Sezon, yeni bir Alfa Sürüsü’nün Scott’ın hayatını altüst etmek üzere sahneye girmesiyle başlar. Bu arada Derek ve Isaac, umutsuzca Erica ve Boyd’u bulmaya çalışırlar.

Boyd ve Cora, dolunayın etkisi altında serbest kalınca, Scott ve Derek umulmadık birinden yardım isterler.

Scott tehlikeli bir karşılaşmayı engellemeye çalışırken, Stiles ölümlerin kurt adamlarla ilgisi olmadığını gösteren teorisini ispatlamaya girişir.

Scott ve arkadaşları spor turnuvasına gitmek için otobüsle seyahat ederlerken, Alfalara karşı yapılan önleyici saldırıyı hatırlarlar.

Bir otelde mahsur kalan Scott ve arkadaşları yaşadıkları bazı tuhaf deneyimler sonucu, gruptakilerin, katilin hedef aldığı kişiler olduğunu düşünürler.

Scott’a yaklaşmakta olan tehlike, güvendiği patronu ve akıl hocasını tehdit ederken Deaton, Kali ve ikizler, Derek’in peşine düşerler.

Beklenmedik birilerinden hikâyeler dinleyen Scott, Allison ve Stiles, bir kurt adamın göz rengiyle ilgili bir sır keşfederler.

Allison, ona yakın birinin cinayetlerle ilgisi olduğundan şüphe eder. Scott ve Stiles ise, cinayetleri çözecek anahtarın Lydia olabileceğini düşünürler.

Fırtına sırasında boşaltılan bir hastanede mahsur kalan Scott ve Derek, Cora’yı kurtarmanın bir yolunu bulmalı ve kendilerini Alfalara karşı savunmalılardır.

Scott, arkadaşlarını ve ailesini kurtarmak için zor bir seçim yapmalıdır. Derek ve Peter ise Cora’nın hayatını kurtarmaya çalışırlar.

Scott ve arkadaşları, sevdiklerinin hayatını kurtarmak ve Deucalion’un şeytani planını durdurmak için tehlikeli bir ritüel düzenlerler.

Scott, Stiles ve Allison, kurban ritüelinden sonra tuhaf yan etkiler yaşarlar. Bu arada, Stilinski eski davaları deşmeye başlar.

Beklenmedik biri, Derek ve Peter’ın yardımına koşar. Scott ve yandaşlarıysa, Çakal Adam’ı yakalamak için hızla harekete geçerler.

Bir cinayet suçlusu, cadılar bayramı arifesinde gözaltından kaçınca, Scott ve arkadaşları duruma el atmak zorunda kalırlar.

Beacon Hills karanlığa gömüldüğü için, gençler UV ışıklı bir parti düzenlerler. Scott, bir saldırının ortasında Kira’nın güvenini kazanmaya çalışır.

Scott’ın arkadaşları onu şeytani ninjalardan korumaya çalışırken Stiles, sorunlarını çözmek için Melissa’dan yardım ister.

Stiles gecenin karanlığında kaybolunca Scott ve arkadaşları onu aramaya başlarlar. Lydia, yeni yeteneklerini nasıl kullanacağını öğrenmeye çalışır.

Her yerde bir sabotaj işareti gören Scott ve arkadaşları, bu felaketten kaçınmanın yollarını ararlar.

Scott, arkadaşlarıyla önemli bir Japon eseri ararken, Stiles bir akıl hastanesinde zor bir kararla mücadele eder.

Kira’nın annesinin, II. Dünya Savaşı’ndaki Japon-Amerikan esir kampıyla ilgili anlattıkları, düşmanı nasıl yenebilecekleri konusunda önemli bir ipucu verir.

Scott ve Lydia, üstünlük sağlamak için son bir çabayla birlik olurlar. Stilinski ise inceleme kuruluyla yüzleşmelidir.

Kira, beklenmedik bir düşmanla karşılaşırken, Scott ve arkadaşları giderek güçlenen bir rakip karşısında hayatta kalmaya çalışırlar.

Felakete uğrayan ve yenilmek üzere olan Scott ve Derek, son bir savaş vermek için müttefiklerini çağırırlar.