Charleston külvárosában, csak néhány lépésre a feltételezett biztonságtól, a Mason Klánt és a 2. ezred többi részét egy új espheni háborús gép támadja meg. A támadás minden irányba szétszórja a Charlestont védőket, ezért új szövetségeket kell létrehozniuk és új túlélési stratégiát kell megtanulniuk.

Az espheniek elárulják tervüket Tomnak; Weaver és Pope megpróbálnak kiutat találni az espheni börtönből.

A 2. Ezred nagyszabású tervet dolgoz ki az esfeni gettó elhagyására. Ezalatt Maggie összetűzésbe kerül Lexivel Chinatownban. Matt megpróbálja meggyőzni Mirát, hogy együtt szökjenek meg. Anne álmában újraéli az esfeni fogságot.

Miután kitört az espheni gettóból, Tom és a 2. ezred egy Volm-rejtekhelyen keres menedéket, ahol nagy a feszültség a Volm és az emberek között. Tom elindul Weaverrel és Cochise-szel, hogy megtalálja Mattet, Hal-t hagyva a hátra. Közben Chinatownban Anne újra találkozik Lexivel, és rájön, hogy a kislány, akit 6 hónappal ezelőtt látott, már felnőtt nő.

Miután kiszabadította Mattet az espheni ifjúsági táborból, Tom két titokzatos idegennel találkozik az erdőben, akik megtámadják családját.

Tom visszatér a családjához és a 2. ezredhez. De ennek csak rövid ideig örülhet, mivel Lexi hibrid DNS-e miatt egészségügyi problémái vannak. Betegsége viszályt okoz a családon belül, mivel a családtagok nem értenek egyet abban, hogyan kezeljék.

Miután Lexi legyőzte betegségét, erősebb és könyörtelenebb, mint valaha. Tom és a 2. ezred a Volmmal dolgozik, hogy megakadályozzák az espheniket, hogy a betörjenek, ami nagy csatával végződik.

A 2. ezred a menedékhelyről jön elő a pusztító espheni támadás után, amely ismét megosztotta őket: a törmelék alatt talált Maggie az életért küzd, ezért Hal idegen technológiát javasol megmentésére. Eközben Dingaan és Tom egy teljesen összeomlott épület alatt rekedt, míg Ben Lexi foglya.

Az Esphpheni elleni új terv megvalósítása érdekében Cochise Tomot, Anne-t, Weaver-t és Matt-et egy rejtekhelyre vezeti olyan felszerelésekkel, amelyek segíthetnek nekik.

Tom és a 2. ezred maradványai az espheni áramforrás megsemmisítését tervezik a megtalált gép segítségével. Ezalatt Lexi fejleszti erejét, és lázadást tervez espheni apja ellen.

Lányuk visszatérése megnehezíti Ben és Tom küldetését, hogy elpusztítsa az ellenség energiamagját. Hogy bizonyítsa családja és emberei iránti hűségét, Lexi úgy dönt, hogy testvére helyét átveszi és az apjával távozik.

Felébredve, Lexi és Tom rájönnek, hogy a bomba teljesen működésképtelenné vált, és nincs módjuk legyőzni az esphenieket...