Twee weken na het dichter bij elkaar brengen van de geestenwereld en de gewone wereld, wordt de stad bedolven onder wildgroeiende takken en wortels. President Raiko stuurt Korra de stad uit nadat ze geprobeerd heeft het probleem op te lossen. Ze houden haar verantwoordelijk. Overal in de wereld duiken opeens mensen op die kunnen Luchtsturen. Nu Korra toch weg wordt gestuurd, gaat ze met haar vrienden zoeken naar deze nieuwe Luchtstuurders om de Luchttempels opnieuw op te bouwen. Ondertussen ontsnapt Zaheer, een levensgevaarlijke crimineel, uit zijn gevangenis dankzij zijn nieuw verkregen Luchtstuurmogelijkheden.

Al reizend door het Aarderijk met Team Avatar en Jinora aan zijn zij, beseft Tenzin dat de nieuwe Luchtstuurders niet bereid zijn hun oude levens op te geven. Behalve een kleine crimineel, Kai. Ondertussen bevrijd Zaheer de Aardestuurder Ghazan en de Waterstuurder zonder armen, Ming-Hua, uit hun zwaarbewaakte cellen. Vuurheer Zuko reist af naar de Noordpool, waar het laatste lid van Zaheers bende opgesloten zit.

Eenmaal aangekomen in de hoofdstad van het Aarderijk verslaan Korra en Asami een bende bandieten, in opdracht van de Aarde Koningin Hou-Ting, die veel geld gestolen hebben. Vervolgens beweert de Aardekoningin dat er geen Luchtstuurders in het Aarderijk zitten. Ondertussen verlaat Kai de groep om te gaan zakkenrollen. Terwijl Mako en Bolin op zoek naar Kai zijn, ontmoeten zij de familie van hun overleden vader. Ze komen erachter dat de geheime politie van de Aardekoningin, de Dai Li, alle Luchtstuurders opsluit. Kai is ook gevangengenomen en is verplicht om het leger van het Aarderijk te dienen. Ondertussen arriveren Vuurheer Zuko, de nieuwe chefs Desna en Eska en Korra's vader Tonraq de laatste gevangene van Zaheers bende, zijn vriendin P'Li, een gevaarlijke Vuurstuurder.

Op de Noordpool is P'Li, het laatste lid van Zaheers bende, bevrijd uit haar ijzige cel. Ondertussen reist Lin Beifong af naar Ba Sing Se om Korra te waarschuwen dat haar leven in gevaar is; Zaheers bende wil de Avatar doden. Lin Beifong, Jinora en Korra bevrijden de Luchtstuurders. Na het bevrijden splitsen Tenzin, Lin Beifong en Korra op. Tenzin neemt de Luchtstuurders mee naar de Noordelijke Lucht Tempel en zoeken Lin Beifong en Korra naar andere Luchtstuurders.

Team Avatar arriveert in Zaofu, een metaal stad onder leiding van Suying Beifong. Ze is Lin Beifongs halfzus en de moeder van Opal, een nieuwe Luchtstuurder. Korra begint de training met Opal maar het lukt haar niet om de breuk tussen Lin en Suyin te herstellen. In Republicasia infiltreert Zaheer op Lucht tempel eiland om Korra te vinden. Hij weet te ontsnappen na een gevecht met Kya.

Terwijl Suyin Korra probeert Metaalsturen te leren, wordt Lin geconfronteerd met het verleden: toen ze nog een jonge politiebeambte was, had ze littekens op haar gezicht opgelopen tijdens de aanhouding van haar zus Suyin. Hun moeder Toph heeft het incident 'opgelost' door Suyin weg te sturen uit Republicasia en Lin te straffen. Na een gewelddadige confrontatie maken de zussen het weer goed met elkaar. Ondertussen ontsnappen Zaheer en zijn bende aan een achtervolging met de politie nadat ze probeerde in te dringen in de verblijfplaats van de Avatar.

In de Noordelijke Luchttempel vindt Tenzin het lastig om de nieuwe Luchtstuurders te leren over de cultuur van de Luchtnomaden. Op advies van Bumi, begint hij een streng trainingsregime, wat voor meer stress en uitputting zorgt. Jinora en Kai ontdekken een kudde jonge Luchtbizons en worden ontvoerd door stropers. Met behulp van de geesten neemt Jinora contact op met de andere Luchtstuurders die met gemak de criminelen overmeesteren. Tenzin belooft Jinora na te denken over tatoeages van een Luchtmeester.

In Zaofu gaan Korra en Bolin door met hun Metaalstuurtraining en Opal vertrekt naar de Noordelijke Luchttempel. 's Nachts infiltreren Zaheer en zijn team Zaofu en nemen Korra gevangen, maar Lin en Suyin redden haar en de aanvallers trekken zich terug. De volgende dag ontdekken Korra en haar vrienden dat Suyins adviseur Aiwei Zaheer geholpen heeft, maar hij ontsnapt via een geheime tunnel. Met behulp van Suyin sluipt Team Avatar later uit Zaofu om achter de aanvallers aan te gaan.

Op weg naar Ba Sing Se, weten Korra en Asami uit hun cel te ontsnappen, maar het Luchtschip stort neer in de woestijn. Met hulp van de bemanning van het Luchtschip weten ze te ontkomen en keren terug naar de oase. In Ba Sing Se stelt de Rode Lotus voor om de gevangengenomen Mako en Bolin in te ruilen voor Korra. Nadat ze van Korra's ontsnapping horen, verslaan ze de Dai Li en Zaheer gebruikt zijn Luchtsturing om de Aardkoningin te verstikken en te doden. De Rode Lotus vernietigt de binnenste muren van Ba Sin Se en kondigt aan dat de stad aan het volk toebehoort waardoor er een chaos uitbreekt. Zaheer bevrijdt Mako en Bolin en geeft hun een boodschap voor Korra. In de oase ontmoeten Asami en Korra Tonraq, Zuko en Lin en horen ze over de revolutie.

Terwijl Ba Sing Se brandt, ontsnappen Mako en Bolin naar de Mistige Palmen Oase. Ze vertellen Korra dat Zaheer van plan is de Luchtstuurders te doden tenzij ze zich overgeeft. Nadat ze met Iroh in de geestenwereld gesproken heeft, neemt ze contact op met Tenzin, net wanneer de Rode Lotus de Tempel aanvalt. Tenzin biedt weerstand en de andere Luchtstuurders proberen te ontsnappen. Nadat de verdedigers overmeesterd zijn, gooit de Rode Lotus Bumi en Kya van de berg af en overmeesteren ze Tenzin.

Korra besluit zich over te geven aan de Rode Lotus om de Luchtstuurders te redden, maar terwijl ze dat doet, ontdekken haar vrienden dat Zaheer de gijzelaars uit de Tempel heeft weggehaald. Ghazan zet Tenzin, Asami, Mako en Bolin met lava vast en vlucht met Ming-Hua, maar Korra's vrienden ontsnappen dankzij Bolins nieuwe vermogen om lava te sturen. Onderhand vechten Lin, Suyin en de andere Metaalstuurders tegen P'Li. Suyin weet P'Li te doden door een stuk metaal om haar hoofd vast te zetten, terwijl ze op het punt staat een explosie op te wekken. Zaheer vecht tegen Korra en Tonraq, die van een klif wordt gegooid, maar gered wordt door de Metaalstuurder Kuvira. Zaheer ontsnapt met de bewusteloze Korra door zijn nieuwe vermogen om te vliegen te gebruiken.

De Rode Lotus dient Korra een metaalachtig gif toe om haar in de Avatartrance te dwingen om haar vervolgens te doden, wat de Avatarcyclus van reïncarnatie zou kunnen beëindigen. Ze overmeestert haar ontvoerders echter en vecht in de lucht tegen Zaheer. Onderhand redden haar vrienden de Luchtstuurders. Nadat Mako Ming-Hua elektrocuteert, weten ze te nauwer nood aan Ghazan te ontsnappen, die de schuilplaats van de Rode Lotus per ongeluk op zichzelf laat storten. Terwijl Korra op het punt staat aan het vergif te bezwijken, leidt Jinora de Luchtstuurders, die Zaheer uit de lucht trekken met een wervelwind. Hij wordt gevangengenomen en Suyin gebruikt Metaalsturing om het gif uit Korra te halen. Twee weken later in Republic City kijkt Korra vanuit een rolstoel toe hoe Tenzin Jinora tot Luchtmeester benoemt. Hij wijdt de Luchtnomaden opnieuw toe aan een nomadenleven in dienst van de wereld, naar Korra's voorbeeld.