Scott McCall, un adolescente un po' goffo, subisce l'aggressione di una misteriosa creatura dopo essere andato nei boschi insieme al suo amico Stiles. Il giorno dopo Scott scopre che i suoi sensi sono ipersviluppati e la sua forza fisica è diventata sovraumana. Stiles effettua delle ricerche e capisce che il suo migliore amico è diventato un licantropo.

Scott cerca di abituarsi ai suoi nuovi poteri e si chiede se sia il caso di giocare nel prossimo incontro di lacrosse. Derek dà appuntamento a Scott per insegnargli a trovare la sua "ancora" prima della luna piena, ma in realtà è Stiles a trovare il modo per aiutarlo. Intanto Scott continua a corteggiare Allison, la nuova ragazza arrivata in città.

Scott pensa di aver aggredito un uomo del posto mentre era trasformato in lupo, Derek spiega che si tratta dell'Alpha che lo ha morso e che uccidere insieme a lui è un rito di passaggio per ottenere l'obbedienza di Scott, il licantropo Beta del branco in questo caso.

Un nuovo cacciatore arriva in città per dare la caccia a Derek che viene colpito da un proiettile speciale, intinto di un estratto di una pianta tossica ai licantropi. L'unica salvezza per Derek è avere un altro proiettile simile in modo da avere un antidoto. Mentre Scott cerca il proiettile in casa Argent, Stiles si occupa di Derek che è pronto ad arrivare a risorse estreme pur di salvarsi.

Jackson e Lydia s'imbattono nell'Alpha che distrugge una videoteca e Lydia rimane traumatizzata dall'evento. Kate si reca nelle rovine della vecchia villa degli Hale convinta che Derek sappia chi è l'Alpha.

Scott cerca di controllare le sue trasformazioni mentre Derek tenta di allacciare un legame di amicizia con lui.

Scott, Stiles, Allison, Jackson e Lydia sono intrappolati nel liceo mentre l'Alpha gli sta dando la caccia. Scott si propone volontario per cercare un modo di risolvere la situazione mentre Lydia prepara delle bombe molotov da usare in caso di ultima difesa. Convinto che l'Alpha abbia ucciso Derek, Scott lo accusa di aver assassinato il bidello e Derek è costretto a nascondersi dalla polizia.

Scott e Allison sono entrambi depressi per la fine della loro storia ma cercano di mantenersi in contatto di nascosto. Scott viene eletto co-capitano insieme a Jackson che reagisce in malo modo. Scott si comporta in modo bizzarro perchè la luna piena si sta avvicinando e mette a repentaglio la sua amicizia con Stiles dopo aver baciato Lydia. Derek aiuta Scott a combattere il richiamo dell'Alpha. Kate comincia a sospettare che Stiles sia il secondo Beta.

Jackson sta cercando uno specialista per la ferita che ha ricevuto dagli artiglii di Derek. S scopre che Laura aveva come indizio il disegno di un pendente che Scott riconoscere essere lo stesso di Allison. Jackson finalmente scopre la verità su Scott e lo ricatta dicendo di voler il "morso" in modo da diventare come lui. Derek si nasconde a casa di Stiles perchè è ancora ricercato dalla polizia e Stiles chiede aiuto a Danny per rintracciare il cellulare dell'Alpha.

Scott cerca di proteggere i suoi amici dall'Alpha e Jackson dagli Argent. Stiles scopre che le persone uccise dall'Alpha sono tutte collegate all'incendio in cui Derek ha perso la sua famiglia. Scott riceve una visita dall'Alpha, Peter, e da Derek, che adesso è al suo fianco.

Derek è nelle mani di Kate che si diverte a torturarlo. Kate fà il lavaggio del cervello ad Allison. Peter morde Lydia e costringe Stiles ad aiutarlo a rintracciare Derek.