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コメットブラスターの千鶴とアネットが下地島基地に現れた。ふたりは、第7オービタルステーションの司令であった美春のビデオ日記を持参する。そこに記録されていた内容にショックを受ける一同。その頃、軌道上の第7オービタルステーションでは異変が起きつつあった……!?

スペースデブリの直撃を受け、大気圏へと落下を始めた第7オービタルステーション。中には取り残された作業員がいたが、急遽、千鶴とアネットが救出に向かい作業員は無事脱出。美風・香鈴・彩雲・静羽の4人は、地球に向けて落下するオービタルステーションを空中で破壊するため、TSR.2MSで発進するが……。

Stratos 4 Recap episode - For everything which happened before Stratos 4 Advance started.

3個の巨大彗星が同時に地球を襲うことが判明。太陽風を背にして来るため進路予測が困難で、質量はいずれもナイジェル87クラスだった。その上、通常の作戦では地表の2/3に破片が降り注ぐことに。千鶴たちコメットブラスターは、美風たちメテオスイーパーに最後の望みを託しつつ、危険な作戦に挑戦する。