לאחר אסון גרעיני שנגרם על ידי כמה פיגועים שמחסלים את רוב צפון אמריקה, תושבי עיירה קטנה בקנזס צריך להשלים עם מציאות שונה מאוד.

ג'ייק מנסה למצוא מסתור לתושבי העיירה מפני הנשורת הגרעינית שתפגע בקרוב בעיר.

לאחר שראה שידור לוויין מאסיה, ג'ייק מקבץ קבוצת אנשים כדי לאסוף מידע וג'ייק מציע להוציא ארבע משלחות חיפוש לארבעה כיוונים שונים כדי להבין מה קורה מחוץ ליריחו.

ג'ייק מתלבט אם לעזור לאדם שנפגע מקרינה גרעינית. הדלק לגנרטור של ביה"ח אוזל וכך גם המצרכים בעיירה.

תושבי העיירה שומעים שכוחות ההצלה הממשלתיים בדרך. סדרת שריפות פורצת בעיר. ג`ייק והוקינס מתוודעים זה לזה.

הודעה ממשלתית וצפייה בשיגור טילים גרעיניים, מבהירים לתושבים שהם ברשות עצמם. אליסון תוהה מדוע אביה עבר לגור ביריחו.

גריי אנדרסון, אחד מהפרשים שיצאו לסייר, חוזר לעיר ועמו מידע על המתחולל מסביב ליריחו, ותכניות להגן על התושבים.

ג'ייק ואריק יוצאים מהעיירה כדי להשיג תרופות שיצילו את חייו של ראש העיר, ומגלים שהעולם סביבם השתנה לחלוטין.

התושבים נוקטים בצעדים לשמירת ביטחונם, אך הדבר גורם לחיכוכים. יום חתונתה של אמילי מגיע ועימו הדיכאון.

מטוסים מצניחים אספקה לעיר. ראש העיר מנסה לשכנע את התושבים לבדוק את המוצרים, בעוד יונה מנסה לנכס חלק מהם לעצמו.

כמה מתושבי יריחו מודאגים שמא פעולותיו של גריי עשויות להפוך את גריי לראש העיר החדש. במקביל, מיטשל, לאחר ספקולציות רבות, טוען כי ג'ונה הוא הרוצח.

חייהם של ג'ייק והוקינס נבדקים במהלך פרק פלאשבק זה. הפרק מתחיל 36 שעות לפני הפעלת הפצצות. שרה פוגשת את הוקינס ומצטרפת אליו וג'ייק עוד גר בסן-דייגו.

הת'ר משכנעת את ג'ייק וג'ונסטון ללוות אותה אל מחוץ לעיר, כדי להשיג כלים לתיקון טחנת הרוח, ודייל מצטרף אליהם כדי להשיג מוצרים נוספים. הוקינס מחזיר את שרה הביתה ומנסה להבין מי עוקב אחריו.

בעת טיול ציד מחוץ ליריחו, ג'ייק, סטנלי ומימי מוצאים את עצמם במצב מסוכן כאשר הם נתקלים בכמה זרים. הוקינס מבין שמשפחתו נמצאת בסכנה בגללו. אמילי ורוג'ר עובדים על היחסים שלהם.

חיילים מגיעים לעיירה ומעודדים את התושבים, אך ג'ייק וג'ונסטון מפריעים לשמחה. הוקינס מגלה שייתכן ושרה אינה מי שהוא חושב שהיא.

לאחר שאפריל מתמוטטת וכורעת ללדת, ג'ייק מאלץ את קנצ'י להתמודד עם הבעיות שלו, כדי שיוכלו להציל אותה. טורבינת הרוח מגיעה מניו-ברן, אבל הת'ר לא חוזרת.

רוג'ר מתייאש לאחר שגריי מסלק את הפליטים מיריחו. דייל וסקיילר גובים כמה חובות. הוקינס ממשיך במסעו כדי למצוא את אנשי הקשר של שרה. בינתיים, הוקינס מתחיל לברר מי רודף אחריו.

ג'ייק, החושד שהוקינס טרוריסט, חוקר אותו על כך באיומי אקדח. גייל וג'ונסטון מנסים להתמודד עם מותה של אפריל.

ג'ייק והוקינס יוצאים לחפש את אריק, ועולים על סוד מסוכן. עימות בין סקיילר לגריי, מאיים לעורר מלחמה ביריחו.

תושבי יריחו וניו-ברן נלחמים על המשאבים היקרים, וגריי נאלץ לקבל החלטה קשה לאחר הפצצת רחובות יריחו.

הקרב עם ניו-ברן פורץ. תושבי יריחו בנחיתות מספרית, אך מסרבים להיות מובסים. ידה של יריחו על העליונה, אך זו סובלת מאבידות משמעותיות. חבר של ג'ייק שולח עזרה ממקור בלתי צפוי.