総武署管轄内では、全裸で逃げる空き巣の被害が続出していた。その頃、事件の捜査とは無関係の時効管理課に勤める霧山（オダギリ ジョー）は、たわいもない会話の中で“どうやら趣味がないとまずいらしい”と気付いてしまう。無趣味の霧山は、時効事件の捜査を趣味にしようと決意。そんな霧山の目に止まったのが、15年前に起こった『西総武市における料理学校理事長殺人事件』だった。

ある日、三日月（麻生久美子）と熊本（岩松了）がラブホテルから出てくる現場を連写した写真を、蜂須賀（緋田康人）が持ってきた。不倫発覚か!?　と盛り上がる時効管理課の面々。そんな中、霧山（オダギリジョー）は、オリンピック代表候補だった水泳選手・藤山一子（塩山みさこ）とコーチ・小原安雄（田中要次）の心中事件に興味を持つ。

三日月（麻生久美子）は時効管理課に花を飾ってみるが、霧山（オダギリ ジョー）をはじめ時効管理課の人間は誰も気付いてくれなくてガッカリ。そんな中、霧山はまた時効事件を捜査し始める。政治家への不正献金問題でマスコミの攻撃を受けていた会社の社員・町田拓二（大西武志）が、駅のホームから転落死した事件である。同じホームで電車待ちしていた藤沢郁也（田中哲司）も不正に関与していた疑いがあり、それに感づいた町田を藤沢が殺したという説も出てきたが、現在は藤沢の妻である道子（緒川たまき）が事故死だと証言。殺人の疑いは消えたまま現在に至った。

霧山（オダギリ ジョー）がグッとくる時効事件を探していると、蜂須賀（緋田康人）が俳句を詠み始めた。２時間ドラマ・シリーズ『THEアネゴ探偵・寂水先生が行く!!』で、アヤメ旅子（永作博美）演じる寂水が事件解決後に崖の上で詠んだ句だ。 実は熊本（岩松了）も常に選りすぐりの寂水シリーズのVHSを携帯し、ある時効事件のために撮影中止となった回に登場した崖のミニチュアまで持っているほどのマニアぶり。その事件とは、当時寂水を演じていた白河湯舟（広田レオナ）が、犯人と揉み合う場面の撮影中に崖から転落死したもので、事故か他殺か謎のまま時効に…。

霧山（オダギリ ジョー）は、時効管理課の面々や十文字（豊原功補）にも多大なる影響を与えた超人気歌手・本郷高志（乃木涼介）の変死事件を調べることに。男の生き様をアツく歌い続けて人々を魅了した本郷は、15年前に王様ゲームでキスした直後、「オッス」と言い残し、謎の死を遂げた。体内から毒物も見付からず、キスの相手・夏川リナ（飯沢もも）は容疑者から外され、その代わり妻で医学的知識も豊富な女医・雪絵（奥菜恵）が最も重要な容疑者として浮上。当時、本郷は数々の浮気現場をスクープされていたからだ。

昭和43年の三億円事件に酷似した手口で行われた“平成三億円事件”。十文字（豊原功補）が刑事課で初めて担当したこの事件が時効となった日、総武署に不審な女・秋津聡子（ 葉月里緒奈）から電話が…。「事件について話したいことがある」という。応対した霧山（オダギリ ジョー）は聡子と指定場所で会うことに。彼女は自分が犯人だと言い張り、警察の手ぬるい捜査を告発する手記執筆のために、遺留品が必要だという。

霧山（オダギリ ジョー）は、女子高生・立花律子（真木よう子）がセーラー服のスカーフで絞殺された時効事件を調べることに。律子は朝日ヶ丘大学合格発表の日の夜、当時痴漢被害が続発していた森へ自ら赴き、そこで殺されたらしい。霧山は三日月（麻生久美子）と共に、朝日ヶ丘大学卒業後に同大学数理学部の助教授をしている律子の親友・関ヶ原弥生（櫻井淳子）を訪ね、話を聞くことに。

時効管理課の温泉旅行の幹事になった霧山（オダギリ ジョー）は、行き先を考えている最中、新しい時効事件を発見。日本のモーツァルト的存在だった天才作曲家・雨田潮（ROLLY）が殺された本件の捜査は、被害者の残した「サリエリ」というメッセージにかく乱され、時効を迎えていた。現場は秘境の塩砦温泉。自腹で時効捜査を続けたため金欠気味の霧山は「最後の捜査になるかもしれない」と覚悟し、定期預金を解約。費用を捻出し、事件の起こった町の派出所へ。警官・林田（笹野高史）の話では、雨田は現在作曲家として活躍する冴島翠（りょう）と、風俗で働いていたアンズ（つぐみ）と三角関係にあったという。