Sono passati 7 mesi dall'incontro tra la 2ª Mass e la nuova specie aliena, i Volm. Tom è stato eletto Presidente dei nuovi Stati Uniti di Charleston, mentre la resistenza umana, appoggiata da Volm e skitters ribelli prende una nuova piega con un susseguirsi di vittorie nei confronti dell'occupazione aliena ostile.

La 2ª Mass chiede aiuto al Dott. Roger Kadar per distruggere senza conseguenze un vicino impianto nucleare utilizzato dagli Skitter come fonte di carburante.

Un gruppo di uomini armati, di cui fa parte il tenente Fisher attacca Charleston. Si scoprirà alla fine del conflitto che operano a nome di Benjamin Hathaway.

Assistendo ad un attacco Skitter respinto dalla 2ª Mass con l'aiuto dei Volm e della loro Tecnologia, il tenente Fisher proporrà a Tom un incontro con il presidente Hathaway. Incontro accettato dal professore che si svolgerà a "Keystone" ed a cui si uniranno oltre a Tom: Pope, la stessa Fisher, Bressler e l'alleato Volm Cochise. Nel Mentre Annie continua ad avere sospetti nei confronti della natura della figlia Alexis.

L'aereo precipitato in una foresta è a pezzi ed il General Bressler senza vita. Tom risvegliatosi in mezzo alle lamiere riesce a salvare la vita di un Pope senza conoscenza, trascinandolo all'esterno prima che l'aereo esploda. Nel mentre a Charleston si discute sulla scomparsa di Anne ed Alexis cercandone un movente.

Durante il loro viaggio alla ricerca di Anne ed Alexis, Tom, Ben, Hal e Matt si imbatteranno in una famiglia locale che li deruberà di provviste e cavalli. I Mason riescono a ritrovarli, recuperare i loro averi e ripartire.

Tom si risveglia nella sua abitazione con la moglie Rebecca vicino, come se gli ultimi anni non fossero altro che un incubo, ma più si addentra in questa nuova realtà più questa prende i contorni di un sogno.

Tom torna a Charleston e propone di attaccare la torre di Boston, così da eliminare anche Karen. Sospettando che possa essere controllato, Porter e Weaver sono restii ad assecondarlo.

Il colonnello Weaver con Pope ed altri si dirige su un treno verso Chicago, portando con sé Lourdes. In realtà si tratta di un'esca per far credere agli Espheni di volere attaccare quella torre, quando invece Tom e tutti gli altri stanno già attaccando la torre di Boston con l'arma Volm.