Pope Alexander fights for his life; the cardinals fight for control of the papacy; Cesare and Micheletto track the assassin; Della Rovere prepares to make his move.

Alexander tasks Cardinal Sforza with purging the College of Cardinals, old Roman families conspire against the Pope, and Lucrezia tries to seduce Cesare.

The King of Naples refuses to accept Lucrzia's child as part of the marriage agreement and pointedly invites Caterins Sforza and other Borgia enemies to the wedding.

Cardinal Farnese exposes the embezzlement of Cardinal Versucci while the King of Naples insists the consummation of Lucrezia's marriage to his cousin be witnessed.

Cesare unites the sons of the five Romagna families with his own army against Forli, and the Pope negotiates for a with Constantinople Jews for a holy relic.

After the French king occupies a deserted Milan, he tasks Cesare with killing Ludivico, and Lucretia becomes involved in Neapolitan palace intrigue.

Borgian perhe on jälleen salajuonen kohteena, mutta Lucrezian tarkka huomiokyky paljastaa Cesaren ja Micheletton suunnitelmat. Rooma täyttyy juhlivista pyhiinvaeltajista. Catherina Sforza suunnittelee sabotaasia. Sarja seuraa Borgia suvun nousua roomalaiskatolisen kirkon vaikuttavaan valtaan. Rodrigo Borgia ei säästele mitään eikä ketään pyrkimyksissään.

Lucrezia escapes with Alfonso and her baby from Naples while the Pope corners the market in sulfur, restricting others from manufacturing gunpowder.

Cesare hautaa sotakirveen Alexanderin kanssa ja vannoo Lucrezian olevan ikuisesti hänen, mutta johtaa kuitenkin joukkonsa kohti Forlinia ja uutta taistoa. Lucrezia avustaa loukkaantunutta Alfonsoa. Kauden päätösjakso. Sarja seuraa Borgia suvun nousua roomalaiskatolisen kirkon vaikuttavaan valtaan. Rodrigo Borgia ei säästele mitään eikä ketään pyrkimyksissään.