Un piccolo aereo si schianta nell'appartamento di Ryo e Kaori, distruggendolo, ma miracolosamente la pilota, una giovane ragazza di nome Shoko Amano, ne esce illesa. Ryo scopre che in realtà l'aereo era stato manomesso poiché utilizzato, ad insaputa di Shoko, per trasportare droga che veniva nascosta nell'imbottitura dei sedili, decidendo quindi di aiutare la ragazza che evidentemente qualcuno vuole morta.

L'agente Kuwata sta per essere trasferito all'Interpol a Parigi, ma prima di partire vuole arrestare City Hunter, convinto che sia solo un assassino che si spaccia per giustiziere. Tramite le sue azioni, Ryo dovrà convincerlo di non essere affatto un criminale e che le sue intenzioni sono sincere.

Ryo viene assunto come guardia del corpo di Yuki, una stuntwoman che non ricorda nulla del suo passato e che ogni tanto cade inspiegabilmente in trance adottando comportamenti suicidari. La ragazza è in realtà la principessa scomparsa dell'immaginario regno di Alinamia che a breve sarebbe dovuta salire al trono, ma qualcuno vuole eliminarla.

Mentre passeggia, Ryo viene accusato ingiustamente di aver rubato biancheria intima femminile ed è costretto a scappare, quando viene fatto salire su una Nissan Skyline rossa alla cui guida c'è Miyuki, una bellissima ragazza che di professione aiuta i malviventi a fuggire su compenso e con la fissa per il denaro. Dopo la fuga, Ryo si rende conto che la giovane è continuamente vittima di attentati e si offre di proteggerla.

Lo spirito di una ragazza di nome Ami Asaka ingaggia Ryo chiedendogli di catturare l'uomo che l'ha uccisa nonché di vigilare sulla sorella gemella Mami, studentessa di pianoforte. Inizialmente Ryo si rifiuta di credere di essere stato assunto da un fantasma, ma presto dovrà ricredersi: Ami, infatti, si impossessa del corpo della sorella ogni volta che intende comunicare con lui. Ryo accetta perciò l'incarico spacciandosi per il fidanzato di Ami.

Al conservatorio, l'uomo si rifà vivo per uccidere anche Mami, ma Ryo la salva sistemando lo psicopatico una volta per tutte. Ami vorrebbe però ascoltare l'audizione della sorella un'ultima volta prima di partire definitivamente per l'aldilà. Kaori decide di prestarle il suo corpo, cosicché le due gemelle possano dirsi addio.

Sonia Field, bellissima ragazza americana, vuole ingaggiare Falcon (Umibozu) per eliminare Ryo e vendicare così la morte del padre Kenny. Quest'ultimo, infatti, era stato ucciso anni prima proprio da Saeba nonostante fosse il suo socio, quando ancora lavorava in America. Umibozu accetta l'incarico, proponendo di sfidarlo in un duello all'ultimo sangue e per questo motivo decide di rompere con Miki.

Il duello si svolge al cimitero dov'è seppellito il fratello di Kaori, il detective Hideyuki Makimura. Miki rivela a Sonia che suo padre fu costretto a battersi con Ryo in quanto minacciato da una potente organizzazione criminale che altrimenti gli avrebbe ucciso la figlia. Sonia, sebbene scossa, viene convinta e si precipita da Falcon per farli smettere, ma l'uomo decide ugualmente di proseguire lo scontro. Fortunatamente il duello si conclude in parità: Ryo e Umibozu sono entrambi feriti, ma ancora vivi.

Kaori incontra Eriko, ex compagna di liceo ora proprietaria di una boutique. La ragazza intuisce che la giovane investigatrice nutre dei sentimenti per il collega Ryo e con un furbo stratagemma le combina un appuntamento truccandola in modo tale da non essere riconosciuta da lui. I due trascorrono una serata romantica che termina a mezzanotte, proprio come nella fiaba di Cenerentola. Ciononostante, alla fine Ryo capisce che quella ragazza camuffata era proprio la sua assistente.

Dopo sei anni Saeko si ritrova a lavorare nuovamente con il detective Asakura, con cui in passato aveva avuto una relazione nonostante fosse molto più giovane di lui. L'uomo è infatti sulle tracce di Rin Ho Shen, un boss della mafia di Hong Kong rifugiatosi in Giappone, che pochi anni prima gli aveva ammazzato moglie e figlia. Preoccupata per il collega, Saeko chiede quindi a Ryo di vigilare su Asakura.

Kaori e Ryo apprendono dalla tv che la regina del fittizio regno di Meraldo, Rika Shiraishi, ha appena divorziato. Nelle immagini, l'ormai ex sovrana indossa una collana a loro familiare, innescando in Ryo un flashback: egli infatti aveva conosciuto Rika alcuni anni prima, la quale lo aveva convinto a rubare il collier in cambio di sesso (in questo episodio Ryo fa la conoscenza del detective Makimura, fratello di Kaori, e di Saeko).

Mentre fa visita alla tomba del fratello, Kaori s'imbatte in Hans, un ragazzo austriaco venuto in Giappone per visitare il Paese d'origine della madre, morta quando era molto piccolo. La giovane lo ospita a casa sua, ma Ryo lo riconosce subito, dato che si tratta in realtà di un killer molto pericoloso. Hans ha infatti assassinato il boss di un'organizzazione criminale che non voleva renderlo libero e per questo ora è ricercato dai suoi membri.