Luffy et ses compagnons tombent sur un mystérieux bateau pirate où règne l'anarchie après avoir échappé à une vague géante. Après cette péripétie, ils arrivent sur une île printanière habitée par d'étranges animaux. Le Vogue Merry est capturé par l'équipage des Foxy Pirates.

Après les retrouvailles entre Tonjit et son cheval, ces derniers sont attaqués par le capitaine Foxy et ses subordonnés, qui défient Luffy dans un Davy Back Fight, un jeu de pirates entre deux équipages où il est possible, entre autres, d'acquérir des membres de l'équipage adverse.

Le premier Round du Davy Back Fight est une course qui se déroule autour de l'île, chaque participant utilisant des petits bateaux. Très vite, Zoro et Chopper sont éliminés. De mauvaises augures pour l'équipage du Chapeau de paille ?

Avec seulement Luffy, Nami et le bateau de Porche en course, la bataille fait ravage à l’approche de la ligne d’arrivée. Mais grâce à Foxy et son fruit du démon, Porche parvient à remporter la course. Foxy décide alors de prendre Chopper dans son équipage. Le deuxième Round du Davy Back Fight est sur le point de commencer.

Sans Chopper, Sanji et Zoro doivent affronter les Foxy Pirates dans un jeu de balle en équipe mais sont perturbés par une tricherie flagrante des adversaires et un arbitre partial.

Malgré leurs différents, Sanji et Zoro parviennent à battre l'équipe adverse en travaillant en équipe. Luffy choisit le cheval de Tonjit, Shelly plutôt que Chopper.

Les Mugiwaras affrontent l’équipage de Foxy dans une course de rollers, se tenant sur la piste entourant le stade. L'équipe dont le marqueur finit en tête au bout des 5 minutes réglementaires est déclaré vainqueur.

Après de nombreuses péripéties, l'équipage du Chapeau de paille parvient à remporter la course et donc, le Davy Back Fight.

Malgré le retour de Chopper dans l'équipage après la victoire de Luffy, l'équipage du Chapeau de paille accepte de nouveau un autre Davy Back Fight contre l'équipage de Foxy.

Après sa victoire dans le premier Round, Foxy décide de prendre Robin cette fois-ci car il apprécie grandement les pouvoirs de son fruit du démon. Le deuxième Round va bientôt débuter.

Avec une nouvelle défaite des Chapeaux de Paille, Chopper retourne encore dans l'équipage de Foxy. Pour récupérer ses amis, Luffy devra vaincre Foxy dans un duel qui se déroule sur le navire des Foxy Pirates.

Luffy continue son affrontement déloyal contre Foxy et les gadgets présents dans le navire. Le combat se poursuit à l'intérieur du navire des Foxy Pirates.

Luffy parvient enfin à vaincre Foxy en retournant sa capacité contre lui. Après avoir renvoyé ses nouveaux membres d'équipage, l'équipage du Chapeau de paille part à la recherche d'un charpentier.

Un personnage mystérieux apparaît pendant la nuit et vole les souvenirs de l'équipage. Le matin suivant, Robin est la seule à se souvenir de leurs aventures et essaie ainsi d'aider ses compagnons. Mais sans leurs souvenirs, la tâche est loin d'être simple...

Robin pense que seuls ceux qui dormaient ont perdu la mémoire. Luffy et les autres se souviennent alors d'avoir vu le garçon mystérieux qui jouait une sorte de flûte. Plus tard dans la nuit, ils découvrent le garçon à l'extérieur et Luffy tente de le combattre.

Pendant la nuit, Usopp, Chopper et Sanji se demandent ce qui les a amenés à monter à bord du Vogue Merry. Le matin suivant, Usopp leurs construit un radeau afin d'accoster sur l'île afin de trouver des indices pour retrouver leurs mémoires.

Sur le chemin du Palais du Dragon, le groupe de Robin rencontre un Zoro subjugué. Voyant que Zoro souhaite se battre, Luffy ordonne à ses amis d'avancer sans lui. Comment le combat va-t-il se finir ?

Acculé par les Chapeaux de Paille, l'hippocampe répand des illusions basés leurs mémoires pour les distraire. De même, Il leurs vole leurs souvenirs. Luffy le bat alors et tout le monde retrouve la mémoire mais les habitants de la ville sont convaincus qu'ils sont les voleurs de mémoire.

Luffy sauve Foxy, Hambourg et Porche d'une tempête en mer. Quand ils retournent sur le navire de Foxy, le Sexy Foxy, ils le trouvent commander par un nouveau capitaine. Foxy accepte un Davy Back Fight afin de regagner son navire et son équipage. Enfilant à nouveau l'afro, Luffy aide son ancien adversaire.

Lorsque Foxy récupère son équipage, il capture les Mugiwaras. Nami et Luffy combattent Foxy et malgré sa défaite, son équipage l'accepte de nouveau. Quelque temps plus tard, Luffy et les siens se rendent sur une île où ils rencontrent une ancienne connaissance de Robin, un certain marine nommé Aokiji.

L'homme qu'ils viennent de rencontrer, l'Amiral de la marine Aokiji, semble être incroyablement paresseux. Il montre d'abord la capacité du fruit du démon afin que les habitants de l'île puissent la quitter. Malheureusement pour l'équipage du Chapeau de paille, il semble déterminer à attraper Robin. Luffy , Sanji et Zoro vont tenter de s'interposer.

Sous les yeux de ses amis, Robin se fait congeler par l'Amiral Aokiji. Luffy l'affronte en duel. Parviendra-t-il à se défaire d'une des plus grandes puissances de la marine ?

Après que le Vogue Merry échappe de justesse d'être frappé par le "Train des Mers", l'équipage du Chapeau de Paille rencontre une vieille femme du nom de Kokoro et sa petite fille, Chimney. Kokoro donne à Luffy une carte de Water Seven. Luffy, Usopp et Nami achètent des petits monstres marins appelés "Yagara" pour circuler dans la métropole aquatique.

Luffy, Nami et Usopp obtiennent d'étranges salutations de la part des résidents puis ont la chance de découvrir les canaux en forme de Grands huit de Water Seven, la métropole aquatique. Ils trouvent après des pirates qui ont été battus par des artisans puissants de Galley-La Company. Chopper perd Robin et Zoro est menacé par certaines personnes étranges sur le bateau.

Les personnes qui ont attaqué Zoro se révèlent être la redoutée " Franky Family ", bien qu'elle n'ait pas pu rivaliser avec notre sabreur. Luffy a échangé son or contre de l'argent. Ensuite, lui, Nami et Usopp rencontrent un homme qui ressemble à Usopp. Il se nomme Kaku et est un charpentier de Galley-La Company. Deux des valises contenant l'argent sont volées par la Franky Family, alors que Luffy parlait avec Icebarg.

On voit Pauly quand il récupère l'argent volé à Usopp qui court pour le reprendre. Kalifa montre à Luffy et les autres le quais 1 et leur explique comment Icebarg a fondé Galley-La Compagny. Kaku revient du Vogue Merry et leur dit qu'il ne pourra plus être réparé.

Luffy refuse de croire que le Vogue Merry n'est pas réparable. Ensuite, Luffy et Nami se rendent vite compte que non seulement Usopp a disparu mais que les deux valises sont vides. Nami décide de se rendre à la Franky House, et trouve Usopp sur la route dans un état ​​pitoyable. Comme elle se dirige vers le navire pour demander de l'aide, Usopp va à la Franky House lui-même.

Luffy, Sanji, Zoro et Chopper suivent les traces de sang qu'Usopp a laissé derrière lui jusqu'à la Franky House. Ils entrent dans la maison, et apprennent que Franky est absent et qu'il a pris l'argent avec lui. Luffy décide de se séparer du Vogue Merry.

Alors qu'ils sont de retour sur leur bateau, Luffy dit finalement à Usopp que le Vogue Merry ne peut plus être réparé et qu'ils doivent choisir un nouveau bateau. Usopp pense que Luffy a perdu la dignité de leur bateau, Usopp déclare alors qu'il quitte l'équipage. Il défie Luffy en duel et lui dit que s'il gagne, il prendra le Vogue Merry. L'équipage, ne sachant que faire, ne peut que regarder les deux anciens compagnons se livrer un duel.

Usopp n'est pas d'accord avec Luffy au sujet du Vogue Merry et le provoque en duel. L'affrontement commence !

L'Équipage du Chapeau de Paille passe la nuit dans un hôtel. Le lendemain matin, Nami retrouve l'équipage et leur annonce des nouvelles surprenantes : quelqu'un a tiré sur Icebarg. Chopper et Sanji ont découvert qu'une Aqua Laguna approchait. La Galley-La Company cherchent des réponses et le/les coupable(s). Nami et Luffy décident de se rendre au chevet de Icebarg.

Franky commence son combat. Il roue Luffy de coups et prend rapidement l'avantage. Il encaisse les coups de Luffy. Il s'apprête à lui donner le coup de grâce quand les contremaîtres arrivent et commencent à combattre Franky. Mais il arrive à les battre et donne un énorme coup de vent sur un bateau cassé qui s'effondre sur la population.

Les membres de la Galley-La Company attaquent Luffy et lui disent que Nico Robin est une de ses pirates, Nico Robin et un homme masqué, qui ont attaqué Icebarg. Franky est très énervé car "ils lui ont volé son adversaire". Une gigantesque vague appelée l'Aqua Laguna est en approche de Water Seven. Sanji et Chopper partent prévenir Usopp. Luffy part à la rencontre de Icebarg, pour lui demander ce qu'il se passe. Icebarg lui rétorque qu'il veut voir Robin une dernière fois pour lui demander quelque chose.

Dans un bar, Kokoro est en train de parler à Franky d'une théorie à propos de qui aurait pu tirer sur Icebarg. Des rumeurs disent que Nico Robin aurait été aperçue, accompagnée d'un membre d'une organisation, qui se fait appeler le CP9. Alors que l'Équipage du Chapeau de Paille se cache des habitants en colère, Sanji et Chopper retrouvent Robin. Cette dernière leur dit alors que c'est elle qui a tiré sur Icebarg. Robin demande alors à Sanji et à Chopper de l'oublier, elle ne veut plus faire partie de l'équipage.

Chopper retrouve les autres sans Sanji. Luffy décide que pour comprendre la vérité, ils doivent pouvoir attraper Robin. Usopp tente de réparer le navire assez bien pour qu'il puisse survivre à l'Aqua Laguna, pendant que Franky capture Usopp pour faire sortir Luffy de sa cachette. L'équipage du Chapeau de paille se dirige vers la Galley-La Compagny.

L'Équipage du Chapeau de Paille (excepté Sanji, qui manque toujours à l'appel), se dirige vers le siège de la Galley-La Company, où se situent Nico Robin et le CP9. Dans la pièce d'Icebarg, un homme mystérieux vu auparavant dit à Robin qu'ils ont délibérément choisi d'attaquer les Chapeaux de Paille. Leur véritable cible, ce sont les plans de l'Arme Antique Pluton que Icebarg semble avoir donné à Pauly. Monkey D. Luffy se retrouve coincé entre deux bâtiments, séparé de son équipage.

Tileston s'est fait battre par l'homme possédant un masque d'ours. Nico Robin parle toujours à Icebarg à l'intérieur de sa pièce. Le Gouvernement Mondial sait que Robin peut lire les Ponéglyphes. Et le CP9 pense que Icebarg détient les plans de l'Arme Antique Pluton. Les ennemis masqués se révèlent des personnes que Icebarg connaît bien. Ailleurs, Paulie explique à Luffy que les plans qu'il a en sa possession sont des faux.

Rob Lucci explique à Icebarg ses différentes théories et demande à Kaku de vérifier si ce à quoi il pense est vrai, en prenant le pouls d'Icebarg. Les agents du CP9 suspectent qu'un ami du passé d'Icebarg, Cutty Flam, soit en réalité Franky, leur théorie se révèle être véridique. De plus, Lucci pense que Franky détient les plans de l'Arme Antique Pluton. L'Équipage du Chapeau de Paille, accompagné de Pauly, retrouvent le CP9 et Icebarg.

Luffy et les membres de l'Équipage du Chapeau de Paille veulent que Robin revienne dans l'équipage. Elle refuse et déclare qu'elle ne pourra jamais accomplir son rêve si elle reste avec eux. Luffy tente de la rattraper mais les agents du CP9 l'en empêchent. Robin s'échappe facilement et Rob Lucci montre ses différentes "transformations".

La transformation de Rob Lucci provient d'un Fruit du Démon de type Zoan : le Neko Neko no Mi, modèle: Léopard. Lucci se débarrasse rapidement de l'Équipage du Chapeau de Paille et les autres agents du CP9 attachent Pauly et Icebarg, les laissant à la merci du bâtiment en flamme. Dans l'entrepôt de Franky, Usopp raconte sa malheureuse histoire à Franky, ce dernier, ému, lui parle un petit peu des contributions de Tom pour Water Seven.

Franky dit à Usopp que le Vogue Merry ne pourrait pas atteindre la prochaine île. Franky commence alors à le détruire, Usopp tente de l'en empêcher mais remarque alors que le bateau tombe en lambeaux. Il déclare qu'il le savait déjà mais il ne voulait pas l'abandonner, il l'a réalisé lorsqu'il a aperçu une mystérieuse personne réparant le bateau sur Upper Yard. Usopp pense que la personne qu'il a vu cette nuit-là était le Vogue Merry en personne. Franky lui dit que se devait être un Klabautermann, une très vieille histoire, qui raconte que le Klabautermann serait l'esprit du bateau et ne se manifesterait que si le bateau était aimé par ses compagnons de voyage, et heureux avec eux.

Les agents du CP9 découvrent la pièce secrète de Franky. Un long flashback du passé de Franky chez Tom's Workers commence, Tom est arrêté pour avoir construit l'Oro Jackson, le bateau de Gol D. Roger. Le juge Jorge lui accorde un sursis de dix ans pour construire le train des mers. Ce dernier est donc construit en dix ans grâce à Tom, Icebarg, Franky et Yokozuna.

Spandam, un représentant du CP5, est déterminé à mettre Tom derrière les barreaux pour récupérer des plans. Alors que Franky se rend en ville, des personnes du Gouvernement Mondial commencent à attaquer avec l'aide des bateaux qu'il a personnellement fabriqué. Tom et Icebarg courent en direction de leur chantier naval, où ils sont attaqués par deux des bateaux. Icebarg dit à Franky qu'il doit prendre la responsabilité des évènements, sinon il ne le pardonnera jamais.

Les employés de Tom's Workers sont arrêtés pour la destruction d'un bateau judiciaire. Franky déclare que les bateaux qui l'ont détruit sont les siens mais qu'il ne veut plus que se soit ses bateaux s'ils font de pareilles choses. Cela fait s'enrager Tom qui explique que Franky ne peut pas renier ses bateaux de la sorte. Tom demande à être puni pour son premier crime et que le second lui soit pardonné. Donc, Franky et Icebarg ne partent pas pour Enies Lobby. Mais Franky, très en colère, frappe Spandam au visage ce qui le défigure complètement.

Chopper s'échappe du bâtiment en feu avec Pauly et Icebarg. Icebarg explique à Nami que Robin voulait que tout l'Équipage du Chapeau de Paille survive, exceptée elle-même, et quitte l'île sans aucun problème. Pour se faire, elle s'est rendue au Gouvernement Mondial qui a accepté de laisser libre ses compagnons. Nami le dit à Chopper et, ensemble, ils tentent de retrouver le reste de l'équipage. Ailleurs, le Vogue Merry se lance dans la mer, il semble vouloir être détruit par l'Aqua Laguna se rapprochant.

Pauly aide l'Équipage du Chapeau de Paille en expliquant à la foule qu'ils ne sont pas ceux que l'on croyait. Il demande alors à la foule présente de suivre Chopper pour partir à la recherche des autres membres de l'équipage. Nami arrive à la gare où le train des mers s'apprête à partir. Sanji, qui se trouve lui aussi à la gare, espionne les employés du Gouvernement Mondial qui emmènent Robin avec eux dans le train des mers.

Nami est sauvée de l'Aqua Laguna par Pauly. Un homme vient donner une lettre de Sanji à Nami, il l'informe que Usopp, Franky et lui-même se trouvent à bord du train des mers. Nami le dit à Chopper et part à la recherche de Luffy, qui se trouve coincé entre deux bâtiments, dans la ville basse.

Nami rejoint finalement Luffy et lui dit qu'ils doivent se dépêcher pour rattraper Robin qui s'apprête à partir pour Enies Lobby. Chopper retrouve Zoro qui lui demande de lui donner le Sandai Kitetsu pour qu'il puisse s'échapper de la cheminée dans laquelle il est coincé. Luffy explose les bâtiments entre lesquels il était bloqué en les poussant. Pauly arrive et sauve Luffy, Nami, Chopper et Zoro de l'Aqua Laguna.

Une fois sauvé de l'Aqua Laguna, Kokoro propose à Luffy, malgré la répréhension des habitants et de Pauly, d'utiliser Rocketman, un train incontrôlable. De plus la franky Family, couverte de honte par ses actes contre le chapeau de paille, embarque dans le train pour sauver Franky, et Paulee est caché dans le stock de charbon. Ils montent tous dans le train et partent rejoindre leurs amis.

Le train part du vieil entrepôt, passant par les égouts pour rejoindre la mer. Luffy, qui s'amuse comme toujours, la mamie essaye de placer le train sur les rails pour obtenir la vitesse maximale. Cependant, la petite fille qui s'était introduit sur le train, glisse et s'accroche désespérément. Alors Luffy arrive mais à ce moment-là, le train se met sur les rails et une fulgurante accélération fait envoler Luffy et Chimney mais ils sont rattraper par la Franky Family. Tout le monde se rejoint dans un wagon; Pauly, mais aussi les ingénieurs de la Galley-la Company sont à bords. Maintenant alliés, ils foncent dans la prochaine vague de l'Aqua Laguna. Pendant ce temps, Franky se remémore 4 ans auparavant, les retrouvailles avec Icebarg.

Face aux multiples tirs de la Franky Family, la vague ne laisse pas apparaître une ouverture jusqu'à l'arrivé de Luffy et Zoro. Grâce à l'attaque combinée de ces deux derniers, ils se frayent un chemin à travers l'Aqua Laguna!

À travers l’escargot-phone, Luffy demande à Sanji de commencer l'attaque contre le gouvernement. Aussi étonnant soit-il, Zoro s'inquiète pour le cuistot ! Usopp veut aider son ancien équipage a sauver Robin. Pour cela il se déguise en Sniperking. Ils vont tendre un piège à l'ennemi : rassembler une cinquantaine de soldats dans les deux derniers wagons, et ensuite les décrocher. Sanji, Franky et Sniperking sont maintenant contre le cuisinier ; celui ci est provocateur et arrive sans difficulté a éviter les coups de pieds de Sanji.

Sanji se bat contre le cuisinier, Wanze, l'homme-ramen, dans le wagon 4. Pendant ce temps, Sniperking trouve une idée grâce aux insultes de Franky : Franky passe par le toit, rencontre Nero et engage le combat. Luffy et ses amis sont prêts et impatients. Sanji, à l'aide de couteaux de cuisine, à l'avantage dans son combat contre Wanze. Grâce aux poulpes, Sniperking arrive jusqu'à la vitre de Robin.

On apprend que Nero est un futur super agent de la CP9 comme Kalifa, Rob Lucci, Blueno ou Kaku et qu'il possède l'attaque de s'appuyer contre l'air. Au même moment, le Rocketman va bientôt rencontrer les deux wagons détachés. En continuant sur leurs chemins, l'équipage rencontre un énorme poisson, un Roi des mers, coupé en deux; ce qui signifie que Zoro a un adversaire à rencontrer....

Face à T-Bone, la Franky Family panique mais Luffy fait confiance a Zoro, qui souhaite le vaincre. En un coups, Zoro réussi facilement a esquivé l'attaque de T-Bone et l’envoie hors du train. Sanji a définitivement terminé son combat contre Wanze en défonçant les portes des wagons jusqu'à wagon 2. Au même moment Franky utilise son poing d'acier pour mettre K.O. Nero et rejoint Sanji pour s'attaquer au 4 membres de la CP9.

Après s'être caché sous le manteau de Robin pendant quelques épisodes, Usopp se montre enfin. Ils arrivent dans la salle où se trouve le CP9 et ils y rencontrent Sanji et Franky. Usopp produit un écran de fumée. Les quatre membres du CP9 vont dans un autre wagon, le détachent, et s'échappent. Pas longtemps après, Blueno tire leur wagon en arrière, cependant, Franky renverse le mur afin qu'ils puissent s'échapper, mais finit sur le wagon de l'ennemi. Blueno ouvre une porte dérobée dans le wagon où se trouve L'Équipage du Chapeau de Paille.

Robin suit Blueno à l'intérieur de sa porte improvisée, Sanji et Sogeking se retrouvent seuls. Pendant ce temps, Blueno nous apprend un peu du passé de Robin et du Buster Call. De retour sur le Rocket-Man, Yokozuna grimpe à l'avant du train et le fait dérailler. Kokoro vient le voir et lui explique la situation, Yokozuna se joint au groupe. Le CP9, accompagné de Franky et Robin, arrive à Enies Lobby.

Luffy et ses compagnons sont sur le point d'arriver à Enies Lobby et se préparent à livrer bataille pour récupérer Robin et Franky. Pendant ce temps-là, les agents du CP9 amènent Robin et Franky à Spandam, leur chef.

Luffy, qui n'a pas suivi le plan, débarque seul et en premier à Enies Lobby. Il se dirige vers le bout de la ville mais des centaines de soldats s'oppose à lui. Il sème le chaos dans toute la ville, laissant le champ libre à ses compagnons.

Il faut ouvrir la deuxième porte pour passer. Commence alors un combat entre les deux géants et la Franky Family. Luffy continue d'avancer seul dans la ville tout en massacrant la marine. Robin et Francky sont amenés devant Spandam. Et enfin le Rocketman et l'équipage du chapeau de paille se prépare à entrer sur l'île.

En utilisant la barrière d'Enies Lobby, le train survole la première et la deuxième porte pour atterrir au milieu d'une bataille entre la Francky Family et les soldats. Luffy fait face à des milliers de soldats avec une détermination et une force remarquable mais encerclé il arrive à une impasse.

Arrivé au centre de Enies Lobby, Nami, Zoro, Sanji, Chopper et Sniperking s'avancent pour retrouver Luffy et font face aux soldats du gouvernement. Nami montre son nouveau pourvoir à l'aide de son bâton. Luffy continue de semer la pagaille dans la ville pour retrouver son amie.

Spandam annonce que l’équipage de Luffy sera capturé et tué contrairement à l'accord. Spandam ne souhaite que le pouvoir et pour se venger il battra Robin et Franky. En se rapprochant de Luffy, Zoro, Nami, Sanji et Choper se rendent compte qu'ils ont perdu Sniperking. Luffy réussit à semer les soldats et se trouve devant le dernier bâtiment protégé par Blueno. Le combat va commencer.

Les deux géants qui gardaient une des grandes portes se sont ralliés à Sniperking, car ils font partie de l'équipage de Broggy (rencontré sur l'île de Little Garden). Ils vont donc aider Pauly à la porte principale. Zorro et ses compagnons continuent d'avancer vers le tribunal mais Sodom est mortellement blessé. Sur le toit du tribunal se trouvent Luffy et Blueno qui se battent. Luffy montre une force et une rapidité extraordinaire.

Les quatre membres de Luffy et la Franky Family approchent de la place du tribunal. Gomor assommé, l'équipage va vouloir se défendre malgré les centaines de soldats qui les entourent. Mais le monstre se relève aveugle, et parvint difficilement devant la tribunal. Pendant ce temps, les deux géants et Usopp prennent pars au combat au côté de Pauly. Kalifa et Kaku ont mangé les fruits du démons offert par Spandam ; ils attendent de découvrir leurs nouveaux pouvoirs. Enfin, Luffy mène un combat intense contre Blueno.

Avec l'aide de Zorro, Sanji et Gomorrhe, le reste de l'équipage arrive à la place du tribunal et se sépare pour trouver les leviers permettant d'ouvrir le pont afin d'aller chercher leurs compagnons. Spandam, face à Robin et Franky, prend conscience de la gravité de la situation grâce à l'escargot-phone. Luffy qui a un net avantage doit encore combattre à un niveau plus élevé s'il veut protéger ses amis. Il se prépare donc pour une puissante technique.

Les Chapeaux de Paille viennent d'entrer dans le tribunal, avec les autres membres de la famille Franky. Ces derniers choisissent de rester affronter le juge aux trois têtes Baskerville et de bloquer l'entrée du bâtiment pour empêcher les renforts de rentrer, avec Yokozuna. Au-dessus d'eux, Luffy affronte Blueno en Gear Second, tandis que son équipage cherche à le rejoindre. Sur la route principale, les géants ont vaincu la Meute de la Loi et, avec Usopp et les contremaîtres de Galley-La, se dirigent vers la place du tribunal. Luffy bat Blueno, passe devant son corps inconscient et crie à Robin qu'il est arrivé.

Franky ne comprend pas pourquoi Robin refuse d'être sauvé après que Spandam a rompu sa promesse. Alors que Luffy leur hurle dessus, Franky décide de faire face à Robin. Il utilise son cola restant pour gonfler ses fesses. Avec son pet, il parvient à s'échapper avec Robin tout brisant ses chaînes dans le processus et à être à portée de Luffy. Luffy veut les rejoindre pour sauver Robin, mais elle lui dit de rester car elle veut mourir. Devant le tribunal, Yokozuna succombe aux attaques des Jurés. Les marines sont sur le point de pénétrer dans l'enceinte mais les géants arrivent alors reprendre le contrôle de la situation. Kashi jette Usopp dans les airs, où il rejoint l'équipage des Chapeaux de Paille. De nouveau rassemblés, ils font face à Robin et au CP9, en attendant que le pont-levis soit abaissé.

Il y a 20 ans, Robin a grandi sur l'île d'Ohara. Sa tante, chez qui elle vit depuis le départ de sa mère partie faire des recherches, la traite mal, tout comme les autres enfants qui l'harcèlent à cause de ses pouvoirs. Étudiant dans la plus grande bibliothèque du monde, situé à l'intérieur de l'Arbre de la Cognition, Robin obtient le rang de chercheur en archéologie à l'âge de huit ans. Dans l'espoir d'aider les autres archéologues dans l'étude des Ponéglyphes, recherche interdite par le Gouvernement Mondial, elle apprend même à les déchiffrer. Cependant, sa demande est rejetée car elle est jugée trop jeune pour le faire. Déçue d'être de nouveau rejetée, elle marche le long du rivage, où elle tombe sur Haguar D. Sauro, un vice-amiral géant désertant la Marine. Les deux deviennent rapidement amis et Sauro lui apprend alors à rire.

Sauro est choqué d'apprendre que Robin est la fille de Nico Olvia et qu'il a échoué sur les rives d'Ohara. Sa mère, qui est revenue chez elle avec un navire de la marine volé, se précipite vers l'Arbre de la Cognition pour avertir ses collègues de l'arrivée d'une flotte de la marine. Cependant, elle arrive trop tard. Le navire gouvernemental qui transportait le père de Spandam, Spandine, et ses hommes est déjà arrivé. Ils forcent la population à monter à bord d'un navire d'évacuation, tandis que les soldats du gouvernement arrêtent les savants et fouillent la bibliothèque. Le professeur Clover, le mentor de Robin, exhorte Robin de monter à bord du navire d'évacuation, mais elle refuse. Comme il devient clair que les chercheurs ne seront pas pardonnés pour leurs recherches interdites, Clover demande à être autorisé à parler aux chefs du gouvernement mondial, connus sous le nom de Conseil des Cinq Doyens.

Le professeur Clover est autorisé à parler avec le Conseil des Cinq Doyens. Il décrit une civilisation qui existait il y a des centaines d'années et qui a disparu au moment où le gouvernement mondial a pris le pouvoir. Il laisse entendre que le gouvernement actuel a tenté d'effacer ses anciens ennemis de l'histoire. Considérant qu'Ohara en savait désormais trop, le Conseil des Cinq Doyens ordonne à Spandine de tuer le professeur, les archéologues et de détruire l'île. La bibliothèque s'enflamme et les archéologues tentent de sauver les livres stockés à l'intérieur. Lorsqu'elle croise sa mère, Robin lui révèle qu'elle est devenue une archéologue capable de déchiffrer les Ponéglyphes, marquant ainsi leur retrouvaille mais courte. Autour d'eux, les coups de canon dus au Buster Call se font entendre. Olvia confie alors sa fille à Sauro pour qu'ils s'enfuient de l'île, tandis qu'elle aide ses collègues à sauver le savoir contenu dans la bibliothèque.

Sauro combat les navires de la Marine, afin que Robin puisse s'échapper. Elle tente de monter à bord du navire d'évacuation, mais à cause des ordres de Spandine, l'accès lui est refusé. Le Vice-Amiral Kuzan, l'actuel Amiral Aokiji, entre en scène pour se battre contre Sauro. Pendant leur affrontement, le navire d'évacuation est coulé par le fanatique vice-amiral Sakazuki, l'actuel Amiral Akainu. Sauro, sur le point de mourir, ordonne à Robin de fuir sur son radeau. Contre toute attente, Kuzan aide Robin à s'échapper. Dès lors, Robin passe sa vie à fuir les gens, ne pouvant faire confiance à personne, dans un monde qui croit que sa seule existence est un péché. Dans le présent, Robin admet sa plus grande peur : être vue comme un fardeau par ses coéquipiers et car être avec elle, c'est avoir le monde pour ennemi. Sachant enfin ce qui l'a éloignée, Sniperking, sur l'ordre de Luffy, brûle le drapeau du gouvernement, déclarant ainsi la guerre au gouvernement mondial !

Alors que le pont-levis menant à Robin est sur le point de descendre, Luffy se remémore la rencontre avec Shanks et son équipage, 10 ans plus tôt, dans son village de Fuchsia à Eastblue. Comme Shanks l'avait protégé à l'époque, il veut protéger à son tour ses amis.

Sur le point d'affronter le CP9, Zoro et Usopp se souviennent respectivement pourquoi ils ont décidé de rejoindre Luffy dans sa grande aventure. Le bras droit du futur Seigneur des Pirates a été sauvé par Luffy alors qu'il allait se faire exécuter. Le canonnier de l'équipage du Chapeau de Paille a décidé de suivre Luffy après que ce dernier ait sauvé son village des pirates de Kuro.

Comme ses amis, Nami se rappelle la raison pour laquelle elle est devenue une pirate, malgré les détestait auparavant. Comme elle a été sauvée par ses amis contre les pirates d'Arlong, elle veut se battre à son tour et ainsi sauver son amie Robin.

Sanji et Chopper ne comprennent que trop bien les sentiments actuels de Robin, le cuisinier avec le sacrifice de Zeff et le médecin avec la solitude connue jusqu'à sa rencontre avec le Dr Hiluluk. Ainsi, ils souhaitent encore plus sauver leur amie d'une mort certaine.

Pendant qu'elle attend que ses amis viennent à son secours, Robin pense aux évènements survenus depuis Water Seven, de sa rencontre avec le CP9 et celle avec Spandam. Elle pense également à son histoire tragique à Ohara et du chemin parcouru jusqu'à son choix : vivre et continuer de naviguer avec les Chapeaux de Paille.

Franky avait caché les plans de l'arme antique Pluton dans son corps. Il les montre au CP9, expliquant qu'ils existaient uniquement pour être construits en opposition aux réveils éventuels des armes antiques . Ayant réalisé que Robin, n'était pas le démon décrit, il parie le destin du monde sur la capacité des Chapeaux de Paille à la sauver et brûle les plans. Enragé, Spandam jette Franky hors du balcon. Kokoro fait monter Rocketman sur le pont-levis à moitié abaissé. Les Chapeaux de Paille sautent à bord. Frappant Franky en chemin, le train saute par-dessus la cascade et s'écrase dans à l'intérieur de la Tour de la Justice.

Luffy et son équipage doivent récupérer les clés que possèdent les membres du CP9 pour libérer Robin.

Alors que Luffy décide de se rendre aux portes de la justice pour rattraper Robin et ses ravisseurs, Nami et Sanji ont leurs rencontres respectives avec Kumadori et Kalifa tandis que Franky rencontre Fukurou. Alors que Zoro engage Kaku dans un intense combat à l'épée, la tentative d'Usopp de voler une clé à l'agent CP9 endormi Jabra échoue lorsque l'assassin se réveille et se révèle avoir le pouvoir du Dog Dog Fruit Model: Wolf. Dans le même temps, Kaku révèle à Zoro son nouveau pouvoir de Fruit du Démon : le Modèle de Fruit Ox-Ox : Girafe. Mais après s'être fait tomber avec Zoro sur le sol où se trouvent Usopp et Jabra, Kaku se retrouve ridiculisé pour son apparence. Après qu'Usopp ait accidentellement placé la moitié d'une paire de menottes en pierre de mer sur Zoro, il finit par inciter Kaku à utiliser un Tempest Kick sous sa forme d'homme bête pour couper verticalement le bâtiment en deux. L'attaque se calme et Zoro se retrouve accidentellement menotté à Usopp.

Se retrouvant menottés après que l'homme-bête amélioré de Kaku, Tempest Kick, ait endommagé la Tour de la Loi, Zoro et Usopp apprennent que chacune des clés est numérotée. Mais comme ni Kaku ni Jabura n'ont la clé nécessaire pour libérer leur proie de leurs menottes en pierre de mer, les deux membres du CP9 sont contraints de reprendre le combat. Chopper arrive à ce moment-là et est envoyé pour obtenir la clé numéro 2 de l'un des autres assassins. Chopper rencontre Nami alors qu'elle tentait de fuir Kumadori après avoir volé la clé numéro 3, assommant l'agent du CP9. Peu de temps après, Nami et Chopper trouvent un Sanji rond et brillant frappant le sol de quelques étages.

Nami monte les escaliers pour affronter Kalifa. Seulement, Kumadori les a rattrapés et poursuit Nami. Chopper s'interpose en lui donnant au passage un bon coup de sabot.

Dans cet épisode, nous voyons la nouvelle technique de combat de Zoro et Sogeking, qui, ces derniers, n'ont d'autre choix que d'utiliser cette technique.

Kumadori parvient à sortir du frigo. A la surprise de Chopper, il en ressort gros, comme s'il en avait dévoré tout le contenu.

Avec la défaite de Buggy le Clown et sa bande, le village a retrouvé son calme. Luffy Oyabun profite toujours des plats du restaurant de Onami, qui a toujours si peu de clients.

Aujourd'hui est un jour spécial : un concours de Mochi a lieu. Mais pas n'importe lequel : du haut du palais, le roi lance de nombreux Mochis.

Chopper se transforme en un monstre terrifiant. Kumadori l'attaque, mais ses techniques se montrent totalement inefficaces sur le monstre.

Luffy fait désormais face à Lucci. Pendant ce temps, dans le village de Enies Lobby, la Franky Family et les géants se font capturer par les Marines.

Luffy s'engage dans un duel acharné contre Lucci. À l'approche du Buster Call, les soldats, paniqués, tentent de fuir Enies Lobby.

Nami termine son combat contre Kalifa. Franky tire sur Chopper et l'envoie dans la mer, ensuite, Nami délivre Zoro et Sogeking de leurs chaînes.

Sanji sauve Usopp qui allait se faire tuer par Jabura. Le combat entre Sanji et Jabura commence.

Le combat entre Sanji et Jabura continue. Sanji dévoile sa nouvelle technique.

Spandam arrive sur le pont de l'hésitation avec Robin qu'il n'hésite pas à maltraiter. Elle essaie de s'enfuir à plusieurs reprises.

Zoro attaque Kaku et parvient à prévoir ses mouvements. Kaku utilise son style à quatre épées. Zoro ne parvient pas à bloquer ses attaques.

Le combat continue entre Luffy et Lucci. Spandam se fait surprendre par Sniper King sur le Pont de l'Hésitation.

Franky et Robin essayent de se débarrasser des soldats sur le Pont de l'Hésitation pour atteindre le navire de transport, leur seul espoir de fuite.

Une autre coutume veut que le Royaume de Grand Jipang organise un rassemblement annuel autour du "grand cerisier". Cependant, le lendemain, l'arbre a disparu.

Alors que le combat de Luffy contre Lucci fait rage, les bateaux marins du Buster Call approchent provoquant la panique au sein des troupes de Spandam.

Une partie du passé sombre de Rob Lucci est enfin dévoilé alors que son combat contre Luffy continue.

Luffy mène un combat acharné contre Lucci. Il n'a pas encore retrouvé sa taille initiale après avoir utilisé le Gear Third, mais il arrive finalement à récupérer à temps.

Franky et Robin parviennent à s'emparer du navire des Marines, qui devait emmener Robin prisonnière.

Pendant que Luffy affronte Lucci dans une lutte sans merci, la flotte de la Marine attaque l'équipage de Luffy.

Luffy est à bout de force, il peine à se relever face à Lucci. Dans l'espoir de lui donner un regain d'énergie, Sniperking laisse tomber le masque et révèle sa véritable identité.

Luffy a terrassé Lucci et les autres pirates n'attendent plus que lui pour partir. Mais il n'a plus la force de bouger.

Luffy et son équipage parviennent à filer au nez et à la barbe de la flotte de la Marine.

Luffy, son équipage et Franky parviennent à s'enfuir d'Enies Lobby malgré le Buster Call et Robin remercie ses compagnons. Soudain, le Merry se fissure en deux et Iceburg, venu par bateau leur explique que Merry lui a demandé de le réparer afin qu'il puisse aider les Chapeaux de Paille. Luffy brûle le bateau en le saluant une dernière fois. Juste avant de couler, le Vogue Merry leur dit au revoir en leur demandant pardon, ce qui émut l'équipage.

Alors qu'ils se reposent après l'aventure à Enies Lobby, Luffy et son équipage reçoivent la visite inattendue d'un vice-amiral de la marine.

Garp se trouve être le grand-père de Luffy, et lui révèle que son père n'est autre que Dragon, le mystérieux inconnu qui l'a sauvé de Smoker à Logue Town. Luffy retrouve Kobby et Hermep par la suite.

Kobby explique des choses à Luffy au sujet de Grand Line et de Calm Belt. Ils sont mis sur écoute par Nami qui en profite pour apprendre certains secrets de la Marine.

Shanks se rend sur le bateau de Barbe Blanche et essaye de persuader ce dernier de stopper Ace.

Luffy et Chopper aident une petite fille à retrouver son vieux yagara.

Zoro est forcé par une mère de famille de caractère à faire du baby-sitting.

Chimney fait découvrir un bateau-restaurant à Sanji tenu par un vieil ami de Kokoro qui a été autrefois le maître de Zeff.

L'équipage du Chapeau de Paille prend connaissance des primes que le gouvernement leur a mis. Tous ont désormais une prime et le total dépasse les 600 millions de berries.

Franky propose à Luffy de lui construire un navire. C'est la naissance du Thousand Sunny.

Luffy fait tout pour faire venir Franky et l'emmener avec lui sur le Sunny.

Garp revient à Water 7 pour capturer Luffy. L'équipage part mais Usopp ne se montre toujours pas.

L'équipage s'en va définitivement de Water Seven. Pendant ce temps, les primes arrivent dans les villages nataux de chaque membre de l'équipage.

Ace retrouve Barbe Noire et se bat contre lui. Barbe Noire dévoile son terrible pouvoir, celui du Fruit des Ténèbres, l'un des Fruits Du Démon les plus puissants.