在2010年12月，剧中声优小山力也在自己的博客中用烧饼透露出将制作第2期的消息，而在《周刊少年Champion》2011年13号（2月24日发售）上，则正式发表了《侵略！乌贼娘》TV动画第2期的制作决定，2011年5月24日公布第2期的标题为《侵略！？乌贼娘》，电视动画于2011年9月26日，全12集。

TVアニメの第2シリーズ。海洋汚染を続けてきた人類を侵略するために深海から地上にやってきたイカ娘。しかし、最初の侵略拠点として目をつけた海の家“れもん”すら制圧下におけず、挙句にそこで働かされるはめに。だがそこで栄子や千鶴、たけるの相沢一家と一緒に暮らすようになり、いろんな人とのほのぼのした交流もある楽しい毎日。イカ娘大好きっ娘の長月早苗、イカ娘が怖くてしょうがない斉藤渚、ライフセーバーでイカ娘とは「海を守る同志」の嵐山悟郎、イカ娘を宇宙人として研究したがっているシンディー、そして親友となった清美などなど彼女をとりまく面々もとっても賑やか。…果たしてイカ娘が地上侵略を達成する日はくるのだろうか…？