Maintenant que ses jours ne sont plus en danger, Christian essaye de se séparer de son épouse Liz : en effet, son contrat de mariage ne lui permet pas de récupérer tout ses biens après leur divorce. Sean vit mal le départ de Julia, qui vit maintenant avec ses enfants à New York. Voulant refaire sa vie, il épouse Teddy, l'anesthésiste, qui s'avèrera être une tueuse en série. Lors d'une nuit de camping, Teddy essaye de tuer Sean et ses enfants au gaz, afin de toucher son assurance-vie. Mais, cette nuit-là, Teddy trouvera sur son chemin, un autre campeur, encore plus dérangé qu'elle, il la découpera en morceaux.

Kimber fréquente le docteur Mike Hamoui, concurrent, mais aussi partenaire du cabinet McNamara/Troy : la crise étant passée par là, Sean et Christian s'associent avec Mike, qui est un spécialiste de la reconstruction vaginale.

Matt essaye de faire carrière comme mime. Acculé par le besoin d'argent, il décide ensuite de commettre plusieurs braquages, toujours déguisé en mime. Il est finalement arrêté et emprisonné. Derrière les barreaux, il a une vie difficile, mais va sortir en conditionnelle, après que ses deux pères acceptent d'opérer un condamné à mort.

La mère de Julia, Erica, totalement épanouie, a épousé un homme plus jeune, Renaldo et prétend être plus heureuse que jamais. Estimant qu'Annie et Conor, les enfants de Sean et Julia, vivent dans un environnement malsain (Annie s'arrachant même les cheveux pour les manger ensuite), elle en réclame la garde. Elle finira par renoncer, après avoir découvert que Renaldo est pédophile. Julia trouve ensuite une solution pour se débarrasser définitivement de sa mère : elle fait en sorte qu'elle soit arrêtée à l'aéroport avec de la drogue dans son sac.

Sean voit réapparaître dans sa vie son frère, Brendan. Ancien toxicomane, Brendan demande à Sean de lui enlever les cicatrices que la drogue a laissées sur son visage. Christian voit d'un mauvais œil le retour de Brendan et va manigancer pour séparer définitivement les deux frères.

Christian et Kimber se rapprochent à nouveau l'un de l'autre, car ils sont mutuellement attirés par leurs personnalités malsaines. Kimber tombe enceinte de Christian. Refusant d'avoir un enfant, Christian propose à Kimber un marché : soit elle avorte et il l'épouse, soit elle garde l'enfant et devra renoncer au mariage. Kimber décide d'avorter, mais l'intervention se passe mal : elle ne pourra plus jamais avoir d'enfant. Kimber épouse ensuite Christian.

Sean et Christian reçoivent un prix de l'université de Miami pour leur travail, mais Sean s'en moque et aimerait faire de l'humanitaire avec un de leurs anciens camarades, Curtis. Sean surprend le directeur remercier Christian pour sa donation et comprend alors pourquoi deux chirurgiens plasticiens ont reçu ces distinctions. Il s’énerve contre Christian, qu'il accuse d'avoir ruiné sa vie, en l’empêchant d’aller à Harvard et ainsi de mener la vie qu’il souhaitait. Christian n’est pas d’accord et lui dit que c'est lui-même qui a ruiné sa vie. Ne supportant plus toutes les irresponsabilités de Christian, alors qu’il est un homme marié, Sean et Kimber commencent une liaison et continuent de se voir en cachette. Christian finit par lui avouer qu’elle mérite mieux que lui, et décide de finir son mariage. Kimber n’est pas d’accord, mais Christian ne lui laisse pas le choix. Déprimée et voyant qu'elle ne peut vivre avec ou sans Christian, Kimber se suicide.

Les relations entre Sean et Christian atteignent leur point de non-retour quand, à cause de Christian, les deux chirurgiens se retrouvent à nouveau avec un cadavre sur les bras, cadavre dont ils vont devoir se débarrasser. Sean envisage alors un temps de quitter la clinique pour se tourner vers l'action humanitaire et la chirurgie réparatrice aux côtés de Curtis, mais le projet tourne court. Sean se retrouve ainsi contraint de rester travailler aux côtés de Christian, qu'il a de plus en plus de mal à supporter. Sean accepte ensuite de servir de donneur de sperme à Liz, qui n'a pas abandonné l'idée d'avoir un enfant. Toutefois, il va rapidement le regretter, d'autant que Liz veut élever leur enfant seule.

Liz trouvera un instant l'amour, avec une femme, vendeuse de produits médicaux, mais étant gênée, cette femme retournera vers son mari, car elle n'est pas capable d'assumer son homosexualité. De son côté, Matt se trouve une nouvelle copine, Ramona, avec qui il envisage de se marier, mais il la laissera tomber devant l'autel pour aller retrouver son ex, la manipulatrice Ava Moore.

Ava, qui veut a tout prix avoir un enfant, a enlevé un bébé roumain, Raphaël, dans un orphelinat, mais l'enfant a des cicatrices sur le visage ; Christian accepte de soigner l'enfant à condition qu'Ava quitte définitivement Matt. Ava accepte, mais après avoir appris que Raphaël ne pourra pas être débarrassé de ses cicatrices avant longtemps, Ava décide de l'abandonner à Sean. Alors qu'Ava est à l'aéroport, Matt la rejoint à la dernière minute en compagnie de sa fille, la petite Jenna. N'ayant pas d'autre solution pour avoir un enfant, Ava accepte de se mettre en couple avec Matt, pour qu'elle puisse à ses côtés élever Jenna comme sa propre fille.

Julia retourne à Los Angeles. Elle est fiancée avec un homme qu'elle a rencontré en Angleterre et elle veut partir vivre avec ses enfants à Londres, à ses côtés. Sean cédera malgré lui, mais pour lui, Julia compte beaucoup, tout comme Christian, qui n'en reste pas moins hanté par la mort soudaine de Kimber. Finalement, c'est Christian qui choisit de mettre un terme à sa collaboration avec Sean, voyant que celui-ci est malheureux à ses côtés. Sean part en Roumanie avec le petit Raphaël, pour faire une nouvelle vie. Christian travaillera désormais seul avec sa nouvelle associée : Liz Cruz, la clinique étant renommée pour l'occasion Troy/Cruz. Sean et Christian se séparent à l'aéroport et montrent ainsi les deux voies possibles pour vivre dans ce monde : la résignation ou l'illusion de l'espoir.