เมื่อด็อกอ็อคร่วมมือกับอาร์นิม โซล่าและไฮดร้าเข้าโจมตีไตรแคร์ริเออร์ หน่วยชีลด์ไม่ทันได้ตั้งตัวและเป็นสไปเดอร์-แมนที่ต้องรับมือกับการโจมตีด้วยตัวคนเดียว

สไปเดอร์-แมนเสียหน่วยชีลด์และเพื่อนๆ ของเขาให้ด็อกอ็อคและไฮดร้า ทำให้เขาต้องตั้งทีมขึ้นมาใหม่เพื่อหยุดเหล่าร้ายจากการยึดครองนิวยอร์ก

สไปเดอร์-แมนพาไมลส์ โมราเลสมายังโลกของเราเพื่อช่วยหยุดก็อบลิน

สไปเดอร์-แมนต้องหยุดด็อกอ็อคไม่ให้กำจัดนอร์แมน ออสบอร์น

วัลเจอร์เปิดเผยว่าด็อกอ็อคมีสายลับในโรงเรียนหน่วยชีลด์ เหล่านักรบใยแมงมุมจึงต้องตามล่าหาตัวหนอนบ่อนไส้

สไปเดอร์-แมนและสการ์เล็ตสไปเดอร์ต้องเอาชนะเครเว่นเพื่อช่วยเอเจนต์เวน่อม เพื่อนร่วมทีมของพวกเขาที่โดนจับตัวไป

ด็อกอ็อคและมอร์เบียสผู้ช่วยคนใหม่ของเขาได้สร้างแอนไท-เวน่อมขึ้นมาเพื่อทำลายนักรบใยแมงมุมคนหนึ่ง

สไปเดอร์-แมนได้รับสัญญาณปริศนาจากฐานทัพไม่ทราบชื่อ เขาจึงตามรอยไปจนถึงอาคารร้างแห่งหนึ่งโดยหวังว่าจะได้พบกับนิค ฟิวรี่

สไปเดอร์-แมนเผชิญหน้ากับแผนการชั่วร้ายขั้นสูงสุดของด็อกอ็อคเมื่อซินนิสเตอร์ ซิกซ์รุ่นใหม่เข้าโจมตีนักรบใยแมงมุมและโรงเรียนหน่วยชีลด์ที่ทริสเกเลียน

เมื่ออ็อกได้รู้ว่ากุญแจที่ใช้ไขอุปกรณ์ซึ่งจะกู้เกาะไฮดร้าคืนมาอยู่ที่บ้านป้าเมย์ สไปเดอร์-แมนจึงต้องต่อสู้เพื่อปกป้องครอบครัว

เมื่อโนว่าที่ได้รับบาดเจ็บมาขอความช่วยเหลือจากสไปเดอร์-แมนเพื่อตามหาตัวนิค ฟิวรี่ เขาจึงแกะรอยไปจนถึงซากปรักหักพังสุดอันตรายในเมืองโบราณ

สไปเดอร์-แมนและเอเจนต์เวน่อมค้นพบแผนของไฮดร้าและมอร์เบียสที่จะสร้างระเบิดเวน่อมตัวใหม่ที่พัฒนาขึ้นกว่าเดิมในชื่อระเบิดคาร์เนจ

ระเบิดคาร์เนจถูกจุดชนวนและทำให้ประชาชนกลายร่างเป็นคาร์เนจ สไปเดอร์-แมน กัปตันอเมริกา และโรงเรียนหน่วยชีลด์ต้องร่วมมือกันเพื่อช่วยนิวยอร์ก

สไปเดอร์-แมนและผองเพื่อนฮีโร่ต้องปราบมอร์เบียสที่มีแผนจะทำให้คาร์เนจควีนกลายเป็นอาวุธไม้ตายของไฮดร้าและอาร์นิม โซล่า

สไปเดอร์-แมนและคิด อารัคนิดเดินทางไปมิติคู่ขนานเพื่อรวบรวมเศษกระจกเริ่มต้นใหม่ที่พังไป

สไปเดอร์-แมนและไมลส์ที่กำลังตามหาเศษกระจกเริ่มต้นใหม่ได้เดินทางไปยังมิติโจรสลัดเขตร้อน ทั้งคู่ได้พบกับสไปเดอร์โจรสลัดชื่อเว็บเบียร์ด

สไปเดอร์-แมนและคิด อารัคนิดเดินทางไปถึงจักรวาลนัวร์ พวกเขาต้องหยุดยั้งมิสเตอร์เนกาทีฟที่จะใช้กระจกเริ่มต้นใหม่เพื่อดูดชีวิตและสีสันออกจากโลกจนหมด

สไปเดอร์-แมนเก็บรวบรวมเศษกระจกเริ่มต้นใหม่ได้ครบแล้วและได้กลับไปยังจักรวาลของไมลส์ โมราเลสและปะทะกับวูล์ฟสไปเดอร์

เมื่อคนที่ออกมาฉลองเทศกาลฮาโลวีนถูกเปลี่ยนให้กลายเป็นปีศาจ สไปเดอร์-แมน ดร.สเตรนจ์ และแอนท์-แมนต้องร่วมมือกันหยุดยั้งบารอนมอร์โด

สไปเดอร์-แมนต้องร่วมมือกับสการ์เล็ตสไปเดอร์ผู้ทรยศ เพื่อหยุดยั้งไม่ให้ด็อกอ็อคเปิดใช้งานโปรแกรมลับที่ถูกออกแบบมาเพื่อสร้างสไปเดอร์-แมนร่างชั่วร้าย

สไปเดอร์-แมนและสการ์เล็ตสไปเดอร์ต้องแทรกซึมเข้าไปในเกาะไฮดร้าที่จมอยู่ใต้น้ำเพื่อให้สการ์เล็ตเข้าไปทำลายห้องแล็บที่สร้างเขาขึ้นมา

สไปเดอร์-แมนปิดตายทริสเกเลียนเมื่อวายร้ายปริศนาเริ่มจัดการเก็บฮีโร่ทีละคน

สไปเดอร์-แมนกำลังเฝ้าบ้านในคืนคริสต์มาสอีฟ แต่กลับต้องจับมือกับมูนไนท์เพื่อปกป้องบ้านจากมิสเทอริโอคนใหม่

ดร.อ็อคโตปุสขู่จะทำร้ายป้าเมย์ถ้าสไปดี้หยิบหน้ากากขึ้นมาสวมอีกครั้ง สไปเดอร์-แมนต้องตามล่าอ็อกก่อนที่เขาจะมีโอกาสดำเนินการตามแผน

ปีเตอร์ พาร์คเกอร์ต้องหาทางหยุดยั้งดร.อ็อคโตปุสและซูพีเรียร์ซินนิสเตอร์ ซิกซ์ที่กำลังจะทำลายล้างฮีโร่ทุกคนในนิวยอร์กและยึดครองโลก