפיים. הוא מגלה שהמקפיים נועדו להיות מתנה ביום הולדתו של דאדי.

פילר - סאנג'י פוגש בכרמן, שפית אשר מחפשת את סאנג'י במשך 10 שנים בכדי להתמודד מולו ולקבוע מי השף הטוב מבין שניהם. הוא מסרב והולך. הוא הוא הולך למזח ורואה שם דג שחלם עליו כשהיה ילד. הוא מבין שהדג הוא פרס בתחרות בישול ומחליט להשתתף. הוא עולה לגמר בקלות ושם מתמודד מול כרמן, מנצח אותה וזוכה בדג.

באגי ואלוידה תופסים את לופי בבימת הגרדום. הם מבצעים לו הוצאה להורג המונית. כשבאגי עומד לחתוך את לופי, לופי מחייך, דבר הנעשה רק ע"י גולד רוג'ר. שנייה לפני שהוא מת, ברק מכה בבאגי ומשחרר את לופי. לופי והצוות מתחילים לברוח לעבר ספינתם.

הצוות בורח לעבר ספינתם. זורו פוגש בטאשיגי ומביס אותה בדו קרב. לופי נעצר ע"י סמוקר, נלחם איתו ומפסיד. לפתע מופיע איש בתוך שכמייה ירוקה. סמוקר קורא לו "דראגון". האיש מעיף את סמוקר ומציל את לופי. הצוות מגיע לספינתם בשלום ומתחיל לשוט לעבר הקו הגדול. באגי וסמוקר יוצאים שניהם בנפרד אחרי לופי לקו הגדול.

הצוות נתקל בילדה צפה על פני הים ומחליטים לעזור לה, הם נרדפים בידי המארינס ונתקלים בדרקון, אותו הם מנסים להחזיר לביתו.

נחשף כי בקאלם בלט אין רוחות או זרמים, וכי מקום זה הוא ביתם של הרבה סי קינג ענקיים. אפיס מגבשת תוכנית עם עזרתו של לופי, ובורחת מהסי קינג ע"י רכיבה על עיטוש של אחד מהם. לאחר מכן, הצוות מגיע לגונקאן איילנד, שם הם מקשיבים לסיפור המרדים על יצירתו של האי. לאחר שעקבו אחר אפיס למערה בה נמצא דרקון, לופי ונאמי מגלים את הסיבה שבגללה אפיס היא מבוקשת.

עכשיו, כשהצוות מודע לסיבות שבגללן אפיס מבוקשת, הם ממהרים לעזוב את האי בכדי שהדרקון ריוג'י יוכל להינצל, אך הם פוגשים ביריב שרוצה את ריוג'י לעצמו. זורו ואוסופ מביאים את הספינה לסלע דק בצד, בזמן שנאמי ואפיס מעלות את ריוג'י לעגלה. לופי וסאנג'י נלחמים במארינס בכדי לקנות זמן בשביל כל ההכנות. לבסוף, הספינה מושכת את העגלה בחיפוש אחר האי האבוד.

לאחר שהגיעו למה שיכול להיות האי האבוד שכובעי הקש חיפשו, הם מוצאים מקדש ישן עם ציורים שאולי מראים היכן האי האבוד נמצא באמת. בנוסף, אריק עקב אחריהם לכל אורך דרכם.

זורו נותר להלחם עם אריק, בזמן שלופי והשאר רצים לספינה בכדי להגיע לאי האבוד, רק כדי להיתקל בצרות נוספות.

בסופו של דבר, אדמירל נלסון ראה מבעד לשאיפות של אריק, אבל הוא לוקח זאת בצורה יותר מדי אישית, וכעת חייו של הדרקון המיסטי נמצאים בסכנה.

בכוחותיו הנותרים, ריוג'י קורא לכל חבריו הדרקונים, והאי האבוד עולה לפני השטח. בינתיים, לופי מחסל את אדמירל נלסון ואנשיו.

לאחר שעזבו את גונקאן איילנד, הגואינג מרי כעת מתקדמת לעבר הגראנד ליין, והצוות חוזר להרפתקה הגדולה.